RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 REREQ9P2R6 1566 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-216ENST00000549221 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 UNC13BO14795 1591 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 HRCP23327 699 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 DEPDC5O75140 1603 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 BCORL1Q5H9F3 1711 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 DISP3Q9P2K9 1392 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 PZPP20742 1482 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 KIF3BO15066 747 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 AGLP35573 1532 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 KDM5DQ9BY66 1539 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 VWDEQ8N2E2 1590 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 NUP155O75694 1391 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 TRIM52Q96A61 297 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12.09□□□□□ -0.476e-9■□□□□ 10
CS-216ENST00000549221 FAM135AQ9P2D6 1515 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-216ENST00000549221 IQGAP3Q86VI3 1631 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-216ENST00000549221 GGT6Q6P531 493 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-216ENST00000549221 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-216ENST00000549221 ABCC3O15438 1527 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-216ENST00000549221 CEP152O94986 1710 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-216ENST00000549221 FOXD1Q16676 465 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-216ENST00000549221 MLECQ14165 292 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-216ENST00000549221 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-216ENST00000549221 LMTK2Q8IWU2 1503 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-216ENST00000549221 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-216ENST00000549221 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-216ENST00000549221 TET3O43151 1660 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-216ENST00000549221 EFCAB6Q5THR3 1501 aa12.02□□□□□ -0.48
CS-216ENST00000549221 PKD2Q13563 968 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-216ENST00000549221 KANK1Q14678 1352 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-216ENST00000549221 E9PCH4 1651 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-216ENST00000549221 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
CS-216ENST00000549221 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa12□□□□□ -0.49
CS-216ENST00000549221 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CS-216ENST00000549221 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa12□□□□□ -0.49
CS-216ENST00000549221 PLA2R1Q13018 1463 aa12□□□□□ -0.49
CS-216ENST00000549221 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CS-216ENST00000549221 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-216ENST00000549221 NPATQ14207 1427 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-216ENST00000549221 MADDQ8WXG6 1647 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-216ENST00000549221 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-216ENST00000549221 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-216ENST00000549221 PPP6R1Q9UPN7 881 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-216ENST00000549221 ADAMTSL3P82987 1691 aa11.96□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 PTPRTO14522 1441 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 CLSPNQ9HAW4 1339 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 TRPM2O94759 1503 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 MROH2AA6NES4 1674 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 NOS1P29475 1434 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 CNTLNQ9NXG0 1405 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 ZMYM3Q14202 1370 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 SYNMO15061 1565 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 PREX1Q8TCU6 1659 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 ERVK-7P63135 1459 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 CLTCL1P53675 1640 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 C3P01024 1663 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 NEUROD1Q13562 356 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-216ENST00000549221 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-216ENST00000549221 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-216ENST00000549221 PIK3C2BO00750 1634 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-216ENST00000549221 PLPPR3Q6T4P5 718 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-216ENST00000549221 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-216ENST00000549221 PTPRMP28827 1452 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-216ENST00000549221 TNRQ92752 1358 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-216ENST00000549221 IDI1Q13907 227 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-216ENST00000549221 ADGRB3O60242 1522 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-216ENST00000549221 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-216ENST00000549221 TONSLQ96HA7 1378 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-216ENST00000549221 SLC52A1Q9NWF4 448 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-216ENST00000549221 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-216ENST00000549221 NEURL4Q96JN8 1562 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-216ENST00000549221 MYO3AQ8NEV4 1616 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-216ENST00000549221 RGL3Q3MIN7 710 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-216ENST00000549221 KIF1BO60333 1816 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-216ENST00000549221 MYO5BQ9ULV0 1848 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-216ENST00000549221 A2ML1A8K2U0 1454 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-216ENST00000549221 NLRP1Q9C000 1473 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-216ENST00000549221 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-216ENST00000549221 CERKQ8TCT0 537 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-216ENST00000549221 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 UBR1Q8IWV7 1749 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 IFT172Q9UG01 1749 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 NBPF8Q3BBV2 869 aa11.75□□□□□ -0.53
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