RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590198.1

ROGDI-212, Transcript of rogdi homolog, humanhuman

TSL 3

Gene ROGDI, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROGDI-212ENST00000590198 ERBINQ96RT1 1412 aa46.64■■■■■ 5.06
ROGDI-212ENST00000590198 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP46.64■■■■■ 5.06
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ROGDI-212ENST00000590198 ROCK1Q13464 1354 aa46.6■■■■■ 5.05
ROGDI-212ENST00000590198 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
ROGDI-212ENST00000590198 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
ROGDI-212ENST00000590198 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa46.54■■■■■ 5.04
ROGDI-212ENST00000590198 ZMYM3Q14202 1370 aa46.52■■■■■ 5.04
ROGDI-212ENST00000590198 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa46.51■■■■■ 5.04
ROGDI-212ENST00000590198 MROH2AA6NES4 1674 aa46.48■■■■■ 5.03
ROGDI-212ENST00000590198 C3P01024 1663 aa46.48■■■■■ 5.03
ROGDI-212ENST00000590198 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP46.47■■■■■ 5.03
ROGDI-212ENST00000590198 KDM5DQ9BY66 1539 aa46.47■■■■■ 5.03
ROGDI-212ENST00000590198 MROH1Q8NDA8 1641 aa46.44■■■■■ 5.03
ROGDI-212ENST00000590198 FAM135AQ9P2D6 1515 aa46.44■■■■■ 5.02
ROGDI-212ENST00000590198 ABCC3O15438 1527 aa46.35■■■■■ 5.01
ROGDI-212ENST00000590198 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP46.35■■■■■ 5.01
ROGDI-212ENST00000590198 DEPDC5O75140 1603 aa46.35■■■■■ 5.01
ROGDI-212ENST00000590198 KANK1Q14678 1352 aa46.35■■■■■ 5.01
ROGDI-212ENST00000590198 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP46.3■■■■■ 5
ROGDI-212ENST00000590198 CEP152O94986 1710 aa46.27■■■■■ 5
ROGDI-212ENST00000590198 NPATQ14207 1427 aa46.26■■■■■ 5
ROGDI-212ENST00000590198 NAIPQ13075 1403 aa46.24■■■■■ 4.99
ROGDI-212ENST00000590198 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP46.23■■■■■ 4.99
ROGDI-212ENST00000590198 PZPP20742 1482 aa46.22■■■■■ 4.99
ROGDI-212ENST00000590198 LMTK3Q96Q04 1460 aa46.19■■■■■ 4.99
ROGDI-212ENST00000590198 VWDEQ8N2E2 1590 aa46.19■■■■■ 4.99
ROGDI-212ENST00000590198 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP46.19■■■■■ 4.98
ROGDI-212ENST00000590198 HFM1A2PYH4 1435 aa46.19■■■■■ 4.98
ROGDI-212ENST00000590198 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa46.17■■■■■ 4.98
ROGDI-212ENST00000590198 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa46.17■■■■■ 4.98
ROGDI-212ENST00000590198 PREX1Q8TCU6 1659 aa46.17■■■■■ 4.98
ROGDI-212ENST00000590198 GCC2Q8IWJ2 1684 aa46.15■■■■■ 4.98
ROGDI-212ENST00000590198 UNC13BO14795 1591 aa46.15■■■■■ 4.98
ROGDI-212ENST00000590198 LMTK2Q8IWU2 1503 aa46.13■■■■■ 4.97
ROGDI-212ENST00000590198 NUP155O75694 1391 aa46.09■■■■■ 4.97
ROGDI-212ENST00000590198 TNRQ92752 1358 aa46.09■■■■■ 4.97
ROGDI-212ENST00000590198 HSPA2P54652 639 aa46.08■■■■■ 4.97
ROGDI-212ENST00000590198 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa46.08■■■■■ 4.97
ROGDI-212ENST00000590198 ERVK-7P63135 1459 aa46.01■■■■■ 4.96
ROGDI-212ENST00000590198 MYO3AQ8NEV4 1616 aa45.99■■■■■ 4.95
ROGDI-212ENST00000590198 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP45.99■■■■■ 4.95
ROGDI-212ENST00000590198 EFCAB6Q5THR3 1501 aa45.98■■■■■ 4.95
ROGDI-212ENST00000590198 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa45.98■■■■■ 4.95
ROGDI-212ENST00000590198 IQGAP3Q86VI3 1631 aa45.96■■■■■ 4.95
ROGDI-212ENST00000590198 TRIM52Q96A61 297 aa45.95■■■■■ 4.95
ROGDI-212ENST00000590198 TET3O43151 1660 aa45.95■■■■■ 4.95
ROGDI-212ENST00000590198 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP45.88■■■■■ 4.94
ROGDI-212ENST00000590198 A2ML1A8K2U0 1454 aa45.87■■■■■ 4.93
ROGDI-212ENST00000590198 SETD5Q9C0A6 1442 aa45.87■■■■■ 4.93
ROGDI-212ENST00000590198 NLRP1Q9C000 1473 aa45.86■■■■■ 4.93
ROGDI-212ENST00000590198 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP45.85■■■■■ 4.93
ROGDI-212ENST00000590198 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP45.85■■■■■ 4.93
ROGDI-212ENST00000590198 NOS1P29475 1434 aa45.79■■■■■ 4.92
ROGDI-212ENST00000590198 E9PCH4 1651 aa45.79■■■■■ 4.92
ROGDI-212ENST00000590198 SYNMO15061 1565 aa45.72■■■■■ 4.91
ROGDI-212ENST00000590198 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa45.71■■■■■ 4.91
ROGDI-212ENST00000590198 UGGT1Q9NYU2 1555 aa45.71■■■■■ 4.91
ROGDI-212ENST00000590198 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP45.71■■■■■ 4.91
ROGDI-212ENST00000590198 IDI1Q13907 227 aa45.69■■■■■ 4.9
ROGDI-212ENST00000590198 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP45.69■■■■■ 4.9
ROGDI-212ENST00000590198 SLC52A1Q9NWF4 448 aa45.66■■■■■ 4.9
ROGDI-212ENST00000590198 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP45.66■■■■■ 4.9
ROGDI-212ENST00000590198 PKD2Q13563 968 aa45.65■■■■■ 4.9
ROGDI-212ENST00000590198 STAG3Q9UJ98 1225 aa45.63■■■■■ 4.9
ROGDI-212ENST00000590198 STRCQ7RTU9 1775 aa45.61■■■■■ 4.89
ROGDI-212ENST00000590198 PLA2R1Q13018 1463 aa45.61■■■■■ 4.89
ROGDI-212ENST00000590198 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa45.6■■■■■ 4.89
ROGDI-212ENST00000590198 PIK3C2BO00750 1634 aa45.59■■■■■ 4.89
ROGDI-212ENST00000590198 MPHOSPH9Q99550 1183 aa45.57■■■■■ 4.89
ROGDI-212ENST00000590198 UBR1Q8IWV7 1749 aa45.56■■■■■ 4.88
ROGDI-212ENST00000590198 DMRT2Q9Y5R5 561 aa45.54■■■■■ 4.88
ROGDI-212ENST00000590198 PTPRTO14522 1441 aa45.52■■■■■ 4.88
ROGDI-212ENST00000590198 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP45.52■■■■■ 4.88
ROGDI-212ENST00000590198 HRCP23327 699 aa45.51■■■■■ 4.88
ROGDI-212ENST00000590198 ANKLE2Q86XL3 938 aa45.5■■■■■ 4.87
ROGDI-212ENST00000590198 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa45.49■■■■■ 4.87
ROGDI-212ENST00000590198 FOXD1Q16676 465 aa45.48■■■■■ 4.87
ROGDI-212ENST00000590198 CHGAP10645 457 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
ROGDI-212ENST00000590198 ADGRB3O60242 1522 aa45.45■■■■■ 4.87
ROGDI-212ENST00000590198 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
ROGDI-212ENST00000590198 TRPM2O94759 1503 aa45.38■■■■■ 4.86
ROGDI-212ENST00000590198 TMEM2Q9UHN6 1383 aa45.38■■■■■ 4.86
ROGDI-212ENST00000590198 SLIT1O75093 1534 aa45.36■■■■■ 4.85
ROGDI-212ENST00000590198 ARHGAP23Q9P227 1491 aa45.36■■■■■ 4.85
ROGDI-212ENST00000590198 TXNDC2Q86VQ3 553 aa45.36■■■■■ 4.85
ROGDI-212ENST00000590198 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
ROGDI-212ENST00000590198 EID1Q9Y6B2 187 aa45.35■■■■■ 4.85
ROGDI-212ENST00000590198 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa45.34■■■■■ 4.85
ROGDI-212ENST00000590198 LTKP29376 864 aa45.33■■■■■ 4.85
ROGDI-212ENST00000590198 NEURL4Q96JN8 1562 aa45.31■■■■■ 4.84
ROGDI-212ENST00000590198 CLTCL1P53675 1640 aa45.3■■■■■ 4.84
ROGDI-212ENST00000590198 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP45.29■■■■■ 4.84
ROGDI-212ENST00000590198 MYO5BQ9ULV0 1848 aa45.29■■■■■ 4.84
ROGDI-212ENST00000590198 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP45.27■■■■■ 4.84
ROGDI-212ENST00000590198 MED14O60244 1454 aa45.25■■■■■ 4.83
ROGDI-212ENST00000590198 RIMS2Q9UQ26 1411 aa45.21■■■■■ 4.83
ROGDI-212ENST00000590198 HDGFP51858 240 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
ROGDI-212ENST00000590198 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP45.19■■■■■ 4.82
ROGDI-212ENST00000590198 CCDC144AA2RUR9 1427 aa45.18■■■■■ 4.82
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