RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567868.5

SPSB3-209, Transcript of splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 3, human

TSL 3

Gene SPSB3, Length 1,628 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPSB3-209	ENST00000567868	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SPSB3-209	ENST00000567868	AGL	P35573	1532 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SPSB3-209	ENST00000567868	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
SPSB3-209	ENST00000567868	GGT6	Q6P531	493 aa		33	■■■□□ 2.87
SPSB3-209	ENST00000567868	DEPDC5	O75140	1603 aa		33	■■■□□ 2.87
SPSB3-209	ENST00000567868	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33	■■■□□ 2.87
SPSB3-209	ENST00000567868	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SPSB3-209	ENST00000567868	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
SPSB3-209	ENST00000567868	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
SPSB3-209	ENST00000567868	KANK1	Q14678	1352 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SPSB3-209	ENST00000567868	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
SPSB3-209	ENST00000567868	PZP	P20742	1482 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SPSB3-209	ENST00000567868	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
SPSB3-209	ENST00000567868	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
SPSB3-209	ENST00000567868	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SPSB3-209	ENST00000567868	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SPSB3-209	ENST00000567868	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SPSB3-209	ENST00000567868	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SPSB3-209	ENST00000567868	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SPSB3-209	ENST00000567868	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SPSB3-209	ENST00000567868	MLEC	Q14165	292 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SPSB3-209	ENST00000567868	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SPSB3-209	ENST00000567868	PKD2	Q13563	968 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SPSB3-209	ENST00000567868	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SPSB3-209	ENST00000567868	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SPSB3-209	ENST00000567868	FOXD1	Q16676	465 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SPSB3-209	ENST00000567868	ABCC3	O15438	1527 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SPSB3-209	ENST00000567868	TET3	O43151	1660 aa		32.76	■■■□□ 2.84
SPSB3-209	ENST00000567868	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
SPSB3-209	ENST00000567868	CEP152	O94986	1710 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SPSB3-209	ENST00000567868	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
SPSB3-209	ENST00000567868	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SPSB3-209	ENST00000567868	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SPSB3-209	ENST00000567868		E9PCH4	1651 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SPSB3-209	ENST00000567868	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SPSB3-209	ENST00000567868	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SPSB3-209	ENST00000567868	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
SPSB3-209	ENST00000567868	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SPSB3-209	ENST00000567868	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
SPSB3-209	ENST00000567868	NPAT	Q14207	1427 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SPSB3-209	ENST00000567868	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SPSB3-209	ENST00000567868	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SPSB3-209	ENST00000567868	PTPRT	O14522	1441 aa		32.57	■■■□□ 2.81
SPSB3-209	ENST00000567868	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SPSB3-209	ENST00000567868	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SPSB3-209	ENST00000567868	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SPSB3-209	ENST00000567868	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SPSB3-209	ENST00000567868	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.51	■■■□□ 2.8
SPSB3-209	ENST00000567868	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.51	■■■□□ 2.8
SPSB3-209	ENST00000567868	TRPM2	O94759	1503 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SPSB3-209	ENST00000567868	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SPSB3-209	ENST00000567868	NOS1	P29475	1434 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SPSB3-209	ENST00000567868	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SPSB3-209	ENST00000567868	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SPSB3-209	ENST00000567868	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SPSB3-209	ENST00000567868	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
SPSB3-209	ENST00000567868	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.45	■■■□□ 2.78
SPSB3-209	ENST00000567868	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SPSB3-209	ENST00000567868	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
SPSB3-209	ENST00000567868	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
SPSB3-209	ENST00000567868	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SPSB3-209	ENST00000567868	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SPSB3-209	ENST00000567868	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SPSB3-209	ENST00000567868	C3	P01024	1663 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SPSB3-209	ENST00000567868	SYNM	O15061	1565 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SPSB3-209	ENST00000567868	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SPSB3-209	ENST00000567868	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SPSB3-209	ENST00000567868	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SPSB3-209	ENST00000567868	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SPSB3-209	ENST00000567868	IDI1	Q13907	227 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SPSB3-209	ENST00000567868	TNR	Q92752	1358 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SPSB3-209	ENST00000567868	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SPSB3-209	ENST00000567868	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SPSB3-209	ENST00000567868	PTPRM	P28827	1452 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SPSB3-209	ENST00000567868	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.76
SPSB3-209	ENST00000567868	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.26	■■■□□ 2.76
SPSB3-209	ENST00000567868	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SPSB3-209	ENST00000567868	KIF1B	O60333	1816 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SPSB3-209	ENST00000567868	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SPSB3-209	ENST00000567868	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SPSB3-209	ENST00000567868	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SPSB3-209	ENST00000567868	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.2	■■■□□ 2.74
SPSB3-209	ENST00000567868	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SPSB3-209	ENST00000567868	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
SPSB3-209	ENST00000567868	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
SPSB3-209	ENST00000567868	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SPSB3-209	ENST00000567868	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.14	■■■□□ 2.73
SPSB3-209	ENST00000567868	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SPSB3-209	ENST00000567868	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SPSB3-209	ENST00000567868	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SPSB3-209	ENST00000567868	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
SPSB3-209	ENST00000567868	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SPSB3-209	ENST00000567868	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.07	■■■□□ 2.73
SPSB3-209	ENST00000567868	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
SPSB3-209	ENST00000567868	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SPSB3-209	ENST00000567868	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SPSB3-209	ENST00000567868	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.72
SPSB3-209	ENST00000567868	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
SPSB3-209	ENST00000567868	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SPSB3-209	ENST00000567868	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71

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