RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533379.1

TIMM10B-205, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 10B, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM10B, Length 608 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM10B-205ENST00000533379 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.35■□□□□ 0.53
TIMM10B-205ENST00000533379 MBD5Q9P267 1494 aa18.34■□□□□ 0.53
TIMM10B-205ENST00000533379 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
TIMM10B-205ENST00000533379 TNRQ92752 1358 aa18.31■□□□□ 0.52
TIMM10B-205ENST00000533379 KIF3BO15066 747 aa18.31■□□□□ 0.52
TIMM10B-205ENST00000533379 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.31■□□□□ 0.52
TIMM10B-205ENST00000533379 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
TIMM10B-205ENST00000533379 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
TIMM10B-205ENST00000533379 ALKQ9UM73 1620 aa18.28■□□□□ 0.52
TIMM10B-205ENST00000533379 VWDEQ8N2E2 1590 aa18.28■□□□□ 0.52
TIMM10B-205ENST00000533379 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TIMM10B-205ENST00000533379 TOM1O60784 492 aa18.27■□□□□ 0.52
TIMM10B-205ENST00000533379 STRCP1A6NGW2 1772 aa18.27■□□□□ 0.51
TIMM10B-205ENST00000533379 CPS1P31327 1500 aa18.26■□□□□ 0.51
TIMM10B-205ENST00000533379 PZPP20742 1482 aa18.26■□□□□ 0.51
TIMM10B-205ENST00000533379 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.25■□□□□ 0.51
TIMM10B-205ENST00000533379 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM10B-205ENST00000533379 KDM5DQ9BY66 1539 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM10B-205ENST00000533379 ANKLE2Q86XL3 938 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM10B-205ENST00000533379 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM10B-205ENST00000533379 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TIMM10B-205ENST00000533379 MIA2Q96PC5 1412 aa18.22■□□□□ 0.51
TIMM10B-205ENST00000533379 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.21■□□□□ 0.51
TIMM10B-205ENST00000533379 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.21■□□□□ 0.51
TIMM10B-205ENST00000533379 CEP162Q5TB80 1403 aa18.21■□□□□ 0.51
TIMM10B-205ENST00000533379 UGGT1Q9NYU2 1555 aa18.21■□□□□ 0.51
TIMM10B-205ENST00000533379 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
TIMM10B-205ENST00000533379 IQGAP1P46940 1657 aa18.19■□□□□ 0.5
TIMM10B-205ENST00000533379 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TIMM10B-205ENST00000533379 DEPDC5O75140 1603 aa18.18■□□□□ 0.5
TIMM10B-205ENST00000533379 MED14O60244 1454 aa18.17■□□□□ 0.5
TIMM10B-205ENST00000533379 NCOA2Q15596 1464 aa18.17■□□□□ 0.5
TIMM10B-205ENST00000533379 NLRP1Q9C000 1473 aa18.16■□□□□ 0.5
TIMM10B-205ENST00000533379 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.16■□□□□ 0.5
TIMM10B-205ENST00000533379 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.15■□□□□ 0.5
TIMM10B-205ENST00000533379 CEP152O94986 1710 aa18.13■□□□□ 0.49
TIMM10B-205ENST00000533379 ABCC3O15438 1527 aa18.12■□□□□ 0.49
TIMM10B-205ENST00000533379 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
TIMM10B-205ENST00000533379 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
TIMM10B-205ENST00000533379 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
TIMM10B-205ENST00000533379 ARHGEF5Q12774 1597 aa18.1■□□□□ 0.49
TIMM10B-205ENST00000533379 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.09■□□□□ 0.49
TIMM10B-205ENST00000533379 ERVK-7P63135 1459 aa18.09■□□□□ 0.49
TIMM10B-205ENST00000533379 TSPY4P0CV99 314 aa18.09■□□□□ 0.49
TIMM10B-205ENST00000533379 TSPY10P0CW01 314 aa18.09■□□□□ 0.49
TIMM10B-205ENST00000533379 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
TIMM10B-205ENST00000533379 MROH1Q8NDA8 1641 aa18.09■□□□□ 0.49
TIMM10B-205ENST00000533379 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.08■□□□□ 0.48
TIMM10B-205ENST00000533379 LTKP29376 864 aa18.07■□□□□ 0.48
TIMM10B-205ENST00000533379 SYNMO15061 1565 aa18.05■□□□□ 0.48
TIMM10B-205ENST00000533379 MAST1Q9Y2H9 1570 aa18.03■□□□□ 0.48
TIMM10B-205ENST00000533379 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
TIMM10B-205ENST00000533379 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.02■□□□□ 0.48
TIMM10B-205ENST00000533379 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TIMM10B-205ENST00000533379 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
TIMM10B-205ENST00000533379 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
TIMM10B-205ENST00000533379 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17.99■□□□□ 0.47
TIMM10B-205ENST00000533379 ARHGAP23Q9P227 1491 aa17.98■□□□□ 0.47
TIMM10B-205ENST00000533379 PIK3C2BO00750 1634 aa17.98■□□□□ 0.47
TIMM10B-205ENST00000533379 POTEAQ6S8J7 498 aa17.96■□□□□ 0.47
TIMM10B-205ENST00000533379 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.96■□□□□ 0.471e-8■■■■□ 25.9
TIMM10B-205ENST00000533379 SLIT1O75093 1534 aa17.96■□□□□ 0.47
TIMM10B-205ENST00000533379 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa17.94■□□□□ 0.46
TIMM10B-205ENST00000533379 DUOX2Q9NRD8 1548 aa17.93■□□□□ 0.46
TIMM10B-205ENST00000533379 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.92■□□□□ 0.46
TIMM10B-205ENST00000533379 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa17.91■□□□□ 0.46
TIMM10B-205ENST00000533379 SLC26A8Q96RN1 970 aa17.91■□□□□ 0.46
TIMM10B-205ENST00000533379 EID1Q9Y6B2 187 aa17.91■□□□□ 0.46
TIMM10B-205ENST00000533379 TMEM94Q12767 1356 aa17.91■□□□□ 0.46
TIMM10B-205ENST00000533379 KIF15Q9NS87 1388 aa17.91■□□□□ 0.46
TIMM10B-205ENST00000533379 MYOM3Q5VTT5 1437 aa17.9■□□□□ 0.46
TIMM10B-205ENST00000533379 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
TIMM10B-205ENST00000533379 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
TIMM10B-205ENST00000533379 TMEM2Q9UHN6 1383 aa17.9■□□□□ 0.46
TIMM10B-205ENST00000533379 FAM135BQ49AJ0 1406 aa17.89■□□□□ 0.46
TIMM10B-205ENST00000533379 STAG3Q9UJ98 1225 aa17.89■□□□□ 0.45
TIMM10B-205ENST00000533379 CROCC2H7BZ55 1655 aa17.89■□□□□ 0.45
TIMM10B-205ENST00000533379 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa17.89■□□□□ 0.45
TIMM10B-205ENST00000533379 VPS8Q8N3P4 1428 aa17.89■□□□□ 0.45
TIMM10B-205ENST00000533379 IDI1Q13907 227 aa17.88■□□□□ 0.45
TIMM10B-205ENST00000533379 ABCC5O15440 1437 aa17.88■□□□□ 0.45
TIMM10B-205ENST00000533379 MAP3K1Q13233 1512 aa17.88■□□□□ 0.45
TIMM10B-205ENST00000533379 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
TIMM10B-205ENST00000533379 TET3O43151 1660 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM10B-205ENST00000533379 KCNA6P17658 529 aa17.85■□□□□ 0.45
TIMM10B-205ENST00000533379 EFCAB6Q5THR3 1501 aa17.85■□□□□ 0.45
TIMM10B-205ENST00000533379 MYO5BQ9ULV0 1848 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM10B-205ENST00000533379 CHIC2Q9UKJ5 165 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM10B-205ENST00000533379 PTPN23Q9H3S7 1636 aa17.83■□□□□ 0.45
TIMM10B-205ENST00000533379 ERBINQ96RT1 1412 aa17.83■□□□□ 0.45
TIMM10B-205ENST00000533379 PHLPP1O60346 1717 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM10B-205ENST00000533379 BCANQ96GW7 911 aa17.8■□□□□ 0.44
TIMM10B-205ENST00000533379 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
TIMM10B-205ENST00000533379 DAPK1P53355 1430 aa17.8■□□□□ 0.44
TIMM10B-205ENST00000533379 KANK1Q14678 1352 aa17.79■□□□□ 0.44
TIMM10B-205ENST00000533379 NWD1Q149M9 1564 aa17.78■□□□□ 0.44
TIMM10B-205ENST00000533379 ADGRB3O60242 1522 aa17.77■□□□□ 0.44
TIMM10B-205ENST00000533379 SLAIN2Q9P270 581 aa17.77■□□□□ 0.44
TIMM10B-205ENST00000533379 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
TIMM10B-205ENST00000533379 NOS1P29475 1434 aa17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms