RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533817.5

TSTA3-216, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-216ENST00000533817 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TSTA3-216ENST00000533817 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.67■■□□□ 1.22
TSTA3-216ENST00000533817 ROCK1Q13464 1354 aa22.66■■□□□ 1.22
TSTA3-216ENST00000533817 C3P01024 1663 aa22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-216ENST00000533817 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-216ENST00000533817 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-216ENST00000533817 ITGAEP38570 1179 aa22.64■■□□□ 1.21
TSTA3-216ENST00000533817 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TSTA3-216ENST00000533817 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.62■■□□□ 1.21
TSTA3-216ENST00000533817 DEPDC5O75140 1603 aa22.62■■□□□ 1.21
TSTA3-216ENST00000533817 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TSTA3-216ENST00000533817 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TSTA3-216ENST00000533817 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.59■■□□□ 1.21
TSTA3-216ENST00000533817 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.59■■□□□ 1.21
TSTA3-216ENST00000533817 ZMYM3Q14202 1370 aa22.59■■□□□ 1.21
TSTA3-216ENST00000533817 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
TSTA3-216ENST00000533817 ABCC3O15438 1527 aa22.57■■□□□ 1.2
TSTA3-216ENST00000533817 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.55■■□□□ 1.2
TSTA3-216ENST00000533817 CEP152O94986 1710 aa22.54■■□□□ 1.2
TSTA3-216ENST00000533817 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.53■■□□□ 1.2
TSTA3-216ENST00000533817 NPATQ14207 1427 aa22.51■■□□□ 1.19
TSTA3-216ENST00000533817 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.51■■□□□ 1.19
TSTA3-216ENST00000533817 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.51■■□□□ 1.19
TSTA3-216ENST00000533817 UNC13BO14795 1591 aa22.5■■□□□ 1.19
TSTA3-216ENST00000533817 PZPP20742 1482 aa22.5■■□□□ 1.19
TSTA3-216ENST00000533817 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.5■■□□□ 1.19
TSTA3-216ENST00000533817 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TSTA3-216ENST00000533817 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.49■■□□□ 1.19
TSTA3-216ENST00000533817 NAIPQ13075 1403 aa22.49■■□□□ 1.19
TSTA3-216ENST00000533817 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.48■■□□□ 1.19
TSTA3-216ENST00000533817 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.194e-6■■■■□ 19.8
TSTA3-216ENST00000533817 KANK1Q14678 1352 aa22.47■■□□□ 1.19
TSTA3-216ENST00000533817 HFM1A2PYH4 1435 aa22.47■■□□□ 1.19
TSTA3-216ENST00000533817 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-216ENST00000533817 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-216ENST00000533817 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-216ENST00000533817 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-216ENST00000533817 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-216ENST00000533817 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-216ENST00000533817 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-216ENST00000533817 ERVK-7P63135 1459 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-216ENST00000533817 TET3O43151 1660 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-216ENST00000533817 TNRQ92752 1358 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-216ENST00000533817 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-216ENST00000533817 NUP155O75694 1391 aa22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-216ENST00000533817 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-216ENST00000533817 HSPA2P54652 639 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-216ENST00000533817 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-216ENST00000533817 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-216ENST00000533817 E9PCH4 1651 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-216ENST00000533817 NLRP1Q9C000 1473 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-216ENST00000533817 NOS1P29475 1434 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-216ENST00000533817 SYNMO15061 1565 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-216ENST00000533817 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-216ENST00000533817 STRCQ7RTU9 1775 aa22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-216ENST00000533817 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-216ENST00000533817 TRIM52Q96A61 297 aa22.22■■□□□ 1.15
TSTA3-216ENST00000533817 PLA2R1Q13018 1463 aa22.21■■□□□ 1.15
TSTA3-216ENST00000533817 PIK3C2BO00750 1634 aa22.2■■□□□ 1.15
TSTA3-216ENST00000533817 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.2■■□□□ 1.14
TSTA3-216ENST00000533817 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.2■■□□□ 1.14
TSTA3-216ENST00000533817 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.17■■□□□ 1.14
TSTA3-216ENST00000533817 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TSTA3-216ENST00000533817 IDI1Q13907 227 aa22.16■■□□□ 1.14
TSTA3-216ENST00000533817 PTPRTO14522 1441 aa22.15■■□□□ 1.14
TSTA3-216ENST00000533817 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.15■■□□□ 1.14
TSTA3-216ENST00000533817 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TSTA3-216ENST00000533817 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TSTA3-216ENST00000533817 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TSTA3-216ENST00000533817 ADGRB3O60242 1522 aa22.14■■□□□ 1.13
TSTA3-216ENST00000533817 PKD2Q13563 968 aa22.13■■□□□ 1.13
TSTA3-216ENST00000533817 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-216ENST00000533817 TRPM2O94759 1503 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-216ENST00000533817 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-216ENST00000533817 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-216ENST00000533817 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-216ENST00000533817 SLIT1O75093 1534 aa22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-216ENST00000533817 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-216ENST00000533817 HRCP23327 699 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-216ENST00000533817 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-216ENST00000533817 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.08■■□□□ 1.13
TSTA3-216ENST00000533817 CLTCL1P53675 1640 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-216ENST00000533817 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-216ENST00000533817 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-216ENST00000533817 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-216ENST00000533817 MED14O60244 1454 aa22.04■■□□□ 1.12
TSTA3-216ENST00000533817 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.04■■□□□ 1.12
TSTA3-216ENST00000533817 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TSTA3-216ENST00000533817 FOXD1Q16676 465 aa22.03■■□□□ 1.12
TSTA3-216ENST00000533817 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TSTA3-216ENST00000533817 LTKP29376 864 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-216ENST00000533817 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-216ENST00000533817 ZFYVE9O95405 1425 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-216ENST00000533817 IQGAP1P46940 1657 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-216ENST00000533817 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-216ENST00000533817 KIF1BO60333 1816 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-216ENST00000533817 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-216ENST00000533817 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-216ENST00000533817 EID1Q9Y6B2 187 aa21.95■■□□□ 1.1
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