RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565666.5

CMTM3-210, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-210ENST00000565666 ZMYM3Q14202 1370 aa28.73■■■□□ 2.19
CMTM3-210ENST00000565666 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.73■■■□□ 2.19
CMTM3-210ENST00000565666 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
CMTM3-210ENST00000565666 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.69■■■□□ 2.18
CMTM3-210ENST00000565666 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.69■■■□□ 2.18
CMTM3-210ENST00000565666 ERBINQ96RT1 1412 aa28.68■■■□□ 2.18
CMTM3-210ENST00000565666 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CMTM3-210ENST00000565666 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.66■■■□□ 2.18
CMTM3-210ENST00000565666 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.66■■■□□ 2.18
CMTM3-210ENST00000565666 ADGRL2O95490 1459 aa28.66■■■□□ 2.18
CMTM3-210ENST00000565666 NCOA1Q15788 1441 aa28.65■■■□□ 2.18
CMTM3-210ENST00000565666 NPATQ14207 1427 aa28.64■■■□□ 2.18
CMTM3-210ENST00000565666 HSPA2P54652 639 aa28.62■■■□□ 2.17
CMTM3-210ENST00000565666 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CMTM3-210ENST00000565666 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.61■■■□□ 2.17
CMTM3-210ENST00000565666 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.6■■■□□ 2.17
CMTM3-210ENST00000565666 ITGAEP38570 1179 aa28.59■■■□□ 2.17
CMTM3-210ENST00000565666 PTPRKQ15262 1439 aa28.59■■■□□ 2.17
CMTM3-210ENST00000565666 ABCC3O15438 1527 aa28.57■■■□□ 2.16
CMTM3-210ENST00000565666 CEP152O94986 1710 aa28.57■■■□□ 2.16
CMTM3-210ENST00000565666 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CMTM3-210ENST00000565666 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CMTM3-210ENST00000565666 DEPDC5O75140 1603 aa28.54■■■□□ 2.16
CMTM3-210ENST00000565666 PZPP20742 1482 aa28.54■■■□□ 2.16
CMTM3-210ENST00000565666 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.54■■■□□ 2.16
CMTM3-210ENST00000565666 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
CMTM3-210ENST00000565666 KANK1Q14678 1352 aa28.51■■■□□ 2.16
CMTM3-210ENST00000565666 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.51■■■□□ 2.15
CMTM3-210ENST00000565666 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.51■■■□□ 2.15
CMTM3-210ENST00000565666 ROCK1Q13464 1354 aa28.5■■■□□ 2.15
CMTM3-210ENST00000565666 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CMTM3-210ENST00000565666 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
CMTM3-210ENST00000565666 TNRQ92752 1358 aa28.46■■■□□ 2.15
CMTM3-210ENST00000565666 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
CMTM3-210ENST00000565666 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.4■■■□□ 2.14
CMTM3-210ENST00000565666 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
CMTM3-210ENST00000565666 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.39■■■□□ 2.13
CMTM3-210ENST00000565666 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.38■■■□□ 2.13
CMTM3-210ENST00000565666 STRCQ7RTU9 1775 aa28.38■■■□□ 2.13
CMTM3-210ENST00000565666 ERVK-7P63135 1459 aa28.38■■■□□ 2.13
CMTM3-210ENST00000565666 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.38■■■□□ 2.13
CMTM3-210ENST00000565666 UNC13BO14795 1591 aa28.37■■■□□ 2.13
CMTM3-210ENST00000565666 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.36■■■□□ 2.13
CMTM3-210ENST00000565666 NLRP1Q9C000 1473 aa28.34■■■□□ 2.13
CMTM3-210ENST00000565666 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.31■■■□□ 2.12
CMTM3-210ENST00000565666 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.31■■■□□ 2.12
CMTM3-210ENST00000565666 TET3O43151 1660 aa28.29■■■□□ 2.12
CMTM3-210ENST00000565666 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.29■■■□□ 2.12
CMTM3-210ENST00000565666 PLA2R1Q13018 1463 aa28.28■■■□□ 2.12
CMTM3-210ENST00000565666 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.28■■■□□ 2.12
CMTM3-210ENST00000565666 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.25■■■□□ 2.11
CMTM3-210ENST00000565666 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.23■■■□□ 2.11
CMTM3-210ENST00000565666 NAIPQ13075 1403 aa28.23■■■□□ 2.11
CMTM3-210ENST00000565666 NUP155O75694 1391 aa28.23■■■□□ 2.11
CMTM3-210ENST00000565666 PTPRTO14522 1441 aa28.22■■■□□ 2.11
CMTM3-210ENST00000565666 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CMTM3-210ENST00000565666 PKD2Q13563 968 aa28.21■■■□□ 2.11
CMTM3-210ENST00000565666 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CMTM3-210ENST00000565666 HFM1A2PYH4 1435 aa28.19■■■□□ 2.1
CMTM3-210ENST00000565666 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
CMTM3-210ENST00000565666 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.18■■■□□ 2.1
CMTM3-210ENST00000565666 SYNMO15061 1565 aa28.17■■■□□ 2.1
CMTM3-210ENST00000565666 PIK3C2BO00750 1634 aa28.17■■■□□ 2.1
CMTM3-210ENST00000565666 NOS1P29475 1434 aa28.17■■■□□ 2.1
CMTM3-210ENST00000565666 E9PCH4 1651 aa28.16■■■□□ 2.1
CMTM3-210ENST00000565666 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.13■■■□□ 2.09
CMTM3-210ENST00000565666 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.13■■■□□ 2.09
CMTM3-210ENST00000565666 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.09■■■□□ 2.09
CMTM3-210ENST00000565666 IDI1Q13907 227 aa28.09■■■□□ 2.09
CMTM3-210ENST00000565666 TRIM52Q96A61 297 aa28.08■■■□□ 2.09
CMTM3-210ENST00000565666 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.08■■■□□ 2.09
CMTM3-210ENST00000565666 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CMTM3-210ENST00000565666 ADGRB3O60242 1522 aa28.04■■■□□ 2.08
CMTM3-210ENST00000565666 SLIT1O75093 1534 aa28.02■■■□□ 2.08
CMTM3-210ENST00000565666 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.08
CMTM3-210ENST00000565666 IQGAP1P46940 1657 aa28.01■■■□□ 2.07
CMTM3-210ENST00000565666 MED14O60244 1454 aa28.01■■■□□ 2.07
CMTM3-210ENST00000565666 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.01■■■□□ 2.07
CMTM3-210ENST00000565666 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.01■■■□□ 2.07
CMTM3-210ENST00000565666 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CMTM3-210ENST00000565666 CERKQ8TCT0 537 aa27.99■■■□□ 2.07
CMTM3-210ENST00000565666 EID1Q9Y6B2 187 aa27.99■■■□□ 2.07
CMTM3-210ENST00000565666 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.99■■■□□ 2.07
CMTM3-210ENST00000565666 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.98■■■□□ 2.07
CMTM3-210ENST00000565666 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.97■■■□□ 2.07
CMTM3-210ENST00000565666 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CMTM3-210ENST00000565666 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.96■■■□□ 2.07
CMTM3-210ENST00000565666 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
CMTM3-210ENST00000565666 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.94■■■□□ 2.06
CMTM3-210ENST00000565666 LTKP29376 864 aa27.94■■■□□ 2.06
CMTM3-210ENST00000565666 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CMTM3-210ENST00000565666 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.93■■■□□ 2.06
CMTM3-210ENST00000565666 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
CMTM3-210ENST00000565666 FBXO41Q8TF61 875 aa27.89■■■□□ 2.06
CMTM3-210ENST00000565666 TRPM2O94759 1503 aa27.87■■■□□ 2.05
CMTM3-210ENST00000565666 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CMTM3-210ENST00000565666 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.85■■■□□ 2.05
CMTM3-210ENST00000565666 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CMTM3-210ENST00000565666 CLTCL1P53675 1640 aa27.84■■■□□ 2.05
CMTM3-210ENST00000565666 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.84■■■□□ 2.05
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