RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557294.5

PRKCH-223, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-223	ENST00000557294	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	29.91	■■■□□ 2.38
PRKCH-223	ENST00000557294	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		29.9	■■■□□ 2.38
PRKCH-223	ENST00000557294	TNR	Q92752	1358 aa		29.9	■■■□□ 2.38
PRKCH-223	ENST00000557294	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		29.89	■■■□□ 2.38
PRKCH-223	ENST00000557294	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	29.87	■■■□□ 2.37
PRKCH-223	ENST00000557294	MBD5	Q9P267	1494 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PRKCH-223	ENST00000557294	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PRKCH-223	ENST00000557294	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		29.85	■■■□□ 2.37
PRKCH-223	ENST00000557294	KIF3B	O15066	747 aa		29.84	■■■□□ 2.37
PRKCH-223	ENST00000557294	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	29.84	■■■□□ 2.37
PRKCH-223	ENST00000557294	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	29.83	■■■□□ 2.37
PRKCH-223	ENST00000557294	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		29.81	■■■□□ 2.36
PRKCH-223	ENST00000557294	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
PRKCH-223	ENST00000557294	PZP	P20742	1482 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PRKCH-223	ENST00000557294	MIA2	Q96PC5	1412 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PRKCH-223	ENST00000557294	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PRKCH-223	ENST00000557294	MED14	O60244	1454 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PRKCH-223	ENST00000557294	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
PRKCH-223	ENST00000557294	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PRKCH-223	ENST00000557294	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PRKCH-223	ENST00000557294	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PRKCH-223	ENST00000557294	NLRP1	Q9C000	1473 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PRKCH-223	ENST00000557294	ALK	Q9UM73	1620 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PRKCH-223	ENST00000557294	TIAM1	Q13009	1591 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PRKCH-223	ENST00000557294	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PRKCH-223	ENST00000557294	DEPDC5	O75140	1603 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PRKCH-223	ENST00000557294	CEP162	Q5TB80	1403 aa		29.66	■■■□□ 2.34
PRKCH-223	ENST00000557294	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PRKCH-223	ENST00000557294	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		29.64	■■■□□ 2.34
PRKCH-223	ENST00000557294	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	29.63	■■■□□ 2.33
PRKCH-223	ENST00000557294	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		29.61	■■■□□ 2.33
PRKCH-223	ENST00000557294	TSPY4	P0CV99	314 aa		29.6	■■■□□ 2.33
PRKCH-223	ENST00000557294	TSPY10	P0CW01	314 aa		29.6	■■■□□ 2.33
PRKCH-223	ENST00000557294	IQGAP1	P46940	1657 aa		29.59	■■■□□ 2.33
PRKCH-223	ENST00000557294	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	29.58	■■■□□ 2.33
PRKCH-223	ENST00000557294	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		29.54	■■■□□ 2.32
PRKCH-223	ENST00000557294	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		29.54	■■■□□ 2.32
PRKCH-223	ENST00000557294	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	29.51	■■■□□ 2.31
PRKCH-223	ENST00000557294	SYNM	O15061	1565 aa		29.5	■■■□□ 2.31
PRKCH-223	ENST00000557294	NCOA2	Q15596	1464 aa		29.49	■■■□□ 2.31
PRKCH-223	ENST00000557294	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		29.46	■■■□□ 2.31
PRKCH-223	ENST00000557294	ABCC3	O15438	1527 aa		29.45	■■■□□ 2.31
PRKCH-223	ENST00000557294	ERVK-7	P63135	1459 aa		29.45	■■■□□ 2.31
PRKCH-223	ENST00000557294	LTK	P29376	864 aa		29.44	■■■□□ 2.3
PRKCH-223	ENST00000557294	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		29.44	■■■□□ 2.3
PRKCH-223	ENST00000557294	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	29.42	■■■□□ 2.3
PRKCH-223	ENST00000557294	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	29.41	■■■□□ 2.3
PRKCH-223	ENST00000557294	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		29.38	■■■□□ 2.29
PRKCH-223	ENST00000557294	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		29.36	■■■□□ 2.29
PRKCH-223	ENST00000557294	POTEA	Q6S8J7	498 aa		29.36	■■■□□ 2.29
PRKCH-223	ENST00000557294	EID1	Q9Y6B2	187 aa		29.36	■■■□□ 2.29
PRKCH-223	ENST00000557294	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		29.36	■■■□□ 2.29
PRKCH-223	ENST00000557294	SLIT1	O75093	1534 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PRKCH-223	ENST00000557294	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PRKCH-223	ENST00000557294	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	29.31	■■■□□ 2.28
PRKCH-223	ENST00000557294	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PRKCH-223	ENST00000557294	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PRKCH-223	ENST00000557294	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PRKCH-223	ENST00000557294	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	29.26	■■■□□ 2.27
PRKCH-223	ENST00000557294	TMEM94	Q12767	1356 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PRKCH-223	ENST00000557294	KCNA6	P17658	529 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PRKCH-223	ENST00000557294	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PRKCH-223	ENST00000557294	CEP152	O94986	1710 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PRKCH-223	ENST00000557294	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PRKCH-223	ENST00000557294	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PRKCH-223	ENST00000557294	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
PRKCH-223	ENST00000557294	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PRKCH-223	ENST00000557294	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PRKCH-223	ENST00000557294	IDI1	Q13907	227 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PRKCH-223	ENST00000557294	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PRKCH-223	ENST00000557294	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PRKCH-223	ENST00000557294	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	29.14	■■■□□ 2.26
PRKCH-223	ENST00000557294	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PRKCH-223	ENST00000557294	PIK3C2B	O00750	1634 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PRKCH-223	ENST00000557294	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PRKCH-223	ENST00000557294	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PRKCH-223	ENST00000557294	KIF15	Q9NS87	1388 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PRKCH-223	ENST00000557294	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
PRKCH-223	ENST00000557294	SLAIN2	Q9P270	581 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PRKCH-223	ENST00000557294	TET3	O43151	1660 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PRKCH-223	ENST00000557294	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PRKCH-223	ENST00000557294	MAP3K1	Q13233	1512 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PRKCH-223	ENST00000557294	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PRKCH-223	ENST00000557294	KANK1	Q14678	1352 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PRKCH-223	ENST00000557294	MSH6	P52701	1360 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PRKCH-223	ENST00000557294	JCAD	Q9P266	1359 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PRKCH-223	ENST00000557294	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
PRKCH-223	ENST00000557294	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
PRKCH-223	ENST00000557294	ABCC5	O15440	1437 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PRKCH-223	ENST00000557294	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PRKCH-223	ENST00000557294	BCAN	Q96GW7	911 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PRKCH-223	ENST00000557294	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		29	■■■□□ 2.23
PRKCH-223	ENST00000557294	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PRKCH-223	ENST00000557294	NWD1	Q149M9	1564 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PRKCH-223	ENST00000557294	NOS1	P29475	1434 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PRKCH-223	ENST00000557294	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	28.96	■■■□□ 2.23
PRKCH-223	ENST00000557294	PHLPP1	O60346	1717 aa		28.95	■■■□□ 2.23
PRKCH-223	ENST00000557294	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PRKCH-223	ENST00000557294	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PRKCH-223	ENST00000557294	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		28.94	■■■□□ 2.22

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