RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541434.5

CADM1-211, Transcript of cell adhesion molecule 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CADM1, Length 1,112 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1-211ENST00000541434 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CADM1-211ENST00000541434 AGLP35573 1532 aa23.3■■□□□ 1.32
CADM1-211ENST00000541434 MLECQ14165 292 aa23.28■■□□□ 1.32
CADM1-211ENST00000541434 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.27■■□□□ 1.32
CADM1-211ENST00000541434 KANK1Q14678 1352 aa23.27■■□□□ 1.31
CADM1-211ENST00000541434 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CADM1-211ENST00000541434 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.25■■□□□ 1.31
CADM1-211ENST00000541434 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.25■■□□□ 1.31
CADM1-211ENST00000541434 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.24■■□□□ 1.31
CADM1-211ENST00000541434 UNC13BO14795 1591 aa23.23■■□□□ 1.31
CADM1-211ENST00000541434 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.23■■□□□ 1.31
CADM1-211ENST00000541434 DEPDC5O75140 1603 aa23.22■■□□□ 1.31
CADM1-211ENST00000541434 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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CADM1-211ENST00000541434 PZPP20742 1482 aa23.2■■□□□ 1.3
CADM1-211ENST00000541434 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CADM1-211ENST00000541434 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.19■■□□□ 1.3
CADM1-211ENST00000541434 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.19■■□□□ 1.3
CADM1-211ENST00000541434 PKD2Q13563 968 aa23.18■■□□□ 1.3
CADM1-211ENST00000541434 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CADM1-211ENST00000541434 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.18■■□□□ 1.3
CADM1-211ENST00000541434 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CADM1-211ENST00000541434 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.16■■□□□ 1.3
CADM1-211ENST00000541434 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.15■■□□□ 1.3
CADM1-211ENST00000541434 FOXD1Q16676 465 aa23.14■■□□□ 1.29
CADM1-211ENST00000541434 ABCC3O15438 1527 aa23.11■■□□□ 1.29
CADM1-211ENST00000541434 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.1■■□□□ 1.29
CADM1-211ENST00000541434 CEP152O94986 1710 aa23.07■■□□□ 1.28
CADM1-211ENST00000541434 TET3O43151 1660 aa23.06■■□□□ 1.28
CADM1-211ENST00000541434 ZMYM3Q14202 1370 aa23.04■■□□□ 1.28
CADM1-211ENST00000541434 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CADM1-211ENST00000541434 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.04■■□□□ 1.28
CADM1-211ENST00000541434 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.04■■□□□ 1.28
CADM1-211ENST00000541434 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CADM1-211ENST00000541434 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.02■■□□□ 1.28
CADM1-211ENST00000541434 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.02■■□□□ 1.28
CADM1-211ENST00000541434 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.02■■□□□ 1.28
CADM1-211ENST00000541434 NPATQ14207 1427 aa23.01■■□□□ 1.27
CADM1-211ENST00000541434 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23■■□□□ 1.27
CADM1-211ENST00000541434 E9PCH4 1651 aa23■■□□□ 1.27
CADM1-211ENST00000541434 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CADM1-211ENST00000541434 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.99■■□□□ 1.27
CADM1-211ENST00000541434 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CADM1-211ENST00000541434 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CADM1-211ENST00000541434 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.97■■□□□ 1.27
CADM1-211ENST00000541434 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CADM1-211ENST00000541434 NEUROD1Q13562 356 aa22.96■■□□□ 1.27
CADM1-211ENST00000541434 PTPRTO14522 1441 aa22.96■■□□□ 1.27
CADM1-211ENST00000541434 PLA2R1Q13018 1463 aa22.96■■□□□ 1.27
CADM1-211ENST00000541434 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.96■■□□□ 1.27
CADM1-211ENST00000541434 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.94■■□□□ 1.26
CADM1-211ENST00000541434 MADDQ8WXG6 1647 aa22.93■■□□□ 1.26
CADM1-211ENST00000541434 MROH2AA6NES4 1674 aa22.92■■□□□ 1.26
CADM1-211ENST00000541434 NOS1P29475 1434 aa22.91■■□□□ 1.26
CADM1-211ENST00000541434 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.89■■□□□ 1.25
CADM1-211ENST00000541434 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CADM1-211ENST00000541434 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.89■■□□□ 1.25
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CADM1-211ENST00000541434 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.88■■□□□ 1.25
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CADM1-211ENST00000541434 TRPM2O94759 1503 aa22.87■■□□□ 1.25
CADM1-211ENST00000541434 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.86■■□□□ 1.25
CADM1-211ENST00000541434 C3P01024 1663 aa22.85■■□□□ 1.25
CADM1-211ENST00000541434 IDI1Q13907 227 aa22.85■■□□□ 1.25
CADM1-211ENST00000541434 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.84■■□□□ 1.25
CADM1-211ENST00000541434 TNRQ92752 1358 aa22.83■■□□□ 1.25
CADM1-211ENST00000541434 PTPRMP28827 1452 aa22.83■■□□□ 1.25
CADM1-211ENST00000541434 SYNMO15061 1565 aa22.81■■□□□ 1.24
CADM1-211ENST00000541434 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CADM1-211ENST00000541434 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.8■■□□□ 1.24
CADM1-211ENST00000541434 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CADM1-211ENST00000541434 RGL3Q3MIN7 710 aa22.79■■□□□ 1.24
CADM1-211ENST00000541434 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.79■■□□□ 1.24
CADM1-211ENST00000541434 CLTCL1P53675 1640 aa22.79■■□□□ 1.24
CADM1-211ENST00000541434 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.77■■□□□ 1.24
CADM1-211ENST00000541434 TONSLQ96HA7 1378 aa22.76■■□□□ 1.23
CADM1-211ENST00000541434 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.76■■□□□ 1.23
CADM1-211ENST00000541434 PIK3C2BO00750 1634 aa22.75■■□□□ 1.23
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CADM1-211ENST00000541434 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.73■■□□□ 1.23
CADM1-211ENST00000541434 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
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CADM1-211ENST00000541434 NLRP1Q9C000 1473 aa22.71■■□□□ 1.23
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CADM1-211ENST00000541434 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.68■■□□□ 1.22
CADM1-211ENST00000541434 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.67■■□□□ 1.22
CADM1-211ENST00000541434 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CADM1-211ENST00000541434 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.66■■□□□ 1.22
CADM1-211ENST00000541434 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.65■■□□□ 1.22
CADM1-211ENST00000541434 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CADM1-211ENST00000541434 ADGRB3O60242 1522 aa22.64■■□□□ 1.21
CADM1-211ENST00000541434 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.64■■□□□ 1.21
CADM1-211ENST00000541434 STAC3Q96MF2 364 aa22.63■■□□□ 1.21
CADM1-211ENST00000541434 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CADM1-211ENST00000541434 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.6■■□□□ 1.21
CADM1-211ENST00000541434 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.6■■□□□ 1.21
CADM1-211ENST00000541434 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.59■■□□□ 1.21
CADM1-211ENST00000541434 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CADM1-211ENST00000541434 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CADM1-211ENST00000541434 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.58■■□□□ 1.21
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