RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559296.1

ZHX3-215, Transcript of zinc fingers and homeoboxes 3, humanhuman

TSL 5

Gene ZHX3, Length 258 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZHX3-215ENST00000559296 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.1■■■■□ 3.37
ZHX3-215ENST00000559296 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
ZHX3-215ENST00000559296 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.09■■■■□ 3.37
ZHX3-215ENST00000559296 KIF15Q9NS87 1388 aa36.09■■■■□ 3.37
ZHX3-215ENST00000559296 NPATQ14207 1427 aa36.08■■■■□ 3.37
ZHX3-215ENST00000559296 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.08■■■■□ 3.37
ZHX3-215ENST00000559296 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.08■■■■□ 3.37
ZHX3-215ENST00000559296 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
ZHX3-215ENST00000559296 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.05■■■■□ 3.36
ZHX3-215ENST00000559296 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.02■■■■□ 3.36
ZHX3-215ENST00000559296 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36■■■■□ 3.35
ZHX3-215ENST00000559296 STRCQ7RTU9 1775 aa35.99■■■■□ 3.35
ZHX3-215ENST00000559296 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.99■■■■□ 3.35
ZHX3-215ENST00000559296 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
ZHX3-215ENST00000559296 ABCC3O15438 1527 aa35.98■■■■□ 3.35
ZHX3-215ENST00000559296 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.97■■■■□ 3.35
ZHX3-215ENST00000559296 PZPP20742 1482 aa35.95■■■■□ 3.35
ZHX3-215ENST00000559296 NCOA1Q15788 1441 aa35.95■■■■□ 3.35
ZHX3-215ENST00000559296 ERBINQ96RT1 1412 aa35.95■■■■□ 3.35
ZHX3-215ENST00000559296 CEP152O94986 1710 aa35.94■■■■□ 3.34
ZHX3-215ENST00000559296 ADGRL2O95490 1459 aa35.92■■■■□ 3.34
ZHX3-215ENST00000559296 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.91■■■■□ 3.34
ZHX3-215ENST00000559296 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
ZHX3-215ENST00000559296 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
ZHX3-215ENST00000559296 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
ZHX3-215ENST00000559296 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
ZHX3-215ENST00000559296 TNRQ92752 1358 aa35.86■■■■□ 3.33
ZHX3-215ENST00000559296 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.86■■■■□ 3.33
ZHX3-215ENST00000559296 DEPDC5O75140 1603 aa35.85■■■■□ 3.33
ZHX3-215ENST00000559296 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.83■■■■□ 3.33
ZHX3-215ENST00000559296 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
ZHX3-215ENST00000559296 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
ZHX3-215ENST00000559296 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.79■■■■□ 3.32
ZHX3-215ENST00000559296 ITGAEP38570 1179 aa35.77■■■■□ 3.32
ZHX3-215ENST00000559296 ROCK1Q13464 1354 aa35.76■■■■□ 3.31
ZHX3-215ENST00000559296 ERVK-7P63135 1459 aa35.74■■■■□ 3.31
ZHX3-215ENST00000559296 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.74■■■■□ 3.31
ZHX3-215ENST00000559296 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.74■■■■□ 3.31
ZHX3-215ENST00000559296 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.74■■■■□ 3.31
ZHX3-215ENST00000559296 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.72■■■■□ 3.31
ZHX3-215ENST00000559296 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
ZHX3-215ENST00000559296 PLA2R1Q13018 1463 aa35.68■■■■□ 3.3
ZHX3-215ENST00000559296 PTPRTO14522 1441 aa35.68■■■■□ 3.3
ZHX3-215ENST00000559296 KANK1Q14678 1352 aa35.67■■■■□ 3.3
ZHX3-215ENST00000559296 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.67■■■■□ 3.3
ZHX3-215ENST00000559296 NLRP1Q9C000 1473 aa35.66■■■■□ 3.3
ZHX3-215ENST00000559296 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.66■■■■□ 3.3
ZHX3-215ENST00000559296 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.65■■■■□ 3.3
ZHX3-215ENST00000559296 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.6■■■■□ 3.29
ZHX3-215ENST00000559296 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.57■■■■□ 3.28
ZHX3-215ENST00000559296 UNC13BO14795 1591 aa35.56■■■■□ 3.28
ZHX3-215ENST00000559296 PKD2Q13563 968 aa35.56■■■■□ 3.28
ZHX3-215ENST00000559296 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.54■■■■□ 3.28
ZHX3-215ENST00000559296 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
ZHX3-215ENST00000559296 CERKQ8TCT0 537 aa35.52■■■■□ 3.28
ZHX3-215ENST00000559296 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.5■■■■□ 3.27
ZHX3-215ENST00000559296 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
ZHX3-215ENST00000559296 SYNMO15061 1565 aa35.49■■■■□ 3.27
ZHX3-215ENST00000559296 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.47■■■■□ 3.27
ZHX3-215ENST00000559296 TET3O43151 1660 aa35.47■■■■□ 3.27
ZHX3-215ENST00000559296 FBXO41Q8TF61 875 aa35.46■■■■□ 3.27
ZHX3-215ENST00000559296 PIK3C2BO00750 1634 aa35.46■■■■□ 3.27
ZHX3-215ENST00000559296 NOS1P29475 1434 aa35.44■■■■□ 3.26
ZHX3-215ENST00000559296 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
ZHX3-215ENST00000559296 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.42■■■■□ 3.26
ZHX3-215ENST00000559296 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.42■■■■□ 3.26
ZHX3-215ENST00000559296 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.41■■■■□ 3.26
ZHX3-215ENST00000559296 NAIPQ13075 1403 aa35.4■■■■□ 3.26
ZHX3-215ENST00000559296 IDI1Q13907 227 aa35.39■■■■□ 3.26
ZHX3-215ENST00000559296 E9PCH4 1651 aa35.38■■■■□ 3.25
ZHX3-215ENST00000559296 NUP155O75694 1391 aa35.38■■■■□ 3.25
ZHX3-215ENST00000559296 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
ZHX3-215ENST00000559296 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
ZHX3-215ENST00000559296 MED14O60244 1454 aa35.34■■■■□ 3.25
ZHX3-215ENST00000559296 HFM1A2PYH4 1435 aa35.33■■■■□ 3.25
ZHX3-215ENST00000559296 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.33■■■■□ 3.25
ZHX3-215ENST00000559296 SLIT1O75093 1534 aa35.32■■■■□ 3.24
ZHX3-215ENST00000559296 IQGAP1P46940 1657 aa35.31■■■■□ 3.24
ZHX3-215ENST00000559296 LTKP29376 864 aa35.31■■■■□ 3.24
ZHX3-215ENST00000559296 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
ZHX3-215ENST00000559296 ADGRB3O60242 1522 aa35.27■■■■□ 3.24
ZHX3-215ENST00000559296 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.27■■■■□ 3.24
ZHX3-215ENST00000559296 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
ZHX3-215ENST00000559296 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.25■■■■□ 3.23
ZHX3-215ENST00000559296 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.24■■■■□ 3.23
ZHX3-215ENST00000559296 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.24■■■■□ 3.23
ZHX3-215ENST00000559296 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.23■■■■□ 3.23
ZHX3-215ENST00000559296 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.15■■■■□ 3.22
ZHX3-215ENST00000559296 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.15■■■■□ 3.22
ZHX3-215ENST00000559296 EID1Q9Y6B2 187 aa35.14■■■■□ 3.22
ZHX3-215ENST00000559296 TRIM52Q96A61 297 aa35.13■■■■□ 3.21
ZHX3-215ENST00000559296 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.13■■■■□ 3.21
ZHX3-215ENST00000559296 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.1■■■■□ 3.21
ZHX3-215ENST00000559296 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
ZHX3-215ENST00000559296 CPS1P31327 1500 aa35.08■■■■□ 3.21
ZHX3-215ENST00000559296 ZFYVE9O95405 1425 aa35.07■■■■□ 3.21
ZHX3-215ENST00000559296 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
ZHX3-215ENST00000559296 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.04■■■■□ 3.2
ZHX3-215ENST00000559296 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.01■■■■□ 3.2
ZHX3-215ENST00000559296 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.7 ms