RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588707.5

GTF3C2-AS1-205, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 607 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KDM5DQ9BY66 1539 aa10.96□□□□□ -0.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FGD6Q6ZV73 1430 aa10.96□□□□□ -0.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.96□□□□□ -0.65
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ABCC5O15440 1437 aa10.95□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FBXO41Q8TF61 875 aa10.95□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MYO3AQ8NEV4 1616 aa10.95□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DAPK1P53355 1430 aa10.94□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NCOA1Q15788 1441 aa10.94□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa10.94□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM135AQ9P2D6 1515 aa10.94□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PZPP20742 1482 aa10.93□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.93□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CERKQ8TCT0 537 aa10.93□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10.93□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PTPRTO14522 1441 aa10.92□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KIF15Q9NS87 1388 aa10.92□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CROCC2H7BZ55 1655 aa10.92□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10.92□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DUOX2Q9NRD8 1548 aa10.92□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TNRQ92752 1358 aa10.91□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.91□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ABCC3O15438 1527 aa10.9□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A2ML1A8K2U0 1454 aa10.9□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MROH1Q8NDA8 1641 aa10.9□□□□□ -0.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PLA2R1Q13018 1463 aa10.89□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PKD2Q13563 968 aa10.89□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ERBINQ96RT1 1412 aa10.89□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa10.89□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ITGAEP38570 1179 aa10.87□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.87□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CEP152O94986 1710 aa10.86□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NLRP1Q9C000 1473 aa10.86□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa10.86□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LTBP4Q8N2S1 1624 aa10.85□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ADGRL2O95490 1459 aa10.85□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ERVK-7P63135 1459 aa10.85□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UGGT1Q9NYU2 1555 aa10.85□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HRCP23327 699 aa10.84□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DEPDC5O75140 1603 aa10.84□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KANK1Q14678 1352 aa10.83□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa10.83□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ANKLE2Q86XL3 938 aa10.82□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SETD5Q9C0A6 1442 aa10.82□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.82□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.81□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 VWDEQ8N2E2 1590 aa10.8□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LMTK2Q8IWU2 1503 aa10.79□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ROCK1Q13464 1354 aa10.78□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HFM1A2PYH4 1435 aa10.78□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IQSEC2Q5JU85 1478 aa10.78□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.78□□□□□ -0.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MED14O60244 1454 aa10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UBR1Q8IWV7 1749 aa10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.77□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EFCAB6Q5THR3 1501 aa10.76□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LTKP29376 864 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IDI1Q13907 227 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PIK3C2BO00750 1634 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NOS1P29475 1434 aa10.75□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ARHGAP23Q9P227 1491 aa10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SYNMO15061 1565 aa10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IQGAP1P46940 1657 aa10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NAIPQ13075 1403 aa10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SLIT1O75093 1534 aa10.74□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UBAP1LF5GYI3 381 aa10.73□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UNC13BO14795 1591 aa10.73□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EID1Q9Y6B2 187 aa10.72□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TMEM2Q9UHN6 1383 aa10.72□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CPS1P31327 1500 aa10.72□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TET3O43151 1660 aa10.72□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SLC52A1Q9NWF4 448 aa10.71□□□□□ -0.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NUP155O75694 1391 aa10.7□□□□□ -0.7
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ADGRB3O60242 1522 aa10.69□□□□□ -0.7
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GCC2Q8IWJ2 1684 aa10.69□□□□□ -0.7
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.69□□□□□ -0.7
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 E9PCH4 1651 aa10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms