RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553944.2

ACTN1-AS1-201, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 484 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa12.47□□□□□ -0.41
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 YEATS2Q9ULM3 1422 aa12.46□□□□□ -0.41
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRIM52Q96A61 297 aa12.46□□□□□ -0.41
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 A2MP01023 1474 aa12.44□□□□□ -0.42
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CLSPNQ9HAW4 1339 aa12.43□□□□□ -0.42
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.43□□□□□ -0.42
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ABCA6Q8N139 1617 aa12.43□□□□□ -0.42
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa12.43□□□□□ -0.42
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ATP10AO60312 1499 aa12.42□□□□□ -0.42
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NUP155O75694 1391 aa12.41□□□□□ -0.42
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 UNC13BO14795 1591 aa12.4□□□□□ -0.42
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 REREQ9P2R6 1566 aa12.4□□□□□ -0.42
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KIF3BO15066 747 aa12.4□□□□□ -0.42
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ADRA2BP18089 450 aa12.4□□□□□ -0.42
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.4□□□□□ -0.42
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KDM5DQ9BY66 1539 aa12.39□□□□□ -0.43
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DEPDC5O75140 1603 aa12.38□□□□□ -0.43
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MLECQ14165 292 aa12.38□□□□□ -0.43
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KANK1Q14678 1352 aa12.38□□□□□ -0.43
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12.37□□□□□ -0.43
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LMTK3Q96Q04 1460 aa12.37□□□□□ -0.43
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IQGAP3Q86VI3 1631 aa12.36□□□□□ -0.43
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AGLP35573 1532 aa12.36□□□□□ -0.43
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PREX1Q8TCU6 1659 aa12.35□□□□□ -0.43
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PZPP20742 1482 aa12.35□□□□□ -0.43
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM135AQ9P2D6 1515 aa12.35□□□□□ -0.43
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GGT6Q6P531 493 aa12.33□□□□□ -0.44
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 VWDEQ8N2E2 1590 aa12.32□□□□□ -0.44
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PKD2Q13563 968 aa12.32□□□□□ -0.44
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MROH1Q8NDA8 1641 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C3P01024 1663 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TET3O43151 1660 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LMTK2Q8IWU2 1503 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa12.3□□□□□ -0.44
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MROH2AA6NES4 1674 aa12.27□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa12.27□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CEP152O94986 1710 aa12.27□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 E9PCH4 1651 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HSPA2P54652 639 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ABCC3O15438 1527 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MSH5O43196 834 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SIN3AQ96ST3 1273 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CNTLNQ9NXG0 1405 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NEUROD1Q13562 356 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EFCAB6Q5THR3 1501 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa12.22□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PTPRTO14522 1441 aa12.21□□□□□ -0.45
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCDC144AA2RUR9 1427 aa12.2□□□□□ -0.46
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TONSLQ96HA7 1378 aa12.2□□□□□ -0.46
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 STRCQ7RTU9 1775 aa12.2□□□□□ -0.46
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NPATQ14207 1427 aa12.2□□□□□ -0.46
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRPM2O94759 1503 aa12.19□□□□□ -0.46
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PLA2R1Q13018 1463 aa12.19□□□□□ -0.46
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FBXO41Q8TF61 875 aa12.18□□□□□ -0.46
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZMYM3Q14202 1370 aa12.18□□□□□ -0.46
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MYO3AQ8NEV4 1616 aa12.17□□□□□ -0.46
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NOS1P29475 1434 aa12.16□□□□□ -0.46
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC52A1Q9NWF4 448 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KIF1BO60333 1816 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NEURL4Q96JN8 1562 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CLTCL1P53675 1640 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 L3MBTL2Q969R5 705 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 STAC3Q96MF2 364 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ERVK-7P63135 1459 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PIK3C2BO00750 1634 aa12.11□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SYNMO15061 1565 aa12.1□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IDI1Q13907 227 aa12.09□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RGL3Q3MIN7 710 aa12.09□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CERKQ8TCT0 537 aa12.09□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa12.09□□□□□ -0.47
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DCAF11Q8TEB1 546 aa12.08□□□□□ -0.48
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 UGGT1Q9NYU2 1555 aa12.08□□□□□ -0.48
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa12.08□□□□□ -0.48
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