RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616614.4

FMR1-216, Transcript of fragile X mental retardation 1, humanhuman

TSL 5

Gene FMR1, Length 1,409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1-216ENST00000616614 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP48.36■■■■■ 5.33
FMR1-216ENST00000616614 PPP6R1Q9UPN7 881 aa48.36■■■■■ 5.33
FMR1-216ENST00000616614 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP48.35■■■■■ 5.33
FMR1-216ENST00000616614 CNTLNQ9NXG0 1405 aa48.31■■■■■ 5.32
FMR1-216ENST00000616614 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa48.31■■■■■ 5.32
FMR1-216ENST00000616614 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP48.31■■■■■ 5.32
FMR1-216ENST00000616614 MROH1Q8NDA8 1641 aa48.29■■■■■ 5.32
FMR1-216ENST00000616614 ZMYM3Q14202 1370 aa48.25■■■■■ 5.31
FMR1-216ENST00000616614 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP48.23■■■■■ 5.31
FMR1-216ENST00000616614 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa48.23■■■■■ 5.31
FMR1-216ENST00000616614 KDM5DQ9BY66 1539 aa48.19■■■■■ 5.3
FMR1-216ENST00000616614 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP48.18■■■■■ 5.37e-7■■□□□ 12.3
FMR1-216ENST00000616614 C3P01024 1663 aa48.15■■■■■ 5.3
FMR1-216ENST00000616614 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP48.15■■■■■ 5.3
FMR1-216ENST00000616614 DEPDC5O75140 1603 aa48.14■■■■■ 5.3
FMR1-216ENST00000616614 MROH2AA6NES4 1674 aa48.14■■■■■ 5.3
FMR1-216ENST00000616614 FAM135AQ9P2D6 1515 aa48.14■■■■■ 5.3
FMR1-216ENST00000616614 NAIPQ13075 1403 aa48.14■■■■■ 5.3
FMR1-216ENST00000616614 ABCC3O15438 1527 aa48.13■■■■■ 5.3
FMR1-216ENST00000616614 HFM1A2PYH4 1435 aa48.07■■■■■ 5.28
FMR1-216ENST00000616614 VWDEQ8N2E2 1590 aa48.02■■■■■ 5.28
FMR1-216ENST00000616614 KANK1Q14678 1352 aa48■■■■■ 5.28
FMR1-216ENST00000616614 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP47.99■■■■■ 5.27
FMR1-216ENST00000616614 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP47.98■■■■■ 5.27
FMR1-216ENST00000616614 CEP152O94986 1710 aa47.97■■■■■ 5.27
FMR1-216ENST00000616614 GCC2Q8IWJ2 1684 aa47.95■■■■■ 5.27
FMR1-216ENST00000616614 PZPP20742 1482 aa47.95■■■■■ 5.27
FMR1-216ENST00000616614 UNC13BO14795 1591 aa47.95■■■■■ 5.27
FMR1-216ENST00000616614 NPATQ14207 1427 aa47.94■■■■■ 5.26
FMR1-216ENST00000616614 LMTK2Q8IWU2 1503 aa47.91■■■■■ 5.26
FMR1-216ENST00000616614 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa47.89■■■■■ 5.26
FMR1-216ENST00000616614 LMTK3Q96Q04 1460 aa47.87■■■■■ 5.25
FMR1-216ENST00000616614 NUP155O75694 1391 aa47.86■■■■■ 5.25
FMR1-216ENST00000616614 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa47.85■■■■■ 5.25
FMR1-216ENST00000616614 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa47.77■■■■■ 5.24
FMR1-216ENST00000616614 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP47.76■■■■■ 5.24
FMR1-216ENST00000616614 PREX1Q8TCU6 1659 aa47.76■■■■■ 5.24
FMR1-216ENST00000616614 TNRQ92752 1358 aa47.76■■■■■ 5.24
FMR1-216ENST00000616614 EFCAB6Q5THR3 1501 aa47.75■■■■■ 5.23
FMR1-216ENST00000616614 IQGAP3Q86VI3 1631 aa47.74■■■■■ 5.23
FMR1-216ENST00000616614 ERVK-7P63135 1459 aa47.74■■■■■ 5.23
FMR1-216ENST00000616614 HSPA2P54652 639 aa47.73■■■■■ 5.23
FMR1-216ENST00000616614 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa47.72■■■■■ 5.23
FMR1-216ENST00000616614 SETD5Q9C0A6 1442 aa47.71■■■■■ 5.23
FMR1-216ENST00000616614 TET3O43151 1660 aa47.67■■■■■ 5.22
FMR1-216ENST00000616614 TRIM52Q96A61 297 aa47.67■■■■■ 5.22
FMR1-216ENST00000616614 MYO3AQ8NEV4 1616 aa47.65■■■■■ 5.22
FMR1-216ENST00000616614 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa47.6■■■■■ 5.21
FMR1-216ENST00000616614 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP47.59■■■■■ 5.21
FMR1-216ENST00000616614 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP47.59■■■■■ 5.21
FMR1-216ENST00000616614 NOS1P29475 1434 aa47.58■■■■■ 5.21
FMR1-216ENST00000616614 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP47.55■■■■■ 5.2
FMR1-216ENST00000616614 E9PCH4 1651 aa47.55■■■■■ 5.2
FMR1-216ENST00000616614 A2ML1A8K2U0 1454 aa47.54■■■■■ 5.2
FMR1-216ENST00000616614 NLRP1Q9C000 1473 aa47.53■■■■■ 5.2
FMR1-216ENST00000616614 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP47.5■■■■■ 5.19
FMR1-216ENST00000616614 SYNMO15061 1565 aa47.49■■■■■ 5.19
FMR1-216ENST00000616614 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP47.47■■■■■ 5.19
FMR1-216ENST00000616614 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP47.45■■■■■ 5.19
FMR1-216ENST00000616614 IDI1Q13907 227 aa47.44■■■■■ 5.18
FMR1-216ENST00000616614 PKD2Q13563 968 aa47.43■■■■■ 5.18
FMR1-216ENST00000616614 MPHOSPH9Q99550 1183 aa47.39■■■■■ 5.18
FMR1-216ENST00000616614 UGGT1Q9NYU2 1555 aa47.37■■■■■ 5.17
FMR1-216ENST00000616614 HRCP23327 699 aa47.36■■■■■ 5.17
FMR1-216ENST00000616614 SLC52A1Q9NWF4 448 aa47.35■■■■■ 5.17
FMR1-216ENST00000616614 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP47.34■■■■■ 5.17
FMR1-216ENST00000616614 PTPRTO14522 1441 aa47.34■■■■■ 5.17
FMR1-216ENST00000616614 FOXD1Q16676 465 aa47.31■■■■■ 5.16
FMR1-216ENST00000616614 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP47.3■■■■■ 5.16
FMR1-216ENST00000616614 PIK3C2BO00750 1634 aa47.3■■■■■ 5.16
FMR1-216ENST00000616614 PLA2R1Q13018 1463 aa47.27■■■■■ 5.16
FMR1-216ENST00000616614 STRCQ7RTU9 1775 aa47.24■■■■■ 5.15
FMR1-216ENST00000616614 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa47.24■■■■■ 5.15
FMR1-216ENST00000616614 UBR1Q8IWV7 1749 aa47.24■■■■■ 5.15
FMR1-216ENST00000616614 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa47.2■■■■■ 5.15
FMR1-216ENST00000616614 STAG3Q9UJ98 1225 aa47.2■■■■■ 5.15
FMR1-216ENST00000616614 ADGRB3O60242 1522 aa47.15■■■■■ 5.14
FMR1-216ENST00000616614 TRPM2O94759 1503 aa47.15■■■■■ 5.14
FMR1-216ENST00000616614 ANKLE2Q86XL3 938 aa47.1■■■■■ 5.13
FMR1-216ENST00000616614 ARHGAP23Q9P227 1491 aa47.09■■■■■ 5.13
FMR1-216ENST00000616614 CHGAP10645 457 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
FMR1-216ENST00000616614 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
FMR1-216ENST00000616614 TMEM2Q9UHN6 1383 aa47.08■■■■■ 5.13
FMR1-216ENST00000616614 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa47.08■■■■■ 5.13
FMR1-216ENST00000616614 SLIT1O75093 1534 aa47.08■■■■■ 5.13
FMR1-216ENST00000616614 CLTCL1P53675 1640 aa47.07■■■■■ 5.13
FMR1-216ENST00000616614 LTKP29376 864 aa47.05■■■■■ 5.12
FMR1-216ENST00000616614 DMRT2Q9Y5R5 561 aa47.03■■■■■ 5.12
FMR1-216ENST00000616614 NEURL4Q96JN8 1562 aa47.02■■■■■ 5.12
FMR1-216ENST00000616614 TXNDC2Q86VQ3 553 aa47■■■■■ 5.11
FMR1-216ENST00000616614 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP46.95■■■■■ 5.11
FMR1-216ENST00000616614 MYO5BQ9ULV0 1848 aa46.94■■■■■ 5.11
FMR1-216ENST00000616614 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP46.93■■■■■ 5.1
FMR1-216ENST00000616614 MED14O60244 1454 aa46.93■■■■■ 5.1
FMR1-216ENST00000616614 EID1Q9Y6B2 187 aa46.93■■■■■ 5.1
FMR1-216ENST00000616614 ZFYVE9O95405 1425 aa46.93■■■■■ 5.1
FMR1-216ENST00000616614 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP46.9■■■■■ 5.1
FMR1-216ENST00000616614 CCDC144AA2RUR9 1427 aa46.9■■■■■ 5.1
FMR1-216ENST00000616614 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa46.89■■■■■ 5.1
FMR1-216ENST00000616614 RIMS2Q9UQ26 1411 aa46.89■■■■■ 5.1
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