RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569963.1

NAE1-222, Transcript of NEDD8 activating enzyme E1 subunit 1, human

TSL 2

Gene NAE1, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAE1-222	ENST00000569963	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	29.95	■■■□□ 2.39
NAE1-222	ENST00000569963	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		29.95	■■■□□ 2.38
NAE1-222	ENST00000569963	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	29.93	■■■□□ 2.38
NAE1-222	ENST00000569963	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		29.91	■■■□□ 2.38
NAE1-222	ENST00000569963	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		29.9	■■■□□ 2.38
NAE1-222	ENST00000569963	MROH2A	A6NES4	1674 aa		29.85	■■■□□ 2.37
NAE1-222	ENST00000569963	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		29.84	■■■□□ 2.37
NAE1-222	ENST00000569963	DEPDC5	O75140	1603 aa		29.83	■■■□□ 2.37
NAE1-222	ENST00000569963	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		29.83	■■■□□ 2.37
NAE1-222	ENST00000569963	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		29.83	■■■□□ 2.37
NAE1-222	ENST00000569963	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
NAE1-222	ENST00000569963	ZMYM3	Q14202	1370 aa		29.82	■■■□□ 2.36
NAE1-222	ENST00000569963	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
NAE1-222	ENST00000569963	C3	P01024	1663 aa		29.79	■■■□□ 2.36
NAE1-222	ENST00000569963	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
NAE1-222	ENST00000569963	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
NAE1-222	ENST00000569963	HFM1	A2PYH4	1435 aa		29.77	■■■□□ 2.36
NAE1-222	ENST00000569963	NAIP	Q13075	1403 aa		29.77	■■■□□ 2.36
NAE1-222	ENST00000569963	KANK1	Q14678	1352 aa		29.76	■■■□□ 2.35
NAE1-222	ENST00000569963	ABCC3	O15438	1527 aa		29.76	■■■□□ 2.35
NAE1-222	ENST00000569963	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	29.74	■■■□□ 2.35
NAE1-222	ENST00000569963	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		29.73	■■■□□ 2.35
NAE1-222	ENST00000569963	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		29.73	■■■□□ 2.35
NAE1-222	ENST00000569963	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		29.72	■■■□□ 2.35
NAE1-222	ENST00000569963	NPAT	Q14207	1427 aa		29.7	■■■□□ 2.34
NAE1-222	ENST00000569963	UNC13B	O14795	1591 aa		29.69	■■■□□ 2.34
NAE1-222	ENST00000569963	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		29.69	■■■□□ 2.34
NAE1-222	ENST00000569963	PZP	P20742	1482 aa		29.68	■■■□□ 2.34
NAE1-222	ENST00000569963	CEP152	O94986	1710 aa		29.67	■■■□□ 2.34
NAE1-222	ENST00000569963	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		29.65	■■■□□ 2.34
NAE1-222	ENST00000569963	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	29.65	■■■□□ 2.34
NAE1-222	ENST00000569963	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		29.64	■■■□□ 2.34
NAE1-222	ENST00000569963	NUP155	O75694	1391 aa		29.6	■■■□□ 2.33
NAE1-222	ENST00000569963	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	29.58	■■■□□ 2.33
NAE1-222	ENST00000569963	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		29.58	■■■□□ 2.33
NAE1-222	ENST00000569963	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		29.57	■■■□□ 2.32
NAE1-222	ENST00000569963	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		29.56	■■■□□ 2.32
NAE1-222	ENST00000569963	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	29.56	■■■□□ 2.32
NAE1-222	ENST00000569963	TET3	O43151	1660 aa		29.55	■■■□□ 2.32
NAE1-222	ENST00000569963	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		29.55	■■■□□ 2.32
NAE1-222	ENST00000569963	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		29.54	■■■□□ 2.32
NAE1-222	ENST00000569963	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		29.54	■■■□□ 2.32
NAE1-222	ENST00000569963	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		29.53	■■■□□ 2.32
NAE1-222	ENST00000569963	TNR	Q92752	1358 aa		29.52	■■■□□ 2.32
NAE1-222	ENST00000569963	ERVK-7	P63135	1459 aa		29.52	■■■□□ 2.32
NAE1-222	ENST00000569963	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	29.52	■■■□□ 2.32
NAE1-222	ENST00000569963	TRIM52	Q96A61	297 aa		29.47	■■■□□ 2.31
NAE1-222	ENST00000569963	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		29.46	■■■□□ 2.31
NAE1-222	ENST00000569963	HRC	P23327	699 aa		29.45	■■■□□ 2.31
NAE1-222	ENST00000569963	NLRP1	Q9C000	1473 aa		29.44	■■■□□ 2.3
NAE1-222	ENST00000569963	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	29.44	■■■□□ 2.3
NAE1-222	ENST00000569963	NOS1	P29475	1434 aa		29.44	■■■□□ 2.3
NAE1-222	ENST00000569963	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		29.43	■■■□□ 2.3
NAE1-222	ENST00000569963	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	29.43	■■■□□ 2.3
NAE1-222	ENST00000569963		E9PCH4	1651 aa		29.42	■■■□□ 2.3
NAE1-222	ENST00000569963	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		29.42	■■■□□ 2.3
NAE1-222	ENST00000569963	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	29.41	■■■□□ 2.3
NAE1-222	ENST00000569963	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	29.4	■■■□□ 2.3
NAE1-222	ENST00000569963	HSPA2	P54652	639 aa		29.36	■■■□□ 2.29
NAE1-222	ENST00000569963	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
NAE1-222	ENST00000569963	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		29.35	■■■□□ 2.29
NAE1-222	ENST00000569963	SYNM	O15061	1565 aa		29.35	■■■□□ 2.29
NAE1-222	ENST00000569963	PKD2	Q13563	968 aa		29.32	■■■□□ 2.28
NAE1-222	ENST00000569963	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		29.32	■■■□□ 2.28
NAE1-222	ENST00000569963	PTPRT	O14522	1441 aa		29.31	■■■□□ 2.28
NAE1-222	ENST00000569963	IDI1	Q13907	227 aa		29.31	■■■□□ 2.28
NAE1-222	ENST00000569963	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		29.3	■■■□□ 2.28
NAE1-222	ENST00000569963	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
NAE1-222	ENST00000569963	PLA2R1	Q13018	1463 aa		29.26	■■■□□ 2.27
NAE1-222	ENST00000569963	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
NAE1-222	ENST00000569963	PIK3C2B	O00750	1634 aa		29.25	■■■□□ 2.27
NAE1-222	ENST00000569963	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		29.25	■■■□□ 2.27
NAE1-222	ENST00000569963	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		29.24	■■■□□ 2.27
NAE1-222	ENST00000569963	TRPM2	O94759	1503 aa		29.2	■■■□□ 2.27
NAE1-222	ENST00000569963	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		29.2	■■■□□ 2.26
NAE1-222	ENST00000569963	STRC	Q7RTU9	1775 aa		29.2	■■■□□ 2.26
NAE1-222	ENST00000569963	ADGRB3	O60242	1522 aa		29.17	■■■□□ 2.26
NAE1-222	ENST00000569963	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		29.17	■■■□□ 2.26
NAE1-222	ENST00000569963	FOXD1	Q16676	465 aa		29.15	■■■□□ 2.26
NAE1-222	ENST00000569963	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		29.15	■■■□□ 2.26
NAE1-222	ENST00000569963	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		29.14	■■■□□ 2.26
NAE1-222	ENST00000569963	SLIT1	O75093	1534 aa		29.14	■■■□□ 2.25
NAE1-222	ENST00000569963	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		29.13	■■■□□ 2.25
NAE1-222	ENST00000569963	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		29.13	■■■□□ 2.25
NAE1-222	ENST00000569963	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		29.13	■■■□□ 2.25
NAE1-222	ENST00000569963	CLTCL1	P53675	1640 aa		29.1	■■■□□ 2.25
NAE1-222	ENST00000569963	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
NAE1-222	ENST00000569963	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
NAE1-222	ENST00000569963	EID1	Q9Y6B2	187 aa		29.07	■■■□□ 2.24
NAE1-222	ENST00000569963	MED14	O60244	1454 aa		29.05	■■■□□ 2.24
NAE1-222	ENST00000569963	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		29.05	■■■□□ 2.24
NAE1-222	ENST00000569963	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		29.04	■■■□□ 2.24
NAE1-222	ENST00000569963	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		29.04	■■■□□ 2.24
NAE1-222	ENST00000569963	LTK	P29376	864 aa		29.04	■■■□□ 2.24
NAE1-222	ENST00000569963	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
NAE1-222	ENST00000569963	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
NAE1-222	ENST00000569963	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		29.03	■■■□□ 2.24
NAE1-222	ENST00000569963	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		29.02	■■■□□ 2.24
NAE1-222	ENST00000569963	KIF1B	O60333	1816 aa		29.02	■■■□□ 2.24
NAE1-222	ENST00000569963	ZFYVE9	O95405	1425 aa		29.01	■■■□□ 2.23

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