RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604499.6

PGPEP1-209, Transcript of pyroglutamyl-peptidase I, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PGPEP1, Length 769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1-209ENST00000604499 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.28■■□□□ 1.64
PGPEP1-209ENST00000604499 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PGPEP1-209ENST00000604499 UNC13BO14795 1591 aa25.27■■□□□ 1.64
PGPEP1-209ENST00000604499 GGT6Q6P531 493 aa25.25■■□□□ 1.63
PGPEP1-209ENST00000604499 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PGPEP1-209ENST00000604499 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PGPEP1-209ENST00000604499 MLECQ14165 292 aa25.22■■□□□ 1.63
PGPEP1-209ENST00000604499 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
PGPEP1-209ENST00000604499 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.22■■□□□ 1.63
PGPEP1-209ENST00000604499 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.22■■□□□ 1.63
PGPEP1-209ENST00000604499 NUP155O75694 1391 aa25.21■■□□□ 1.63
PGPEP1-209ENST00000604499 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.2■■□□□ 1.62
PGPEP1-209ENST00000604499 TRIM52Q96A61 297 aa25.19■■□□□ 1.62
PGPEP1-209ENST00000604499 KANK1Q14678 1352 aa25.18■■□□□ 1.62
PGPEP1-209ENST00000604499 PZPP20742 1482 aa25.16■■□□□ 1.62
PGPEP1-209ENST00000604499 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.16■■□□□ 1.62
PGPEP1-209ENST00000604499 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.16■■□□□ 1.62
PGPEP1-209ENST00000604499 ABCC3O15438 1527 aa25.15■■□□□ 1.62
PGPEP1-209ENST00000604499 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.15■■□□□ 1.62
PGPEP1-209ENST00000604499 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.13■■□□□ 1.61
PGPEP1-209ENST00000604499 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.11■■□□□ 1.61
PGPEP1-209ENST00000604499 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.1■■□□□ 1.61
PGPEP1-209ENST00000604499 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PGPEP1-209ENST00000604499 CEP152O94986 1710 aa25.09■■□□□ 1.61
PGPEP1-209ENST00000604499 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PGPEP1-209ENST00000604499 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.07■■□□□ 1.6
PGPEP1-209ENST00000604499 TET3O43151 1660 aa25.06■■□□□ 1.6
PGPEP1-209ENST00000604499 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PGPEP1-209ENST00000604499 MADDQ8WXG6 1647 aa25.05■■□□□ 1.6
PGPEP1-209ENST00000604499 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PGPEP1-209ENST00000604499 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PGPEP1-209ENST00000604499 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.04■■□□□ 1.6
PGPEP1-209ENST00000604499 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.04■■□□□ 1.6
PGPEP1-209ENST00000604499 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.04■■□□□ 1.6
PGPEP1-209ENST00000604499 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.03■■□□□ 1.6
PGPEP1-209ENST00000604499 PKD2Q13563 968 aa25.03■■□□□ 1.6
PGPEP1-209ENST00000604499 ZMYM3Q14202 1370 aa25.02■■□□□ 1.6
PGPEP1-209ENST00000604499 NPATQ14207 1427 aa25.02■■□□□ 1.6
PGPEP1-209ENST00000604499 MROH2AA6NES4 1674 aa25.01■■□□□ 1.59
PGPEP1-209ENST00000604499 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.99■■□□□ 1.59
PGPEP1-209ENST00000604499 E9PCH4 1651 aa24.99■■□□□ 1.59
PGPEP1-209ENST00000604499 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PGPEP1-209ENST00000604499 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PGPEP1-209ENST00000604499 FOXD1Q16676 465 aa24.97■■□□□ 1.59
PGPEP1-209ENST00000604499 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PGPEP1-209ENST00000604499 C3P01024 1663 aa24.92■■□□□ 1.58
PGPEP1-209ENST00000604499 PTPRMP28827 1452 aa24.92■■□□□ 1.58
PGPEP1-209ENST00000604499 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PGPEP1-209ENST00000604499 PTPRTO14522 1441 aa24.92■■□□□ 1.58
PGPEP1-209ENST00000604499 NOS1P29475 1434 aa24.92■■□□□ 1.58
PGPEP1-209ENST00000604499 PLA2R1Q13018 1463 aa24.91■■□□□ 1.58
PGPEP1-209ENST00000604499 ERVK-7P63135 1459 aa24.9■■□□□ 1.58
PGPEP1-209ENST00000604499 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.89■■□□□ 1.57
PGPEP1-209ENST00000604499 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.88■■□□□ 1.57
PGPEP1-209ENST00000604499 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.88■■□□□ 1.57
PGPEP1-209ENST00000604499 SYNMO15061 1565 aa24.84■■□□□ 1.57
PGPEP1-209ENST00000604499 TRPM2O94759 1503 aa24.84■■□□□ 1.57
PGPEP1-209ENST00000604499 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.83■■□□□ 1.57
PGPEP1-209ENST00000604499 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.82■■□□□ 1.56
PGPEP1-209ENST00000604499 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PGPEP1-209ENST00000604499 TNRQ92752 1358 aa24.81■■□□□ 1.56
PGPEP1-209ENST00000604499 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PGPEP1-209ENST00000604499 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.8■■□□□ 1.56
PGPEP1-209ENST00000604499 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.78■■□□□ 1.56
PGPEP1-209ENST00000604499 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.77■■□□□ 1.56
PGPEP1-209ENST00000604499 PIK3C2BO00750 1634 aa24.76■■□□□ 1.55
PGPEP1-209ENST00000604499 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.76■■□□□ 1.55
PGPEP1-209ENST00000604499 CLTCL1P53675 1640 aa24.75■■□□□ 1.55
PGPEP1-209ENST00000604499 IDI1Q13907 227 aa24.75■■□□□ 1.55
PGPEP1-209ENST00000604499 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.75■■□□□ 1.55
PGPEP1-209ENST00000604499 NLRP1Q9C000 1473 aa24.72■■□□□ 1.55
PGPEP1-209ENST00000604499 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.68■■□□□ 1.54
PGPEP1-209ENST00000604499 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.66■■□□□ 1.54
PGPEP1-209ENST00000604499 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PGPEP1-209ENST00000604499 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.66■■□□□ 1.54
PGPEP1-209ENST00000604499 NEUROD1Q13562 356 aa24.65■■□□□ 1.54
PGPEP1-209ENST00000604499 ADGRB3O60242 1522 aa24.64■■□□□ 1.53
PGPEP1-209ENST00000604499 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.64■■□□□ 1.53
PGPEP1-209ENST00000604499 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.63■■□□□ 1.53
PGPEP1-209ENST00000604499 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PGPEP1-209ENST00000604499 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.62■■□□□ 1.53
PGPEP1-209ENST00000604499 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PGPEP1-209ENST00000604499 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PGPEP1-209ENST00000604499 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PGPEP1-209ENST00000604499 KIF1BO60333 1816 aa24.59■■□□□ 1.53
PGPEP1-209ENST00000604499 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.59■■□□□ 1.53
PGPEP1-209ENST00000604499 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.58■■□□□ 1.53
PGPEP1-209ENST00000604499 RGL3Q3MIN7 710 aa24.56■■□□□ 1.52
PGPEP1-209ENST00000604499 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PGPEP1-209ENST00000604499 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.53■■□□□ 1.52
PGPEP1-209ENST00000604499 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.53■■□□□ 1.52
PGPEP1-209ENST00000604499 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PGPEP1-209ENST00000604499 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.52■■□□□ 1.52
PGPEP1-209ENST00000604499 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.52■■□□□ 1.52
PGPEP1-209ENST00000604499 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.52■■□□□ 1.52
PGPEP1-209ENST00000604499 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.51■■□□□ 1.51
PGPEP1-209ENST00000604499 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.51■■□□□ 1.51
PGPEP1-209ENST00000604499 TONSLQ96HA7 1378 aa24.51■■□□□ 1.51
PGPEP1-209ENST00000604499 SLIT1O75093 1534 aa24.51■■□□□ 1.51
PGPEP1-209ENST00000604499 ZFYVE9O95405 1425 aa24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms