RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627542.2

PCBP1-AS1-318, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 702 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 KIF3BO15066 747 aa13.86□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.85□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 GGT6Q6P531 493 aa13.84□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.84□□□□□ -0.19
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 DEPDC5O75140 1603 aa13.83□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PTPRKQ15262 1439 aa13.83□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.83□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.82□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 C3P01024 1663 aa13.82□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.8□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ZMYM3Q14202 1370 aa13.8□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 KANK1Q14678 1352 aa13.8□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.79□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NPATQ14207 1427 aa13.79□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ITGAEP38570 1179 aa13.78□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.78□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PREX1Q8TCU6 1659 aa13.78□□□□□ -0.2
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ABCC3O15438 1527 aa13.77□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.76□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CEP152O94986 1710 aa13.76□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 UNC13BO14795 1591 aa13.75□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.75□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PZPP20742 1482 aa13.75□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 HFM1A2PYH4 1435 aa13.75□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa13.75□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa13.74□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NAIPQ13075 1403 aa13.73□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa13.72□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TET3O43151 1660 aa13.71□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.71□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.7□□□□□ -0.223e-8■■□□□ 13.5
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 LMTK3Q96Q04 1460 aa13.69□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PLPPR3Q6T4P5 718 aa13.69□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.69□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.69□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.68□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NUP155O75694 1391 aa13.67□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TNRQ92752 1358 aa13.67□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NLRP1Q9C000 1473 aa13.67□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ERVK-7P63135 1459 aa13.66□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.64□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SETD5Q9C0A6 1442 aa13.63□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 E9PCH4 1651 aa13.62□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 HRCP23327 699 aa13.61□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NOS1P29475 1434 aa13.61□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.6□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PLA2R1Q13018 1463 aa13.6□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.58□□□□□ -0.23
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TRIM52Q96A61 297 aa13.58□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.58□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa13.57□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.57□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SYNMO15061 1565 aa13.57□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 HSPA2P54652 639 aa13.56□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PIK3C2BO00750 1634 aa13.56□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 STRCQ7RTU9 1775 aa13.55□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PKD2Q13563 968 aa13.55□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa13.55□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PTPRTO14522 1441 aa13.55□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 IDI1Q13907 227 aa13.52□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.52□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ADGRB3O60242 1522 aa13.52□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TRPM2O94759 1503 aa13.52□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SLIT1O75093 1534 aa13.51□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 MPHOSPH9Q99550 1183 aa13.51□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.5□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 KIF1BO60333 1816 aa13.5□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa13.5□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ARHGAP23Q9P227 1491 aa13.49□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 MED14O60244 1454 aa13.48□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 MYO5BQ9ULV0 1848 aa13.48□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.47□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 EID1Q9Y6B2 187 aa13.47□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CLTCL1P53675 1640 aa13.45□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NEURL4Q96JN8 1562 aa13.45□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.44□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 IQGAP1P46940 1657 aa13.44□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CCDC144AA2RUR9 1427 aa13.43□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.43□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ZFYVE9O95405 1425 aa13.41□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms