RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551430.6

CS-226, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-226ENST00000551430 PTPRKQ15262 1439 aa32.34■■■□□ 2.77
CS-226ENST00000551430 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
CS-226ENST00000551430 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.32■■■□□ 2.76
CS-226ENST00000551430 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.32■■■□□ 2.76
CS-226ENST00000551430 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.31■■■□□ 2.76
CS-226ENST00000551430 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
CS-226ENST00000551430 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.31■■■□□ 2.76
CS-226ENST00000551430 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.29■■■□□ 2.76
CS-226ENST00000551430 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
CS-226ENST00000551430 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.27■■■□□ 2.76
CS-226ENST00000551430 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.26■■■□□ 2.76
CS-226ENST00000551430 NCOA1Q15788 1441 aa32.25■■■□□ 2.75
CS-226ENST00000551430 ERBINQ96RT1 1412 aa32.24■■■□□ 2.75
CS-226ENST00000551430 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.23■■■□□ 2.75
CS-226ENST00000551430 ADGRL2O95490 1459 aa32.23■■■□□ 2.75
CS-226ENST00000551430 ABCC3O15438 1527 aa32.22■■■□□ 2.75
CS-226ENST00000551430 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
CS-226ENST00000551430 PZPP20742 1482 aa32.21■■■□□ 2.75
CS-226ENST00000551430 MYO3AQ8NEV4 1616 aa32.17■■■□□ 2.74
CS-226ENST00000551430 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
CS-226ENST00000551430 STRCQ7RTU9 1775 aa32.13■■■□□ 2.73
CS-226ENST00000551430 TNRQ92752 1358 aa32.12■■■□□ 2.73
CS-226ENST00000551430 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
CS-226ENST00000551430 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
CS-226ENST00000551430 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
CS-226ENST00000551430 DEPDC5O75140 1603 aa32.09■■■□□ 2.73
CS-226ENST00000551430 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.07■■■□□ 2.73
CS-226ENST00000551430 CEP152O94986 1710 aa32.07■■■□□ 2.72
CS-226ENST00000551430 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP32.06■■■□□ 2.726e-9■□□□□ 10
CS-226ENST00000551430 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.06■■■□□ 2.72
CS-226ENST00000551430 A2ML1A8K2U0 1454 aa32.05■■■□□ 2.72
CS-226ENST00000551430 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.04■■■□□ 2.72
CS-226ENST00000551430 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
CS-226ENST00000551430 ROCK1Q13464 1354 aa32.02■■■□□ 2.72
CS-226ENST00000551430 ERVK-7P63135 1459 aa32.02■■■□□ 2.72
CS-226ENST00000551430 VWDEQ8N2E2 1590 aa32.02■■■□□ 2.72
CS-226ENST00000551430 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa32.01■■■□□ 2.71
CS-226ENST00000551430 ITGAEP38570 1179 aa32■■■□□ 2.71
CS-226ENST00000551430 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.99■■■□□ 2.71
CS-226ENST00000551430 PLA2R1Q13018 1463 aa31.97■■■□□ 2.71
CS-226ENST00000551430 PTPRTO14522 1441 aa31.97■■■□□ 2.71
CS-226ENST00000551430 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.97■■■□□ 2.71
CS-226ENST00000551430 KANK1Q14678 1352 aa31.96■■■□□ 2.71
CS-226ENST00000551430 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.96■■■□□ 2.71
CS-226ENST00000551430 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.96■■■□□ 2.71
CS-226ENST00000551430 NLRP1Q9C000 1473 aa31.96■■■□□ 2.71
CS-226ENST00000551430 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
CS-226ENST00000551430 PKD2Q13563 968 aa31.87■■■□□ 2.69
CS-226ENST00000551430 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.86■■■□□ 2.69
CS-226ENST00000551430 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.85■■■□□ 2.69
CS-226ENST00000551430 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
CS-226ENST00000551430 UNC13BO14795 1591 aa31.84■■■□□ 2.69
CS-226ENST00000551430 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
CS-226ENST00000551430 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.79■■■□□ 2.68
CS-226ENST00000551430 NOS1P29475 1434 aa31.78■■■□□ 2.68
CS-226ENST00000551430 CERKQ8TCT0 537 aa31.78■■■□□ 2.68
CS-226ENST00000551430 SYNMO15061 1565 aa31.77■■■□□ 2.68
CS-226ENST00000551430 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.75■■■□□ 2.67
CS-226ENST00000551430 TET3O43151 1660 aa31.73■■■□□ 2.67
CS-226ENST00000551430 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.73■■■□□ 2.67
CS-226ENST00000551430 FBXO41Q8TF61 875 aa31.73■■■□□ 2.67
CS-226ENST00000551430 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.72■■■□□ 2.67
CS-226ENST00000551430 NAIPQ13075 1403 aa31.72■■■□□ 2.67
CS-226ENST00000551430 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
CS-226ENST00000551430 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
CS-226ENST00000551430 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
CS-226ENST00000551430 NUP155O75694 1391 aa31.7■■■□□ 2.67
CS-226ENST00000551430 IDI1Q13907 227 aa31.7■■■□□ 2.67
CS-226ENST00000551430 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.7■■■□□ 2.66
CS-226ENST00000551430 PIK3C2BO00750 1634 aa31.69■■■□□ 2.66
CS-226ENST00000551430 MED14O60244 1454 aa31.67■■■□□ 2.66
CS-226ENST00000551430 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.66■■■□□ 2.66
CS-226ENST00000551430 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.65■■■□□ 2.66
CS-226ENST00000551430 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
CS-226ENST00000551430 SLIT1O75093 1534 aa31.64■■■□□ 2.66
CS-226ENST00000551430 HFM1A2PYH4 1435 aa31.63■■■□□ 2.65
CS-226ENST00000551430 E9PCH4 1651 aa31.63■■■□□ 2.65
CS-226ENST00000551430 LTKP29376 864 aa31.62■■■□□ 2.65
CS-226ENST00000551430 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.6■■■□□ 2.65
CS-226ENST00000551430 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
CS-226ENST00000551430 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.59■■■□□ 2.65
CS-226ENST00000551430 ADGRB3O60242 1522 aa31.57■■■□□ 2.64
CS-226ENST00000551430 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.56■■■□□ 2.64
CS-226ENST00000551430 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
CS-226ENST00000551430 IQGAP1P46940 1657 aa31.55■■■□□ 2.64
CS-226ENST00000551430 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.55■■■□□ 2.64
CS-226ENST00000551430 EID1Q9Y6B2 187 aa31.48■■■□□ 2.63
CS-226ENST00000551430 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.47■■■□□ 2.63
CS-226ENST00000551430 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.46■■■□□ 2.63
CS-226ENST00000551430 ZFYVE9O95405 1425 aa31.44■■■□□ 2.62
CS-226ENST00000551430 TRIM52Q96A61 297 aa31.41■■■□□ 2.62
CS-226ENST00000551430 CPS1P31327 1500 aa31.4■■■□□ 2.62
CS-226ENST00000551430 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.4■■■□□ 2.62
CS-226ENST00000551430 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
CS-226ENST00000551430 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.38■■■□□ 2.61
CS-226ENST00000551430 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.37■■■□□ 2.61
CS-226ENST00000551430 STRCP1A6NGW2 1772 aa31.37■■■□□ 2.61
CS-226ENST00000551430 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
CS-226ENST00000551430 TRPM2O94759 1503 aa31.31■■■□□ 2.6
CS-226ENST00000551430 SLC26A8Q96RN1 970 aa31.31■■■□□ 2.6
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