RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598020.3

PNKP-211, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 3

Gene PNKP, Length 534 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-211ENST00000598020 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.81■■■□□ 2.52
PNKP-211ENST00000598020 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.81■■■□□ 2.52
PNKP-211ENST00000598020 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.81■■■□□ 2.52
PNKP-211ENST00000598020 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
PNKP-211ENST00000598020 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.75■■■□□ 2.51
PNKP-211ENST00000598020 DEPDC5O75140 1603 aa30.74■■■□□ 2.51
PNKP-211ENST00000598020 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
PNKP-211ENST00000598020 MROH2AA6NES4 1674 aa30.74■■■□□ 2.51
PNKP-211ENST00000598020 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
PNKP-211ENST00000598020 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.71■■■□□ 2.51
PNKP-211ENST00000598020 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
PNKP-211ENST00000598020 HFM1A2PYH4 1435 aa30.7■■■□□ 2.5
PNKP-211ENST00000598020 NAIPQ13075 1403 aa30.7■■■□□ 2.5
PNKP-211ENST00000598020 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.69■■■□□ 2.5
PNKP-211ENST00000598020 ZMYM3Q14202 1370 aa30.67■■■□□ 2.5
PNKP-211ENST00000598020 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
PNKP-211ENST00000598020 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.67■■■□□ 2.5
PNKP-211ENST00000598020 C3P01024 1663 aa30.65■■■□□ 2.5
PNKP-211ENST00000598020 ABCC3O15438 1527 aa30.65■■■□□ 2.5
PNKP-211ENST00000598020 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.64■■■□□ 2.5
PNKP-211ENST00000598020 KANK1Q14678 1352 aa30.63■■■□□ 2.49
PNKP-211ENST00000598020 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
PNKP-211ENST00000598020 UNC13BO14795 1591 aa30.62■■■□□ 2.49
PNKP-211ENST00000598020 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.6■■■□□ 2.49
PNKP-211ENST00000598020 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.58■■■□□ 2.49
PNKP-211ENST00000598020 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
PNKP-211ENST00000598020 CEP152O94986 1710 aa30.57■■■□□ 2.48
PNKP-211ENST00000598020 NPATQ14207 1427 aa30.56■■■□□ 2.48
PNKP-211ENST00000598020 PZPP20742 1482 aa30.55■■■□□ 2.48
PNKP-211ENST00000598020 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.54■■■□□ 2.48
PNKP-211ENST00000598020 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.54■■■□□ 2.48
PNKP-211ENST00000598020 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.53■■■□□ 2.48
PNKP-211ENST00000598020 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.49■■■□□ 2.47
PNKP-211ENST00000598020 NUP155O75694 1391 aa30.49■■■□□ 2.47
PNKP-211ENST00000598020 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.47■■■□□ 2.47
PNKP-211ENST00000598020 TET3O43151 1660 aa30.46■■■□□ 2.47
PNKP-211ENST00000598020 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.45■■■□□ 2.47
PNKP-211ENST00000598020 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
PNKP-211ENST00000598020 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.43■■■□□ 2.46
PNKP-211ENST00000598020 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
PNKP-211ENST00000598020 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.41■■■□□ 2.46
PNKP-211ENST00000598020 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
PNKP-211ENST00000598020 ERVK-7P63135 1459 aa30.4■■■□□ 2.46
PNKP-211ENST00000598020 TNRQ92752 1358 aa30.39■■■□□ 2.45
PNKP-211ENST00000598020 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.39■■■□□ 2.45
PNKP-211ENST00000598020 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.38■■■□□ 2.45
PNKP-211ENST00000598020 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
PNKP-211ENST00000598020 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PNKP-211ENST00000598020 HRCP23327 699 aa30.35■■■□□ 2.45
PNKP-211ENST00000598020 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.34■■■□□ 2.45
PNKP-211ENST00000598020 TRIM52Q96A61 297 aa30.34■■■□□ 2.45
PNKP-211ENST00000598020 E9PCH4 1651 aa30.33■■■□□ 2.45
PNKP-211ENST00000598020 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.33■■■□□ 2.45
PNKP-211ENST00000598020 NOS1P29475 1434 aa30.32■■■□□ 2.44
PNKP-211ENST00000598020 NLRP1Q9C000 1473 aa30.31■■■□□ 2.44
PNKP-211ENST00000598020 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
PNKP-211ENST00000598020 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.27■■■□□ 2.44
PNKP-211ENST00000598020 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
PNKP-211ENST00000598020 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
PNKP-211ENST00000598020 SYNMO15061 1565 aa30.24■■■□□ 2.43
PNKP-211ENST00000598020 PKD2Q13563 968 aa30.2■■■□□ 2.43
PNKP-211ENST00000598020 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.2■■■□□ 2.43
PNKP-211ENST00000598020 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.2■■■□□ 2.43
PNKP-211ENST00000598020 PTPRTO14522 1441 aa30.2■■■□□ 2.42
PNKP-211ENST00000598020 HSPA2P54652 639 aa30.19■■■□□ 2.42
PNKP-211ENST00000598020 IDI1Q13907 227 aa30.16■■■□□ 2.42
PNKP-211ENST00000598020 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.15■■■□□ 2.42
PNKP-211ENST00000598020 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.15■■■□□ 2.42
PNKP-211ENST00000598020 PIK3C2BO00750 1634 aa30.14■■■□□ 2.42
PNKP-211ENST00000598020 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
PNKP-211ENST00000598020 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
PNKP-211ENST00000598020 PLA2R1Q13018 1463 aa30.12■■■□□ 2.41
PNKP-211ENST00000598020 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.11■■■□□ 2.41
PNKP-211ENST00000598020 TRPM2O94759 1503 aa30.09■■■□□ 2.41
PNKP-211ENST00000598020 ADGRB3O60242 1522 aa30.05■■■□□ 2.4
PNKP-211ENST00000598020 STRCQ7RTU9 1775 aa30.04■■■□□ 2.4
PNKP-211ENST00000598020 FOXD1Q16676 465 aa30.02■■■□□ 2.4
PNKP-211ENST00000598020 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.02■■■□□ 2.4
PNKP-211ENST00000598020 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.01■■■□□ 2.39
PNKP-211ENST00000598020 SLIT1O75093 1534 aa30.01■■■□□ 2.39
PNKP-211ENST00000598020 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30■■■□□ 2.39
PNKP-211ENST00000598020 CLTCL1P53675 1640 aa30■■■□□ 2.39
PNKP-211ENST00000598020 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.97■■■□□ 2.39
PNKP-211ENST00000598020 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.96■■■□□ 2.39
PNKP-211ENST00000598020 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.95■■■□□ 2.39
PNKP-211ENST00000598020 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.94■■■□□ 2.38
PNKP-211ENST00000598020 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.94■■■□□ 2.38
PNKP-211ENST00000598020 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
PNKP-211ENST00000598020 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.92■■■□□ 2.38
PNKP-211ENST00000598020 KIF1BO60333 1816 aa29.92■■■□□ 2.38
PNKP-211ENST00000598020 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.91■■■□□ 2.38
PNKP-211ENST00000598020 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
PNKP-211ENST00000598020 MED14O60244 1454 aa29.9■■■□□ 2.38
PNKP-211ENST00000598020 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.9■■■□□ 2.38
PNKP-211ENST00000598020 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.89■■■□□ 2.38
PNKP-211ENST00000598020 ZFYVE9O95405 1425 aa29.88■■■□□ 2.37
PNKP-211ENST00000598020 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
PNKP-211ENST00000598020 LTKP29376 864 aa29.88■■■□□ 2.37
PNKP-211ENST00000598020 EID1Q9Y6B2 187 aa29.88■■■□□ 2.37
PNKP-211ENST00000598020 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.87■■■□□ 2.37
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