RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 GOPCQ9HD26 462 aa16.17■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 COG5Q9UP83 839 aa16.17■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa16.17■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 FAM187AA6NFU0 413 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 C6orf229H3BNL8 230 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 CHN1P15882 459 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 NMT1P30419 496 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 SNAP25P60880 206 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 XRCC4Q13426 336 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 SNCBQ16143 134 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 RINT1Q6NUQ1 792 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 PALB2Q86YC2 1186 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 JAMLQ86YT9 394 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 CERS5Q8N5B7 392 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 P3H4Q92791 437 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 HVCN1Q96D96 273 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 FAM20AQ96MK3 541 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 RGL1Q9NZL6 768 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 SNX24Q9Y343 169 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 FRMPD4Q14CM0 1322 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 EML1O00423 815 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 GHRP10912 638 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 PLTPP55058 493 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 COG2Q14746 738 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 CBWD6Q4V339 395 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 CBWD3Q5JTY5 395 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 CBWD5Q5RIA9 395 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 NEK9Q8TD19 979 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 ADAM7Q9H2U9 754 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 STK24Q9Y6E0 443 aa16.16■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 VCAM1P19320 739 aa16.15■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 SREBF1P36956 1147 aa16.15■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 MMP13P45452 471 aa16.15■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 NFIL3Q16649 462 aa16.15■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 WLSQ5T9L3 541 aa16.15■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 SLFN13Q68D06 897 aa16.15■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 AADACL2Q6P093 401 aa16.15■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16.15■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 FBXO25Q8TCJ0 367 aa16.15■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 PGM2Q96G03 612 aa16.15■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.15■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 MMEP08473 750 aa16.14■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 CCDC172P0C7W6 258 aa16.14■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 EEF2P13639 858 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 GAP43P17677 238 aa16.14■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 DRG2P55039 364 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 MAPK7Q13164 816 aa16.14■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 DENND2CQ68D51 928 aa16.14■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 KSR1Q8IVT5 923 aa16.14■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 DCAF4Q8WV16 495 aa16.14■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.14■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 DNAJC18Q9H819 358 aa16.14■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 RPTORQ8N122 1335 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 ANKRD62A6NC57 917 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 HLA-DOAP06340 250 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 TNFAIP3P21580 790 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 PTGIRP43119 386 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 RPAINQ86UA6 219 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 MYCT1Q8N699 235 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 CCDC197Q8NCU1 140 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 PIGOQ8TEQ8 1089 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 C18orf8Q96DM3 657 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 AZI2Q9H6S1 392 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 GRHL1Q9NZI5 618 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 MCM8Q9UJA3 840 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa16.14■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 TLDC2A0PJX2 215 aa16.13■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 CCT8L1PA6NM43 557 aa16.13■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 CCDC169A6NNP5 214 aa16.13■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 OPLAHO14841 1288 aa16.13■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 RIMBP2O15034 1052 aa16.13■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 PPIP5K2O43314 1243 aa16.13■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 FAM13AO94988 1023 aa16.13■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 TRIM49P0CI25 452 aa16.13■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 TRIM49CP0CI26 452 aa16.13■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 CIITAP33076 1130 aa16.13■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 SLC29A2Q14542 456 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms