RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.96■■■■□ 3.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C3P01024 1663 aa33.94■■■■□ 3.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.94■■■■□ 3.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTPRKQ15262 1439 aa33.9■■■■□ 3.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.89■■■■□ 3.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.89■■■■□ 3.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ROCK1Q13464 1354 aa33.85■■■■□ 3.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MROH1Q8NDA8 1641 aa33.85■■■■□ 3.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZMYM3Q14202 1370 aa33.85■■■■□ 3.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DEPDC5O75140 1603 aa33.81■■■■□ 3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITGAEP38570 1179 aa33.79■■■■□ 3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PREX1Q8TCU6 1659 aa33.79■■■■□ 3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NPATQ14207 1427 aa33.78■■■■□ 3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.78■■■■□ 3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa33.78■■■■□ 3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.77■■■■□ 3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCC3O15438 1527 aa33.77■■■■□ 3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PZPP20742 1482 aa33.71■■■□□ 2.99
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CEP152O94986 1710 aa33.7■■■□□ 2.99
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.7■■■□□ 2.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KANK1Q14678 1352 aa33.68■■■□□ 2.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa33.67■■■□□ 2.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VWDEQ8N2E2 1590 aa33.66■■■□□ 2.98
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP33.63■■■□□ 2.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UNC13BO14795 1591 aa33.63■■■□□ 2.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LMTK2Q8IWU2 1503 aa33.62■■■□□ 2.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33.61■■■□□ 2.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.59■■■□□ 2.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa33.57■■■□□ 2.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNRQ92752 1358 aa33.55■■■□□ 2.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa33.55■■■□□ 2.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NAIPQ13075 1403 aa33.53■■■□□ 2.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HFM1A2PYH4 1435 aa33.53■■■□□ 2.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERVK-7P63135 1459 aa33.52■■■□□ 2.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HSPA2P54652 639 aa33.52■■■□□ 2.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EFCAB6Q5THR3 1501 aa33.51■■■□□ 2.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IQGAP3Q86VI3 1631 aa33.48■■■□□ 2.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TET3O43151 1660 aa33.48■■■□□ 2.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.46■■■□□ 2.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NLRP1Q9C000 1473 aa33.45■■■□□ 2.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUP155O75694 1391 aa33.4■■■□□ 2.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLA2R1Q13018 1463 aa33.34■■■□□ 2.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STRCQ7RTU9 1775 aa33.33■■■□□ 2.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NOS1P29475 1434 aa33.33■■■□□ 2.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UGGT1Q9NYU2 1555 aa33.32■■■□□ 2.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 E9PCH4 1651 aa33.32■■■□□ 2.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SYNMO15061 1565 aa33.3■■■□□ 2.92
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.24■■■□□ 2.91
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP33.23■■■□□ 2.91
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIK3C2BO00750 1634 aa33.22■■■□□ 2.91
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DMRT2Q9Y5R5 561 aa33.21■■■□□ 2.91
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.2■■■□□ 2.91
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.91
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM52Q96A61 297 aa33.2■■■□□ 2.91
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PKD2Q13563 968 aa33.19■■■□□ 2.9
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTPRTO14522 1441 aa33.19■■■□□ 2.9
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.18■■■□□ 2.9
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IDI1Q13907 227 aa33.15■■■□□ 2.9
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADGRB3O60242 1522 aa33.14■■■□□ 2.9
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa33.14■■■□□ 2.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa33.13■■■□□ 2.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLIT1O75093 1534 aa33.1■■■□□ 2.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NEURL4Q96JN8 1562 aa33.09■■■□□ 2.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.09■■■□□ 2.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARHGAP23Q9P227 1491 aa33.09■■■□□ 2.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKLE2Q86XL3 938 aa33.08■■■□□ 2.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.08■■■□□ 2.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRPM2O94759 1503 aa33.04■■■□□ 2.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MED14O60244 1454 aa33.04■■■□□ 2.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa33.03■■■□□ 2.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM2Q9UHN6 1383 aa33.03■■■□□ 2.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP32.99■■■□□ 2.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYO5BQ9ULV0 1848 aa32.98■■■□□ 2.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IQGAP1P46940 1657 aa32.97■■■□□ 2.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MPHOSPH9Q99550 1183 aa32.96■■■□□ 2.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLTCL1P53675 1640 aa32.95■■■□□ 2.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EID1Q9Y6B2 187 aa32.95■■■□□ 2.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HRCP23327 699 aa32.94■■■□□ 2.86
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TXNDC2Q86VQ3 553 aa32.93■■■□□ 2.86
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHGAP10645 457 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LTKP29376 864 aa32.91■■■□□ 2.86
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZFYVE9O95405 1425 aa32.9■■■□□ 2.86
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIMS2Q9UQ26 1411 aa32.87■■■□□ 2.85
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF1BO60333 1816 aa32.86■■■□□ 2.85
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FOXD1Q16676 465 aa32.85■■■□□ 2.85
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LTBP4Q8N2S1 1624 aa32.84■■■□□ 2.85
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