RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582327.5

GPS1-216, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

TSL 4

Gene GPS1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-216ENST00000582327 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.59■■□□□ 1.85
GPS1-216ENST00000582327 NPATQ14207 1427 aa26.58■■□□□ 1.85
GPS1-216ENST00000582327 ERBINQ96RT1 1412 aa26.57■■□□□ 1.84
GPS1-216ENST00000582327 MROH2AA6NES4 1674 aa26.57■■□□□ 1.84
GPS1-216ENST00000582327 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.57■■□□□ 1.84
GPS1-216ENST00000582327 ADGRL2O95490 1459 aa26.55■■□□□ 1.84
GPS1-216ENST00000582327 C3P01024 1663 aa26.55■■□□□ 1.84
GPS1-216ENST00000582327 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
GPS1-216ENST00000582327 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.53■■□□□ 1.84
GPS1-216ENST00000582327 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
GPS1-216ENST00000582327 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.51■■□□□ 1.83
GPS1-216ENST00000582327 PTPRKQ15262 1439 aa26.51■■□□□ 1.83
GPS1-216ENST00000582327 HSPA2P54652 639 aa26.5■■□□□ 1.83
GPS1-216ENST00000582327 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
GPS1-216ENST00000582327 ROCK1Q13464 1354 aa26.49■■□□□ 1.83
GPS1-216ENST00000582327 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
GPS1-216ENST00000582327 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.47■■□□□ 1.83
GPS1-216ENST00000582327 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.45■■□□□ 1.82
GPS1-216ENST00000582327 ITGAEP38570 1179 aa26.44■■□□□ 1.82
GPS1-216ENST00000582327 KANK1Q14678 1352 aa26.44■■□□□ 1.82
GPS1-216ENST00000582327 PZPP20742 1482 aa26.43■■□□□ 1.82
GPS1-216ENST00000582327 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
GPS1-216ENST00000582327 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.821e-7■■■□□ 15.8
GPS1-216ENST00000582327 ABCC3O15438 1527 aa26.41■■□□□ 1.82
GPS1-216ENST00000582327 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.39■■□□□ 1.81
GPS1-216ENST00000582327 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
GPS1-216ENST00000582327 TNRQ92752 1358 aa26.37■■□□□ 1.81
GPS1-216ENST00000582327 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.37■■□□□ 1.81
GPS1-216ENST00000582327 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
GPS1-216ENST00000582327 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.36■■□□□ 1.81
GPS1-216ENST00000582327 DEPDC5O75140 1603 aa26.34■■□□□ 1.81
GPS1-216ENST00000582327 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.3■■□□□ 1.8
GPS1-216ENST00000582327 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.29■■□□□ 1.8
GPS1-216ENST00000582327 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.29■■□□□ 1.8
GPS1-216ENST00000582327 NLRP1Q9C000 1473 aa26.28■■□□□ 1.8
GPS1-216ENST00000582327 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
GPS1-216ENST00000582327 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
GPS1-216ENST00000582327 ERVK-7P63135 1459 aa26.25■■□□□ 1.79
GPS1-216ENST00000582327 PKD2Q13563 968 aa26.25■■□□□ 1.79
GPS1-216ENST00000582327 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.25■■□□□ 1.79
GPS1-216ENST00000582327 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.25■■□□□ 1.79
GPS1-216ENST00000582327 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.24■■□□□ 1.79
GPS1-216ENST00000582327 CEP152O94986 1710 aa26.22■■□□□ 1.79
GPS1-216ENST00000582327 PLA2R1Q13018 1463 aa26.22■■□□□ 1.79
GPS1-216ENST00000582327 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
GPS1-216ENST00000582327 PTPRTO14522 1441 aa26.2■■□□□ 1.78
GPS1-216ENST00000582327 NUP155O75694 1391 aa26.2■■□□□ 1.78
GPS1-216ENST00000582327 NAIPQ13075 1403 aa26.18■■□□□ 1.78
GPS1-216ENST00000582327 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.17■■□□□ 1.78
GPS1-216ENST00000582327 STRCQ7RTU9 1775 aa26.17■■□□□ 1.78
GPS1-216ENST00000582327 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
GPS1-216ENST00000582327 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.16■■□□□ 1.78
GPS1-216ENST00000582327 UNC13BO14795 1591 aa26.16■■□□□ 1.78
GPS1-216ENST00000582327 HFM1A2PYH4 1435 aa26.15■■□□□ 1.78
GPS1-216ENST00000582327 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.15■■□□□ 1.78
GPS1-216ENST00000582327 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.15■■□□□ 1.78
GPS1-216ENST00000582327 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.14■■□□□ 1.78
GPS1-216ENST00000582327 NOS1P29475 1434 aa26.14■■□□□ 1.77
GPS1-216ENST00000582327 IDI1Q13907 227 aa26.12■■□□□ 1.77
GPS1-216ENST00000582327 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
GPS1-216ENST00000582327 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.09■■□□□ 1.77
GPS1-216ENST00000582327 TET3O43151 1660 aa26.08■■□□□ 1.77
GPS1-216ENST00000582327 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.06■■□□□ 1.76
GPS1-216ENST00000582327 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
GPS1-216ENST00000582327 TRIM52Q96A61 297 aa26.03■■□□□ 1.76
GPS1-216ENST00000582327 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.01■■□□□ 1.75
GPS1-216ENST00000582327 EID1Q9Y6B2 187 aa26.01■■□□□ 1.75
GPS1-216ENST00000582327 SYNMO15061 1565 aa25.99■■□□□ 1.75
GPS1-216ENST00000582327 MED14O60244 1454 aa25.99■■□□□ 1.75
GPS1-216ENST00000582327 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.99■■□□□ 1.75
GPS1-216ENST00000582327 CERKQ8TCT0 537 aa25.99■■□□□ 1.75
GPS1-216ENST00000582327 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.98■■□□□ 1.75
GPS1-216ENST00000582327 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.97■■□□□ 1.75
GPS1-216ENST00000582327 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.97■■□□□ 1.75
GPS1-216ENST00000582327 LTKP29376 864 aa25.96■■□□□ 1.75
GPS1-216ENST00000582327 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
GPS1-216ENST00000582327 SLIT1O75093 1534 aa25.96■■□□□ 1.75
GPS1-216ENST00000582327 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
GPS1-216ENST00000582327 E9PCH4 1651 aa25.95■■□□□ 1.74
GPS1-216ENST00000582327 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
GPS1-216ENST00000582327 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
GPS1-216ENST00000582327 PIK3C2BO00750 1634 aa25.95■■□□□ 1.74
GPS1-216ENST00000582327 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
GPS1-216ENST00000582327 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.91■■□□□ 1.74
GPS1-216ENST00000582327 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.91■■□□□ 1.74
GPS1-216ENST00000582327 FBXO41Q8TF61 875 aa25.91■■□□□ 1.74
GPS1-216ENST00000582327 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
GPS1-216ENST00000582327 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
GPS1-216ENST00000582327 ADGRB3O60242 1522 aa25.88■■□□□ 1.73
GPS1-216ENST00000582327 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
GPS1-216ENST00000582327 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
GPS1-216ENST00000582327 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.86■■□□□ 1.73
GPS1-216ENST00000582327 HRCP23327 699 aa25.86■■□□□ 1.73
GPS1-216ENST00000582327 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
GPS1-216ENST00000582327 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.85■■□□□ 1.73
GPS1-216ENST00000582327 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.81■■□□□ 1.72
GPS1-216ENST00000582327 IQGAP1P46940 1657 aa25.8■■□□□ 1.72
GPS1-216ENST00000582327 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.8■■□□□ 1.72
GPS1-216ENST00000582327 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.79■■□□□ 1.72
GPS1-216ENST00000582327 ZFYVE9O95405 1425 aa25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms