RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589485.5

ILF3-215, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 620 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-215	ENST00000589485	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
ILF3-215	ENST00000589485	KIF15	Q9NS87	1388 aa		31.89	■■■□□ 2.7
ILF3-215	ENST00000589485	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		31.88	■■■□□ 2.69
ILF3-215	ENST00000589485	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		31.88	■■■□□ 2.69
ILF3-215	ENST00000589485	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		31.87	■■■□□ 2.69
ILF3-215	ENST00000589485	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
ILF3-215	ENST00000589485	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.86	■■■□□ 2.69
ILF3-215	ENST00000589485	NPAT	Q14207	1427 aa		31.85	■■■□□ 2.69
ILF3-215	ENST00000589485	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		31.85	■■■□□ 2.69
ILF3-215	ENST00000589485	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		31.84	■■■□□ 2.69
ILF3-215	ENST00000589485	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		31.8	■■■□□ 2.68
ILF3-215	ENST00000589485	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.79	■■■□□ 2.68
ILF3-215	ENST00000589485	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
ILF3-215	ENST00000589485	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.75	■■■□□ 2.67
ILF3-215	ENST00000589485	ADGRL2	O95490	1459 aa		31.74	■■■□□ 2.67
ILF3-215	ENST00000589485	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		31.74	■■■□□ 2.67
ILF3-215	ENST00000589485	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.74	■■■□□ 2.67
ILF3-215	ENST00000589485	ABCC3	O15438	1527 aa		31.73	■■■□□ 2.67
ILF3-215	ENST00000589485	PZP	P20742	1482 aa		31.72	■■■□□ 2.67
ILF3-215	ENST00000589485	CEP152	O94986	1710 aa		31.72	■■■□□ 2.67
ILF3-215	ENST00000589485	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
ILF3-215	ENST00000589485	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
ILF3-215	ENST00000589485	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	31.67	■■■□□ 2.66	1e-10	■■□□□ 11.6
ILF3-215	ENST00000589485	ITGAE	P38570	1179 aa		31.66	■■■□□ 2.66
ILF3-215	ENST00000589485	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
ILF3-215	ENST00000589485	DEPDC5	O75140	1603 aa		31.66	■■■□□ 2.66
ILF3-215	ENST00000589485	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
ILF3-215	ENST00000589485	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.65	■■■□□ 2.66
ILF3-215	ENST00000589485	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.65	■■■□□ 2.66
ILF3-215	ENST00000589485	TNR	Q92752	1358 aa		31.65	■■■□□ 2.66
ILF3-215	ENST00000589485	KANK1	Q14678	1352 aa		31.63	■■■□□ 2.65
ILF3-215	ENST00000589485	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	31.63	■■■□□ 2.65
ILF3-215	ENST00000589485	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
ILF3-215	ENST00000589485	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		31.59	■■■□□ 2.65
ILF3-215	ENST00000589485	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		31.58	■■■□□ 2.65
ILF3-215	ENST00000589485	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.57	■■■□□ 2.64
ILF3-215	ENST00000589485	ROCK1	Q13464	1354 aa		31.56	■■■□□ 2.64
ILF3-215	ENST00000589485	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
ILF3-215	ENST00000589485	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		31.53	■■■□□ 2.64
ILF3-215	ENST00000589485	ERVK-7	P63135	1459 aa		31.52	■■■□□ 2.64
ILF3-215	ENST00000589485	NLRP1	Q9C000	1473 aa		31.5	■■■□□ 2.63
ILF3-215	ENST00000589485	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		31.5	■■■□□ 2.63
ILF3-215	ENST00000589485	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		31.49	■■■□□ 2.63
ILF3-215	ENST00000589485	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		31.48	■■■□□ 2.63
ILF3-215	ENST00000589485	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.47	■■■□□ 2.63
ILF3-215	ENST00000589485	PTPRT	O14522	1441 aa		31.46	■■■□□ 2.63
ILF3-215	ENST00000589485	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		31.45	■■■□□ 2.62
ILF3-215	ENST00000589485	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		31.43	■■■□□ 2.62
ILF3-215	ENST00000589485	UNC13B	O14795	1591 aa		31.43	■■■□□ 2.62
ILF3-215	ENST00000589485	PKD2	Q13563	968 aa		31.42	■■■□□ 2.62
ILF3-215	ENST00000589485	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		31.41	■■■□□ 2.62
ILF3-215	ENST00000589485	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
ILF3-215	ENST00000589485	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
ILF3-215	ENST00000589485	TET3	O43151	1660 aa		31.37	■■■□□ 2.61
ILF3-215	ENST00000589485	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		31.35	■■■□□ 2.61
ILF3-215	ENST00000589485	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		31.33	■■■□□ 2.61
ILF3-215	ENST00000589485	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		31.31	■■■□□ 2.6
ILF3-215	ENST00000589485	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.3	■■■□□ 2.6
ILF3-215	ENST00000589485	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		31.3	■■■□□ 2.6
ILF3-215	ENST00000589485	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
ILF3-215	ENST00000589485	NUP155	O75694	1391 aa		31.29	■■■□□ 2.6
ILF3-215	ENST00000589485	PIK3C2B	O00750	1634 aa		31.28	■■■□□ 2.6
ILF3-215	ENST00000589485	SYNM	O15061	1565 aa		31.27	■■■□□ 2.6
ILF3-215	ENST00000589485	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.26	■■■□□ 2.59
ILF3-215	ENST00000589485	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		31.26	■■■□□ 2.59
ILF3-215	ENST00000589485	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		31.26	■■■□□ 2.59
ILF3-215	ENST00000589485	NOS1	P29475	1434 aa		31.25	■■■□□ 2.59
ILF3-215	ENST00000589485	NAIP	Q13075	1403 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ILF3-215	ENST00000589485		E9PCH4	1651 aa		31.23	■■■□□ 2.59
ILF3-215	ENST00000589485	IDI1	Q13907	227 aa		31.2	■■■□□ 2.59
ILF3-215	ENST00000589485	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.2	■■■□□ 2.59
ILF3-215	ENST00000589485	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	31.19	■■■□□ 2.58
ILF3-215	ENST00000589485	HFM1	A2PYH4	1435 aa		31.18	■■■□□ 2.58
ILF3-215	ENST00000589485	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		31.18	■■■□□ 2.58
ILF3-215	ENST00000589485	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
ILF3-215	ENST00000589485	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.16	■■■□□ 2.58
ILF3-215	ENST00000589485	IQGAP1	P46940	1657 aa		31.16	■■■□□ 2.58
ILF3-215	ENST00000589485	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
ILF3-215	ENST00000589485	MED14	O60244	1454 aa		31.15	■■■□□ 2.58
ILF3-215	ENST00000589485	ADGRB3	O60242	1522 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ILF3-215	ENST00000589485	SLIT1	O75093	1534 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ILF3-215	ENST00000589485	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
ILF3-215	ENST00000589485	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		31.13	■■■□□ 2.57
ILF3-215	ENST00000589485	EID1	Q9Y6B2	187 aa		31.12	■■■□□ 2.57
ILF3-215	ENST00000589485	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ILF3-215	ENST00000589485	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		31.09	■■■□□ 2.57
ILF3-215	ENST00000589485	TRIM52	Q96A61	297 aa		31.09	■■■□□ 2.57
ILF3-215	ENST00000589485	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		31.09	■■■□□ 2.57
ILF3-215	ENST00000589485	LTK	P29376	864 aa		31.07	■■■□□ 2.56
ILF3-215	ENST00000589485	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		31.06	■■■□□ 2.56
ILF3-215	ENST00000589485	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.04	■■■□□ 2.56
ILF3-215	ENST00000589485	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		31.02	■■■□□ 2.56
ILF3-215	ENST00000589485	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		31.01	■■■□□ 2.55
ILF3-215	ENST00000589485	CPS1	P31327	1500 aa		30.97	■■■□□ 2.55
ILF3-215	ENST00000589485	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	30.94	■■■□□ 2.54
ILF3-215	ENST00000589485	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		30.93	■■■□□ 2.54
ILF3-215	ENST00000589485	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	30.93	■■■□□ 2.54
ILF3-215	ENST00000589485	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	30.92	■■■□□ 2.54
ILF3-215	ENST00000589485	BCAN	Q96GW7	911 aa		30.92	■■■□□ 2.54
ILF3-215	ENST00000589485	ZFYVE9	O95405	1425 aa		30.9	■■■□□ 2.54

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