RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 UNC13BO14795 1591 aa25.23■■□□□ 1.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 REREQ9P2R6 1566 aa25.23■■□□□ 1.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUP155O75694 1391 aa25.23■■□□□ 1.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.22■■□□□ 1.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.2■■□□□ 1.63
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.19■■□□□ 1.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 DEPDC5O75140 1603 aa25.19■■□□□ 1.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 KANK1Q14678 1352 aa25.16■■□□□ 1.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 AGLP35573 1532 aa25.16■■□□□ 1.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 PZPP20742 1482 aa25.15■■□□□ 1.62
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.14■■□□□ 1.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.13■■□□□ 1.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 GGT6Q6P531 493 aa25.13■■□□□ 1.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.11■■□□□ 1.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 NEUROD1Q13562 356 aa25.1■■□□□ 1.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 FOXD1Q16676 465 aa25.1■■□□□ 1.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.1■■□□□ 1.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.08■■□□□ 1.61
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.08■■□□□ 1.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 PKD2Q13563 968 aa25.07■■□□□ 1.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.04■■□□□ 1.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.03■■□□□ 1.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 TET3O43151 1660 aa25.02■■□□□ 1.6
USP3-AS1-201ENST00000558831 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.01■■□□□ 1.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 MLECQ14165 292 aa25■■□□□ 1.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 CEP152O94986 1710 aa25■■□□□ 1.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCC3O15438 1527 aa25■■□□□ 1.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.97■■□□□ 1.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.95■■□□□ 1.59
USP3-AS1-201ENST00000558831 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 E9PCH4 1651 aa24.94■■□□□ 1.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.93■■□□□ 1.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 TONSLQ96HA7 1378 aa24.91■■□□□ 1.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.9■■□□□ 1.58
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPATQ14207 1427 aa24.87■■□□□ 1.57
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.87■■□□□ 1.57
USP3-AS1-201ENST00000558831 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.87■■□□□ 1.57
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.84■■□□□ 1.57
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTPRTO14522 1441 aa24.83■■□□□ 1.57
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLA2R1Q13018 1463 aa24.82■■□□□ 1.56
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.82■■□□□ 1.56
USP3-AS1-201ENST00000558831 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.81■■□□□ 1.56
USP3-AS1-201ENST00000558831 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRPM2O94759 1503 aa24.81■■□□□ 1.56
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZMYM3Q14202 1370 aa24.79■■□□□ 1.56
USP3-AS1-201ENST00000558831 MROH2AA6NES4 1674 aa24.79■■□□□ 1.56
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.75■■□□□ 1.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOS1P29475 1434 aa24.75■■□□□ 1.55
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USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.74■■□□□ 1.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 MADDQ8WXG6 1647 aa24.73■■□□□ 1.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERVK-7P63135 1459 aa24.72■■□□□ 1.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLTCL1P53675 1640 aa24.71■■□□□ 1.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYNMO15061 1565 aa24.69■■□□□ 1.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.69■■□□□ 1.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.68■■□□□ 1.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 C3P01024 1663 aa24.68■■□□□ 1.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.67■■□□□ 1.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIK3C2BO00750 1634 aa24.65■■□□□ 1.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 RGL3Q3MIN7 710 aa24.65■■□□□ 1.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF1BO60333 1816 aa24.65■■□□□ 1.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNRQ92752 1358 aa24.62■■□□□ 1.53
USP3-AS1-201ENST00000558831 IDI1Q13907 227 aa24.61■■□□□ 1.53
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.61■■□□□ 1.53
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.61■■□□□ 1.53
USP3-AS1-201ENST00000558831 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.6■■□□□ 1.53
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
USP3-AS1-201ENST00000558831 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.59■■□□□ 1.53
USP3-AS1-201ENST00000558831 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.59■■□□□ 1.53
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADGRB3O60242 1522 aa24.56■■□□□ 1.52
USP3-AS1-201ENST00000558831 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.54■■□□□ 1.52
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTPRMP28827 1452 aa24.54■■□□□ 1.52
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
USP3-AS1-201ENST00000558831 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.53■■□□□ 1.52
USP3-AS1-201ENST00000558831 NLRP1Q9C000 1473 aa24.53■■□□□ 1.52
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.51■■□□□ 1.51
USP3-AS1-201ENST00000558831 STAC3Q96MF2 364 aa24.49■■□□□ 1.51
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.48■■□□□ 1.51
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.47■■□□□ 1.51
USP3-AS1-201ENST00000558831 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
USP3-AS1-201ENST00000558831 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
USP3-AS1-201ENST00000558831 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.45■■□□□ 1.5
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.45■■□□□ 1.5
USP3-AS1-201ENST00000558831 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.45■■□□□ 1.5
USP3-AS1-201ENST00000558831 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.44■■□□□ 1.5
USP3-AS1-201ENST00000558831 IFT172Q9UG01 1749 aa24.43■■□□□ 1.5
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