RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
MEIS3-212ENST00000561293 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.79■■■□□ 2.68
MEIS3-212ENST00000561293 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.78■■■□□ 2.68
MEIS3-212ENST00000561293 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
MEIS3-212ENST00000561293 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.77■■■□□ 2.68
MEIS3-212ENST00000561293 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.77■■■□□ 2.68
MEIS3-212ENST00000561293 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
MEIS3-212ENST00000561293 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.74■■■□□ 2.67
MEIS3-212ENST00000561293 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.74■■■□□ 2.67
MEIS3-212ENST00000561293 TRIM52Q96A61 297 aa31.73■■■□□ 2.67
MEIS3-212ENST00000561293 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
MEIS3-212ENST00000561293 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
MEIS3-212ENST00000561293 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.72■■■□□ 2.67
MEIS3-212ENST00000561293 NUP155O75694 1391 aa31.7■■■□□ 2.67
MEIS3-212ENST00000561293 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.66
MEIS3-212ENST00000561293 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
MEIS3-212ENST00000561293 DEPDC5O75140 1603 aa31.67■■■□□ 2.66
MEIS3-212ENST00000561293 CEP152O94986 1710 aa31.65■■■□□ 2.66
MEIS3-212ENST00000561293 ABCC3O15438 1527 aa31.65■■■□□ 2.66
MEIS3-212ENST00000561293 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.64■■■□□ 2.66
MEIS3-212ENST00000561293 PTPRMP28827 1452 aa31.64■■■□□ 2.66
MEIS3-212ENST00000561293 ZMYM3Q14202 1370 aa31.63■■■□□ 2.65
MEIS3-212ENST00000561293 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
MEIS3-212ENST00000561293 UNC13BO14795 1591 aa31.62■■■□□ 2.65
MEIS3-212ENST00000561293 KANK1Q14678 1352 aa31.62■■■□□ 2.65
MEIS3-212ENST00000561293 FOXD1Q16676 465 aa31.57■■■□□ 2.64
MEIS3-212ENST00000561293 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.57■■■□□ 2.64
MEIS3-212ENST00000561293 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.56■■■□□ 2.64
MEIS3-212ENST00000561293 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.56■■■□□ 2.64
MEIS3-212ENST00000561293 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.54■■■□□ 2.64
MEIS3-212ENST00000561293 C3P01024 1663 aa31.54■■■□□ 2.64
MEIS3-212ENST00000561293 PZPP20742 1482 aa31.52■■■□□ 2.64
MEIS3-212ENST00000561293 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
MEIS3-212ENST00000561293 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
MEIS3-212ENST00000561293 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.52■■■□□ 2.64
MEIS3-212ENST00000561293 NPATQ14207 1427 aa31.52■■■□□ 2.64
MEIS3-212ENST00000561293 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.5■■■□□ 2.63
MEIS3-212ENST00000561293 PKD2Q13563 968 aa31.47■■■□□ 2.63
MEIS3-212ENST00000561293 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
MEIS3-212ENST00000561293 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.46■■■□□ 2.63
MEIS3-212ENST00000561293 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.46■■■□□ 2.63
MEIS3-212ENST00000561293 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.45■■■□□ 2.63
MEIS3-212ENST00000561293 MROH2AA6NES4 1674 aa31.44■■■□□ 2.62
MEIS3-212ENST00000561293 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
MEIS3-212ENST00000561293 TET3O43151 1660 aa31.41■■■□□ 2.62
MEIS3-212ENST00000561293 E9PCH4 1651 aa31.41■■■□□ 2.62
MEIS3-212ENST00000561293 ERVK-7P63135 1459 aa31.37■■■□□ 2.61
MEIS3-212ENST00000561293 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.36■■■□□ 2.61
MEIS3-212ENST00000561293 HRCP23327 699 aa31.34■■■□□ 2.61
MEIS3-212ENST00000561293 TNRQ92752 1358 aa31.33■■■□□ 2.61
MEIS3-212ENST00000561293 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.33■■■□□ 2.61
MEIS3-212ENST00000561293 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.32■■■□□ 2.6
MEIS3-212ENST00000561293 SYNMO15061 1565 aa31.29■■■□□ 2.6
MEIS3-212ENST00000561293 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.29■■■□□ 2.6
MEIS3-212ENST00000561293 HSPA2P54652 639 aa31.28■■■□□ 2.6
MEIS3-212ENST00000561293 NOS1P29475 1434 aa31.27■■■□□ 2.6
MEIS3-212ENST00000561293 PLA2R1Q13018 1463 aa31.27■■■□□ 2.6
MEIS3-212ENST00000561293 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
MEIS3-212ENST00000561293 IDI1Q13907 227 aa31.26■■■□□ 2.59
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MEIS3-212ENST00000561293 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
MEIS3-212ENST00000561293 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.2■■■□□ 2.59
MEIS3-212ENST00000561293 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.19■■■□□ 2.58
MEIS3-212ENST00000561293 PTPRTO14522 1441 aa31.18■■■□□ 2.58
MEIS3-212ENST00000561293 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.17■■■□□ 2.58
MEIS3-212ENST00000561293 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
MEIS3-212ENST00000561293 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
MEIS3-212ENST00000561293 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.14■■■□□ 2.57
MEIS3-212ENST00000561293 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
MEIS3-212ENST00000561293 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
MEIS3-212ENST00000561293 PIK3C2BO00750 1634 aa31.12■■■□□ 2.57
MEIS3-212ENST00000561293 CLTCL1P53675 1640 aa31.12■■■□□ 2.57
MEIS3-212ENST00000561293 TRPM2O94759 1503 aa31.12■■■□□ 2.57
MEIS3-212ENST00000561293 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.11■■■□□ 2.57
MEIS3-212ENST00000561293 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.1■■■□□ 2.57
MEIS3-212ENST00000561293 NLRP1Q9C000 1473 aa31.09■■■□□ 2.57
MEIS3-212ENST00000561293 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
MEIS3-212ENST00000561293 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.09■■■□□ 2.57
MEIS3-212ENST00000561293 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.08■■■□□ 2.57
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC144AA2RUR9 1427 aa31.07■■■□□ 2.56
MEIS3-212ENST00000561293 RGL3Q3MIN7 710 aa31.04■■■□□ 2.56
MEIS3-212ENST00000561293 NEUROD1Q13562 356 aa31.02■■■□□ 2.56
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
MEIS3-212ENST00000561293 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.01■■■□□ 2.55
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
MEIS3-212ENST00000561293 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31■■■□□ 2.55
MEIS3-212ENST00000561293 ADGRB3O60242 1522 aa30.99■■■□□ 2.55
MEIS3-212ENST00000561293 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.98■■■□□ 2.55
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.98■■■□□ 2.55
MEIS3-212ENST00000561293 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
MEIS3-212ENST00000561293 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
MEIS3-212ENST00000561293 LTKP29376 864 aa30.95■■■□□ 2.55
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.91■■■□□ 2.54
MEIS3-212ENST00000561293 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.89■■■□□ 2.54
MEIS3-212ENST00000561293 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.89■■■□□ 2.54
MEIS3-212ENST00000561293 KIF1BO60333 1816 aa30.87■■■□□ 2.53
MEIS3-212ENST00000561293 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.86■■■□□ 2.53
MEIS3-212ENST00000561293 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.84■■■□□ 2.53
MEIS3-212ENST00000561293 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
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