RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540468.5

CCT7-216, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 7, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCT7, Length 1,674 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT7-216ENST00000540468 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
CCT7-216ENST00000540468 KIF3BO15066 747 aa23.63■■□□□ 1.37
CCT7-216ENST00000540468 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CCT7-216ENST00000540468 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.6■■□□□ 1.37
CCT7-216ENST00000540468 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CCT7-216ENST00000540468 MLECQ14165 292 aa23.58■■□□□ 1.37
CCT7-216ENST00000540468 DEPDC5O75140 1603 aa23.58■■□□□ 1.37
CCT7-216ENST00000540468 GGT6Q6P531 493 aa23.56■■□□□ 1.36
CCT7-216ENST00000540468 UNC13BO14795 1591 aa23.55■■□□□ 1.36
CCT7-216ENST00000540468 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CCT7-216ENST00000540468 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CCT7-216ENST00000540468 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.353e-6■■■□□ 19
CCT7-216ENST00000540468 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.5■■□□□ 1.35
CCT7-216ENST00000540468 CEP152O94986 1710 aa23.49■■□□□ 1.35
CCT7-216ENST00000540468 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.48■■□□□ 1.35
CCT7-216ENST00000540468 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.47■■□□□ 1.35
CCT7-216ENST00000540468 MADDQ8WXG6 1647 aa23.47■■□□□ 1.35
CCT7-216ENST00000540468 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CCT7-216ENST00000540468 NUP155O75694 1391 aa23.45■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.45■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 ABCC3O15438 1527 aa23.45■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.44■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 TRIM52Q96A61 297 aa23.44■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 PZPP20742 1482 aa23.42■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.41■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.41■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.41■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 KANK1Q14678 1352 aa23.41■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.4■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.4■■□□□ 1.34
CCT7-216ENST00000540468 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.39■■□□□ 1.33
CCT7-216ENST00000540468 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.39■■□□□ 1.33
CCT7-216ENST00000540468 TET3O43151 1660 aa23.37■■□□□ 1.33
CCT7-216ENST00000540468 MROH2AA6NES4 1674 aa23.36■■□□□ 1.33
CCT7-216ENST00000540468 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CCT7-216ENST00000540468 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.34■■□□□ 1.33
CCT7-216ENST00000540468 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.34■■□□□ 1.33
CCT7-216ENST00000540468 E9PCH4 1651 aa23.34■■□□□ 1.33
CCT7-216ENST00000540468 C3P01024 1663 aa23.34■■□□□ 1.33
CCT7-216ENST00000540468 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CCT7-216ENST00000540468 ZMYM3Q14202 1370 aa23.32■■□□□ 1.32
CCT7-216ENST00000540468 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.32■■□□□ 1.32
CCT7-216ENST00000540468 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CCT7-216ENST00000540468 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CCT7-216ENST00000540468 NPATQ14207 1427 aa23.31■■□□□ 1.32
CCT7-216ENST00000540468 PTPRMP28827 1452 aa23.29■■□□□ 1.32
CCT7-216ENST00000540468 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.29■■□□□ 1.32
CCT7-216ENST00000540468 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.28■■□□□ 1.32
CCT7-216ENST00000540468 NEUROD1Q13562 356 aa23.28■■□□□ 1.32
CCT7-216ENST00000540468 PKD2Q13563 968 aa23.28■■□□□ 1.32
CCT7-216ENST00000540468 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.28■■□□□ 1.32
CCT7-216ENST00000540468 FOXD1Q16676 465 aa23.27■■□□□ 1.32
CCT7-216ENST00000540468 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CCT7-216ENST00000540468 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.25■■□□□ 1.31
CCT7-216ENST00000540468 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CCT7-216ENST00000540468 ERVK-7P63135 1459 aa23.21■■□□□ 1.31
CCT7-216ENST00000540468 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.2■■□□□ 1.3
CCT7-216ENST00000540468 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.19■■□□□ 1.3
CCT7-216ENST00000540468 SYNMO15061 1565 aa23.19■■□□□ 1.3
CCT7-216ENST00000540468 PLA2R1Q13018 1463 aa23.19■■□□□ 1.3
CCT7-216ENST00000540468 TONSLQ96HA7 1378 aa23.19■■□□□ 1.3
CCT7-216ENST00000540468 NOS1P29475 1434 aa23.18■■□□□ 1.3
CCT7-216ENST00000540468 PTPRTO14522 1441 aa23.16■■□□□ 1.3
CCT7-216ENST00000540468 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.15■■□□□ 1.3
CCT7-216ENST00000540468 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CCT7-216ENST00000540468 TNRQ92752 1358 aa23.13■■□□□ 1.29
CCT7-216ENST00000540468 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CCT7-216ENST00000540468 TRPM2O94759 1503 aa23.12■■□□□ 1.29
CCT7-216ENST00000540468 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.12■■□□□ 1.29
CCT7-216ENST00000540468 PIK3C2BO00750 1634 aa23.1■■□□□ 1.29
CCT7-216ENST00000540468 CLTCL1P53675 1640 aa23.1■■□□□ 1.29
CCT7-216ENST00000540468 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.09■■□□□ 1.29
CCT7-216ENST00000540468 IDI1Q13907 227 aa23.06■■□□□ 1.28
CCT7-216ENST00000540468 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.04■■□□□ 1.28
CCT7-216ENST00000540468 NLRP1Q9C000 1473 aa23.02■■□□□ 1.28
CCT7-216ENST00000540468 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.01■■□□□ 1.27
CCT7-216ENST00000540468 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.01■■□□□ 1.27
CCT7-216ENST00000540468 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CCT7-216ENST00000540468 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CCT7-216ENST00000540468 KIF1BO60333 1816 aa23■■□□□ 1.27
CCT7-216ENST00000540468 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.99■■□□□ 1.27
CCT7-216ENST00000540468 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.99■■□□□ 1.27
CCT7-216ENST00000540468 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.99■■□□□ 1.27
CCT7-216ENST00000540468 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.98■■□□□ 1.27
CCT7-216ENST00000540468 ADGRB3O60242 1522 aa22.97■■□□□ 1.27
CCT7-216ENST00000540468 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.95■■□□□ 1.26
CCT7-216ENST00000540468 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CCT7-216ENST00000540468 MIER1Q8N108 512 aa22.94■■□□□ 1.26
CCT7-216ENST00000540468 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CCT7-216ENST00000540468 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.93■■□□□ 1.26
CCT7-216ENST00000540468 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.9■■□□□ 1.26
CCT7-216ENST00000540468 HSPA2P54652 639 aa22.87■■□□□ 1.25
CCT7-216ENST00000540468 RGL3Q3MIN7 710 aa22.87■■□□□ 1.25
CCT7-216ENST00000540468 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.87■■□□□ 1.25
CCT7-216ENST00000540468 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CCT7-216ENST00000540468 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms