RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERBINQ96RT1 1412 aa26.48■■□□□ 1.83
CCNDBP1-204ENST00000563065 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.825e-7■■□□□ 12.8
CCNDBP1-204ENST00000563065 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.45■■□□□ 1.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.44■■□□□ 1.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.43■■□□□ 1.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZMYM3Q14202 1370 aa26.41■■□□□ 1.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.4■■□□□ 1.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.4■■□□□ 1.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 C3P01024 1663 aa26.37■■□□□ 1.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.35■■□□□ 1.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 NAIPQ13075 1403 aa26.34■■□□□ 1.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 DEPDC5O75140 1603 aa26.33■■□□□ 1.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCC3O15438 1527 aa26.33■■□□□ 1.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 MROH2AA6NES4 1674 aa26.33■■□□□ 1.8
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CCNDBP1-204ENST00000563065 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CCNDBP1-204ENST00000563065 CEP152O94986 1710 aa26.3■■□□□ 1.8
CCNDBP1-204ENST00000563065 HFM1A2PYH4 1435 aa26.29■■□□□ 1.8
CCNDBP1-204ENST00000563065 KANK1Q14678 1352 aa26.28■■□□□ 1.8
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.27■■□□□ 1.8
CCNDBP1-204ENST00000563065 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.25■■□□□ 1.79
CCNDBP1-204ENST00000563065 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.24■■□□□ 1.79
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CCNDBP1-204ENST00000563065 PZPP20742 1482 aa26.23■■□□□ 1.79
CCNDBP1-204ENST00000563065 UNC13BO14795 1591 aa26.22■■□□□ 1.79
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUP155O75694 1391 aa26.22■■□□□ 1.79
CCNDBP1-204ENST00000563065 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.21■■□□□ 1.79
CCNDBP1-204ENST00000563065 NPATQ14207 1427 aa26.2■■□□□ 1.79
CCNDBP1-204ENST00000563065 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
CCNDBP1-204ENST00000563065 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CCNDBP1-204ENST00000563065 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1-204ENST00000563065 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1-204ENST00000563065 HSPA2P54652 639 aa26.17■■□□□ 1.78
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRIM52Q96A61 297 aa26.17■■□□□ 1.78
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.15■■□□□ 1.78
CCNDBP1-204ENST00000563065 TNRQ92752 1358 aa26.15■■□□□ 1.78
CCNDBP1-204ENST00000563065 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.14■■□□□ 1.77
CCNDBP1-204ENST00000563065 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.13■■□□□ 1.77
CCNDBP1-204ENST00000563065 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.13■■□□□ 1.77
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERVK-7P63135 1459 aa26.12■■□□□ 1.77
CCNDBP1-204ENST00000563065 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.12■■□□□ 1.77
CCNDBP1-204ENST00000563065 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.11■■□□□ 1.77
CCNDBP1-204ENST00000563065 TET3O43151 1660 aa26.09■■□□□ 1.77
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.09■■□□□ 1.77
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.07■■□□□ 1.76
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.07■■□□□ 1.76
CCNDBP1-204ENST00000563065 E9PCH4 1651 aa26.04■■□□□ 1.76
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CCNDBP1-204ENST00000563065 NOS1P29475 1434 aa26.02■■□□□ 1.76
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CCNDBP1-204ENST00000563065 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CCNDBP1-204ENST00000563065 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CCNDBP1-204ENST00000563065 A2ML1A8K2U0 1454 aa26■■□□□ 1.75
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYNMO15061 1565 aa26■■□□□ 1.75
CCNDBP1-204ENST00000563065 PKD2Q13563 968 aa25.99■■□□□ 1.75
CCNDBP1-204ENST00000563065 IDI1Q13907 227 aa25.99■■□□□ 1.75
CCNDBP1-204ENST00000563065 NLRP1Q9C000 1473 aa25.99■■□□□ 1.75
CCNDBP1-204ENST00000563065 FOXD1Q16676 465 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CCNDBP1-204ENST00000563065 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.97■■□□□ 1.75
CCNDBP1-204ENST00000563065 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.93■■□□□ 1.74
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-204ENST00000563065 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-204ENST00000563065 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.9■■□□□ 1.74
CCNDBP1-204ENST00000563065 PIK3C2BO00750 1634 aa25.9■■□□□ 1.74
CCNDBP1-204ENST00000563065 HRCP23327 699 aa25.9■■□□□ 1.74
CCNDBP1-204ENST00000563065 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.89■■□□□ 1.73
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTPRTO14522 1441 aa25.89■■□□□ 1.73
CCNDBP1-204ENST00000563065 STRCQ7RTU9 1775 aa25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLA2R1Q13018 1463 aa25.87■■□□□ 1.73
CCNDBP1-204ENST00000563065 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.86■■□□□ 1.73
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.79■■□□□ 1.72
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADGRB3O60242 1522 aa25.79■■□□□ 1.72
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRPM2O94759 1503 aa25.79■■□□□ 1.72
CCNDBP1-204ENST00000563065 LTKP29376 864 aa25.79■■□□□ 1.72
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLTCL1P53675 1640 aa25.77■■□□□ 1.72
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.77■■□□□ 1.72
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.77■■□□□ 1.72
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.76■■□□□ 1.71
CCNDBP1-204ENST00000563065 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.76■■□□□ 1.71
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.75■■□□□ 1.71
CCNDBP1-204ENST00000563065 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.74■■□□□ 1.71
CCNDBP1-204ENST00000563065 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.74■■□□□ 1.71
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLIT1O75093 1534 aa25.74■■□□□ 1.71
CCNDBP1-204ENST00000563065 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CCNDBP1-204ENST00000563065 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.72■■□□□ 1.71
CCNDBP1-204ENST00000563065 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CCNDBP1-204ENST00000563065 EID1Q9Y6B2 187 aa25.71■■□□□ 1.71
CCNDBP1-204ENST00000563065 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CCNDBP1-204ENST00000563065 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CCNDBP1-204ENST00000563065 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.68■■□□□ 1.7
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.67■■□□□ 1.7
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