RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRB-205ENST00000547715 TIAM1Q13009 1591 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRB-205ENST00000547715 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRB-205ENST00000547715 TNRQ92752 1358 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRB-205ENST00000547715 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRB-205ENST00000547715 MBD5Q9P267 1494 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRB-205ENST00000547715 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRB-205ENST00000547715 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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PTPRB-205ENST00000547715 PZPP20742 1482 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRB-205ENST00000547715 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRB-205ENST00000547715 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
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PTPRB-205ENST00000547715 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRB-205ENST00000547715 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRB-205ENST00000547715 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRB-205ENST00000547715 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRB-205ENST00000547715 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.45■■□□□ 1.34
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PTPRB-205ENST00000547715 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.43■■□□□ 1.34
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PTPRB-205ENST00000547715 NLRP1Q9C000 1473 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRB-205ENST00000547715 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRB-205ENST00000547715 MIA2Q96PC5 1412 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRB-205ENST00000547715 ALKQ9UM73 1620 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRB-205ENST00000547715 CEP162Q5TB80 1403 aa23.42■■□□□ 1.34
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PTPRB-205ENST00000547715 MED14O60244 1454 aa23.41■■□□□ 1.34
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PTPRB-205ENST00000547715 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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PTPRB-205ENST00000547715 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
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PTPRB-205ENST00000547715 TSPY10P0CW01 314 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRB-205ENST00000547715 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRB-205ENST00000547715 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRB-205ENST00000547715 ABCC3O15438 1527 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRB-205ENST00000547715 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.25■■□□□ 1.31
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PTPRB-205ENST00000547715 CEP152O94986 1710 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRB-205ENST00000547715 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRB-205ENST00000547715 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
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PTPRB-205ENST00000547715 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
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PTPRB-205ENST00000547715 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
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PTPRB-205ENST00000547715 SLIT1O75093 1534 aa23.13■■□□□ 1.29
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PTPRB-205ENST00000547715 EID1Q9Y6B2 187 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRB-205ENST00000547715 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRB-205ENST00000547715 PIK3C2BO00750 1634 aa23.08■■□□□ 1.28
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PTPRB-205ENST00000547715 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PTPRB-205ENST00000547715 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRB-205ENST00000547715 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRB-205ENST00000547715 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRB-205ENST00000547715 POTEAQ6S8J7 498 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRB-205ENST00000547715 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM94Q12767 1356 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRB-205ENST00000547715 KIF15Q9NS87 1388 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRB-205ENST00000547715 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
PTPRB-205ENST00000547715 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRB-205ENST00000547715 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
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PTPRB-205ENST00000547715 ERBINQ96RT1 1412 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRB-205ENST00000547715 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRB-205ENST00000547715 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRB-205ENST00000547715 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRB-205ENST00000547715 MAP3K1Q13233 1512 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRB-205ENST00000547715 KCNA6P17658 529 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRB-205ENST00000547715 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRB-205ENST00000547715 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRB-205ENST00000547715 KANK1Q14678 1352 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRB-205ENST00000547715 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRB-205ENST00000547715 TET3O43151 1660 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRB-205ENST00000547715 IDI1Q13907 227 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRB-205ENST00000547715 PHLPP1O60346 1717 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRB-205ENST00000547715 ABCC5O15440 1437 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRB-205ENST00000547715 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRB-205ENST00000547715 NWD1Q149M9 1564 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRB-205ENST00000547715 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRB-205ENST00000547715 MSH6P52701 1360 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRB-205ENST00000547715 BCANQ96GW7 911 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRB-205ENST00000547715 ADGRB3O60242 1522 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRB-205ENST00000547715 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRB-205ENST00000547715 DAPK1P53355 1430 aa22.85■■□□□ 1.25
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PTPRB-205ENST00000547715 JCADQ9P266 1359 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRB-205ENST00000547715 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
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