RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP50.06■■■■■ 5.6
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CNTLNQ9NXG0 1405 aa50.03■■■■■ 5.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM135AQ9P2D6 1515 aa50■■■■■ 5.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 MROH1Q8NDA8 1641 aa49.99■■■■■ 5.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEPDC5O75140 1603 aa49.99■■■■■ 5.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP49.95■■■■■ 5.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 GCC2Q8IWJ2 1684 aa49.95■■■■■ 5.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP49.95■■■■■ 5.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 KDM5DQ9BY66 1539 aa49.94■■■■■ 5.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 HFM1A2PYH4 1435 aa49.94■■■■■ 5.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAIPQ13075 1403 aa49.94■■■■■ 5.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 MROH2AA6NES4 1674 aa49.93■■■■■ 5.58
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CTDNEP1-209ENST00000574205 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa49.9■■■■■ 5.58
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C3P01024 1663 aa49.84■■■■■ 5.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCC3O15438 1527 aa49.83■■■■■ 5.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZMYM3Q14202 1370 aa49.82■■■■■ 5.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP49.81■■■■■ 5.569e-7■■□□□ 12.2
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP152O94986 1710 aa49.78■■■■■ 5.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 VWDEQ8N2E2 1590 aa49.77■■■■■ 5.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP49.76■■■■■ 5.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLPPR3Q6T4P5 718 aa49.75■■■■■ 5.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 LMTK2Q8IWU2 1503 aa49.68■■■■■ 5.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa49.68■■■■■ 5.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 PZPP20742 1482 aa49.64■■■■■ 5.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 IQGAP3Q86VI3 1631 aa49.6■■■■■ 5.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPATQ14207 1427 aa49.6■■■■■ 5.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUP155O75694 1391 aa49.59■■■■■ 5.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 SETD5Q9C0A6 1442 aa49.59■■■■■ 5.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP49.58■■■■■ 5.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa49.57■■■■■ 5.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 TET3O43151 1660 aa49.53■■■■■ 5.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 EFCAB6Q5THR3 1501 aa49.53■■■■■ 5.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP49.5■■■■■ 5.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP49.46■■■■■ 5.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 PREX1Q8TCU6 1659 aa49.46■■■■■ 5.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa49.43■■■■■ 5.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP49.43■■■■■ 5.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP49.43■■■■■ 5.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM52Q96A61 297 aa49.43■■■■■ 5.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa49.41■■■■■ 5.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERVK-7P63135 1459 aa49.4■■■■■ 5.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP49.4■■■■■ 5.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa49.36■■■■■ 5.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNRQ92752 1358 aa49.36■■■■■ 5.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 E9PCH4 1651 aa49.35■■■■■ 5.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 LMTK3Q96Q04 1460 aa49.33■■■■■ 5.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYO3AQ8NEV4 1616 aa49.33■■■■■ 5.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 HRCP23327 699 aa49.28■■■■■ 5.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOS1P29475 1434 aa49.24■■■■■ 5.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP49.23■■■■■ 5.47
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NLRP1Q9C000 1473 aa49.22■■■■■ 5.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP49.2■■■■■ 5.47
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CTDNEP1-209ENST00000574205 A2ML1A8K2U0 1454 aa49.16■■■■■ 5.46
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MPHOSPH9Q99550 1183 aa49.12■■■■■ 5.45
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PTPRTO14522 1441 aa49.05■■■■■ 5.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSPA2P54652 639 aa49.04■■■■■ 5.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 UGGT1Q9NYU2 1555 aa49.04■■■■■ 5.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIK3C2BO00750 1634 aa49■■■■■ 5.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 IDI1Q13907 227 aa49■■■■■ 5.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRPM2O94759 1503 aa48.95■■■■■ 5.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBR1Q8IWV7 1749 aa48.95■■■■■ 5.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP48.93■■■■■ 5.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP48.92■■■■■ 5.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa48.79■■■■■ 5.4
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLIT1O75093 1534 aa48.72■■■■■ 5.39
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC144AA2RUR9 1427 aa48.71■■■■■ 5.39
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM2Q9UHN6 1383 aa48.69■■■■■ 5.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP48.68■■■■■ 5.38
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DMRT2Q9Y5R5 561 aa48.58■■■■■ 5.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 EID1Q9Y6B2 187 aa48.58■■■■■ 5.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP48.57■■■■■ 5.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEURL4Q96JN8 1562 aa48.56■■■■■ 5.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFYVE9O95405 1425 aa48.53■■■■■ 5.36
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP48.53■■■■■ 5.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 LTKP29376 864 aa48.53■■■■■ 5.36
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