RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.82■■■□□ 2.68
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.75■■■□□ 2.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.75■■■□□ 2.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.75■■■□□ 2.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.73■■■□□ 2.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 C3P01024 1663 aa31.71■■■□□ 2.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 MROH2AA6NES4 1674 aa31.71■■■□□ 2.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.7■■■□□ 2.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.69■■■□□ 2.665e-7■■□□□ 12.8
CCNDBP1-208ENST00000566515 DEPDC5O75140 1603 aa31.69■■■□□ 2.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.68■■■□□ 2.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZMYM3Q14202 1370 aa31.68■■■□□ 2.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.65■■■□□ 2.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP152O94986 1710 aa31.64■■■□□ 2.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABCC3O15438 1527 aa31.63■■■□□ 2.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 NAIPQ13075 1403 aa31.62■■■□□ 2.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.61■■■□□ 2.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 KANK1Q14678 1352 aa31.58■■■□□ 2.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 HFM1A2PYH4 1435 aa31.57■■■□□ 2.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 UNC13BO14795 1591 aa31.55■■■□□ 2.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.54■■■□□ 2.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.54■■■□□ 2.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 PZPP20742 1482 aa31.5■■■□□ 2.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPATQ14207 1427 aa31.49■■■□□ 2.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.47■■■□□ 2.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.47■■■□□ 2.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUP155O75694 1391 aa31.45■■■□□ 2.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.43■■■□□ 2.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.43■■■□□ 2.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.41■■■□□ 2.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.4■■■□□ 2.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 TET3O43151 1660 aa31.4■■■□□ 2.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.39■■■□□ 2.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNRQ92752 1358 aa31.37■■■□□ 2.61
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERVK-7P63135 1459 aa31.37■■■□□ 2.61
CCNDBP1-208ENST00000566515 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.37■■■□□ 2.61
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.37■■■□□ 2.61
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM52Q96A61 297 aa31.36■■■□□ 2.61
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.36■■■□□ 2.61
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSPA2P54652 639 aa31.33■■■□□ 2.61
CCNDBP1-208ENST00000566515 E9PCH4 1651 aa31.31■■■□□ 2.6
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.28■■■□□ 2.6
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOS1P29475 1434 aa31.23■■■□□ 2.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.23■■■□□ 2.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 NLRP1Q9C000 1473 aa31.23■■■□□ 2.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYNMO15061 1565 aa31.22■■■□□ 2.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 PKD2Q13563 968 aa31.16■■■□□ 2.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.15■■■□□ 2.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 IDI1Q13907 227 aa31.14■■■□□ 2.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIK3C2BO00750 1634 aa31.14■■■□□ 2.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.13■■■□□ 2.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.13■■■□□ 2.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.11■■■□□ 2.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.1■■■□□ 2.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 STRCQ7RTU9 1775 aa31.1■■■□□ 2.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 HRCP23327 699 aa31.09■■■□□ 2.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 FOXD1Q16676 465 aa31.09■■■□□ 2.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPRTO14522 1441 aa31.07■■■□□ 2.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.06■■■□□ 2.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLA2R1Q13018 1463 aa31.03■■■□□ 2.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.02■■■□□ 2.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.01■■■□□ 2.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADGRB3O60242 1522 aa31.01■■■□□ 2.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRPM2O94759 1503 aa31.01■■■□□ 2.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.97■■■□□ 2.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLTCL1P53675 1640 aa30.97■■■□□ 2.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.95■■■□□ 2.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLIT1O75093 1534 aa30.92■■■□□ 2.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.91■■■□□ 2.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.91■■■□□ 2.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.91■■■□□ 2.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.89■■■□□ 2.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF1BO60333 1816 aa30.89■■■□□ 2.54
CCNDBP1-208ENST00000566515 LTKP29376 864 aa30.88■■■□□ 2.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.88■■■□□ 2.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 EID1Q9Y6B2 187 aa30.85■■■□□ 2.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.84■■■□□ 2.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.84■■■□□ 2.53
CCNDBP1-208ENST00000566515 MED14O60244 1454 aa30.81■■■□□ 2.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.81■■■□□ 2.52
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