RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544902.5

TFDP1-208, Transcript of transcription factor Dp-1, human

TSL 2

Gene TFDP1, Length 1,571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TFDP1-208	ENST00000544902	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.69	■■■□□ 2.98
TFDP1-208	ENST00000544902	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.68	■■■□□ 2.98
TFDP1-208	ENST00000544902	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.68	■■■□□ 2.98
TFDP1-208	ENST00000544902	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.67	■■■□□ 2.98
TFDP1-208	ENST00000544902	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.66	■■■□□ 2.98
TFDP1-208	ENST00000544902	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
TFDP1-208	ENST00000544902	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.61	■■■□□ 2.97
TFDP1-208	ENST00000544902	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.6	■■■□□ 2.97	2e-12	■■■□□ 16
TFDP1-208	ENST00000544902	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TFDP1-208	ENST00000544902	C3	P01024	1663 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TFDP1-208	ENST00000544902	NAIP	Q13075	1403 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TFDP1-208	ENST00000544902	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TFDP1-208	ENST00000544902	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TFDP1-208	ENST00000544902	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TFDP1-208	ENST00000544902	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.57	■■■□□ 2.96
TFDP1-208	ENST00000544902	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
TFDP1-208	ENST00000544902	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.55	■■■□□ 2.96
TFDP1-208	ENST00000544902	CEP152	O94986	1710 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TFDP1-208	ENST00000544902	ABCC3	O15438	1527 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TFDP1-208	ENST00000544902	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TFDP1-208	ENST00000544902	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.52	■■■□□ 2.96
TFDP1-208	ENST00000544902	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.49	■■■□□ 2.95
TFDP1-208	ENST00000544902	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TFDP1-208	ENST00000544902	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
TFDP1-208	ENST00000544902	UNC13B	O14795	1591 aa		33.45	■■■□□ 2.95
TFDP1-208	ENST00000544902	KANK1	Q14678	1352 aa		33.43	■■■□□ 2.94
TFDP1-208	ENST00000544902	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
TFDP1-208	ENST00000544902	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.42	■■■□□ 2.94
TFDP1-208	ENST00000544902	PZP	P20742	1482 aa		33.39	■■■□□ 2.93
TFDP1-208	ENST00000544902	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TFDP1-208	ENST00000544902	NUP155	O75694	1391 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TFDP1-208	ENST00000544902	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
TFDP1-208	ENST00000544902	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
TFDP1-208	ENST00000544902	NPAT	Q14207	1427 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TFDP1-208	ENST00000544902	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.32	■■■□□ 2.92
TFDP1-208	ENST00000544902	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TFDP1-208	ENST00000544902	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TFDP1-208	ENST00000544902	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TFDP1-208	ENST00000544902	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TFDP1-208	ENST00000544902	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TFDP1-208	ENST00000544902	TET3	O43151	1660 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TFDP1-208	ENST00000544902	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.26	■■■□□ 2.92
TFDP1-208	ENST00000544902	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.26	■■■□□ 2.91
TFDP1-208	ENST00000544902	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TFDP1-208	ENST00000544902	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TFDP1-208	ENST00000544902	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TFDP1-208	ENST00000544902	TNR	Q92752	1358 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TFDP1-208	ENST00000544902		E9PCH4	1651 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TFDP1-208	ENST00000544902	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TFDP1-208	ENST00000544902	HSPA2	P54652	639 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TFDP1-208	ENST00000544902	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
TFDP1-208	ENST00000544902	NOS1	P29475	1434 aa		33.14	■■■□□ 2.9
TFDP1-208	ENST00000544902	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
TFDP1-208	ENST00000544902	SYNM	O15061	1565 aa		33.13	■■■□□ 2.89
TFDP1-208	ENST00000544902	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
TFDP1-208	ENST00000544902	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
TFDP1-208	ENST00000544902	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
TFDP1-208	ENST00000544902	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TFDP1-208	ENST00000544902	PKD2	Q13563	968 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TFDP1-208	ENST00000544902	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TFDP1-208	ENST00000544902	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TFDP1-208	ENST00000544902	IDI1	Q13907	227 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TFDP1-208	ENST00000544902	FOXD1	Q16676	465 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TFDP1-208	ENST00000544902	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.03	■■■□□ 2.88
TFDP1-208	ENST00000544902	HRC	P23327	699 aa		33.01	■■■□□ 2.88
TFDP1-208	ENST00000544902	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33	■■■□□ 2.87
TFDP1-208	ENST00000544902	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TFDP1-208	ENST00000544902	PTPRT	O14522	1441 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TFDP1-208	ENST00000544902	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TFDP1-208	ENST00000544902	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TFDP1-208	ENST00000544902	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.95	■■■□□ 2.86
TFDP1-208	ENST00000544902	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
TFDP1-208	ENST00000544902	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TFDP1-208	ENST00000544902	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
TFDP1-208	ENST00000544902	TRPM2	O94759	1503 aa		32.89	■■■□□ 2.86
TFDP1-208	ENST00000544902	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.87	■■■□□ 2.85
TFDP1-208	ENST00000544902	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.87	■■■□□ 2.85
TFDP1-208	ENST00000544902	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.87	■■■□□ 2.85
TFDP1-208	ENST00000544902	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.86	■■■□□ 2.85
TFDP1-208	ENST00000544902	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.85	■■■□□ 2.85
TFDP1-208	ENST00000544902	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.84	■■■□□ 2.85
TFDP1-208	ENST00000544902	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
TFDP1-208	ENST00000544902	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TFDP1-208	ENST00000544902	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
TFDP1-208	ENST00000544902	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TFDP1-208	ENST00000544902	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TFDP1-208	ENST00000544902	SLIT1	O75093	1534 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TFDP1-208	ENST00000544902	LTK	P29376	864 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TFDP1-208	ENST00000544902	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TFDP1-208	ENST00000544902	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
TFDP1-208	ENST00000544902	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TFDP1-208	ENST00000544902	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TFDP1-208	ENST00000544902	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TFDP1-208	ENST00000544902	KIF1B	O60333	1816 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TFDP1-208	ENST00000544902	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TFDP1-208	ENST00000544902	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TFDP1-208	ENST00000544902	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
TFDP1-208	ENST00000544902	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
TFDP1-208	ENST00000544902	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TFDP1-208	ENST00000544902	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.65	■■■□□ 2.82

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