RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297615.9

TTC39B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 39B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene TTC39B, Length 3,053 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39B-201ENST00000297615 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TTC39B-201ENST00000297615 ZNF536O15090 1300 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC39B-201ENST00000297615 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC39B-201ENST00000297615 CYP3A7P24462 503 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC39B-201ENST00000297615 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TTC39B-201ENST00000297615 RPS6KA1Q15418 735 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC39B-201ENST00000297615 TKFCQ3LXA3 575 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC39B-201ENST00000297615 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC39B-201ENST00000297615 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TTC39B-201ENST00000297615 TMEM143Q96AN5 459 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC39B-201ENST00000297615 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC39B-201ENST00000297615 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC39B-201ENST00000297615 RNF146Q9NTX7 359 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC39B-201ENST00000297615 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC39B-201ENST00000297615 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.71□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 NFKBIEO00221 500 aa14.71□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 ZIM3Q96PE6 472 aa14.71□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 NACC1Q96RE7 527 aa14.71□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 NR2E1Q9Y466 385 aa14.71□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 TUBBP07437 444 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 PPP3CAQ08209 521 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 CFAP58Q5T655 872 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 CEP170P1Q96L14 293 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 GANQ9H2C0 597 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 RAD51CO43502 376 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 CCNE2O96020 404 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 OSTNP61366 133 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 CDK17Q00537 523 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 GGA3Q9NZ52 723 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 ACOT2P49753 483 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 GALCP54803 685 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 NAB2Q15742 525 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 PEX26Q7Z412 305 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 RNF19AQ9NV58 838 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 NAGPAQ9UK23 515 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 KRT5P13647 590 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 FMO5P49326 533 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 GUCY1A3Q02108 690 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 EPHA7Q15375 998 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 CEP63Q96MT8 703 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 AMACRQ9UHK6 382 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 TNFAIP3P21580 790 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 STAT1P42224 750 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 EPHB4P54760 987 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 SRLQ86TD4 932 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 PASD1Q8IV76 773 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 IFT20Q8IY31 132 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 THAP2Q9H0W7 228 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 PICK1Q9NRD5 415 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 CYP26A1O43174 497 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 MYL7Q01449 175 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 NNTQ13423 1086 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 MESDQ14696 234 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 ZNF394Q53GI3 561 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 FEM1BQ9UK73 627 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC39B-201ENST00000297615 KRIT1O00522 736 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms