RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533337.1

ROBO4-209, Transcript of roundabout guidance receptor 4, human

TSL 2

Gene ROBO4, Length 633 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ROBO4-209	ENST00000533337	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.12	■■■□□ 2.89
ROBO4-209	ENST00000533337	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.11	■■■□□ 2.89
ROBO4-209	ENST00000533337	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
ROBO4-209	ENST00000533337	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.07	■■■□□ 2.89
ROBO4-209	ENST00000533337	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.05	■■■□□ 2.88
ROBO4-209	ENST00000533337	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
ROBO4-209	ENST00000533337	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.01	■■■□□ 2.87
ROBO4-209	ENST00000533337	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.01	■■■□□ 2.87
ROBO4-209	ENST00000533337	C3	P01024	1663 aa		33.01	■■■□□ 2.87
ROBO4-209	ENST00000533337	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
ROBO4-209	ENST00000533337	ITGAE	P38570	1179 aa		33	■■■□□ 2.87
ROBO4-209	ENST00000533337	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.99	■■■□□ 2.87
ROBO4-209	ENST00000533337	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.98	■■■□□ 2.87
ROBO4-209	ENST00000533337	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ROBO4-209	ENST00000533337	NPAT	Q14207	1427 aa		32.95	■■■□□ 2.87
ROBO4-209	ENST00000533337	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
ROBO4-209	ENST00000533337	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.94	■■■□□ 2.86
ROBO4-209	ENST00000533337	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
ROBO4-209	ENST00000533337	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
ROBO4-209	ENST00000533337	ABCC3	O15438	1527 aa		32.91	■■■□□ 2.86
ROBO4-209	ENST00000533337	KANK1	Q14678	1352 aa		32.88	■■■□□ 2.85
ROBO4-209	ENST00000533337	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.87	■■■□□ 2.85
ROBO4-209	ENST00000533337	PZP	P20742	1482 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ROBO4-209	ENST00000533337	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.84	■■■□□ 2.85
ROBO4-209	ENST00000533337	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.83	■■■□□ 2.85
ROBO4-209	ENST00000533337	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.82	■■■□□ 2.84
ROBO4-209	ENST00000533337	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.82	■■■□□ 2.84
ROBO4-209	ENST00000533337	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.81	■■■□□ 2.84
ROBO4-209	ENST00000533337	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.8	■■■□□ 2.84
ROBO4-209	ENST00000533337	NAIP	Q13075	1403 aa		32.78	■■■□□ 2.84
ROBO4-209	ENST00000533337	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ROBO4-209	ENST00000533337	CEP152	O94986	1710 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ROBO4-209	ENST00000533337	UNC13B	O14795	1591 aa		32.75	■■■□□ 2.83
ROBO4-209	ENST00000533337	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
ROBO4-209	ENST00000533337	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.75	■■■□□ 2.83
ROBO4-209	ENST00000533337	TNR	Q92752	1358 aa		32.71	■■■□□ 2.83
ROBO4-209	ENST00000533337	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.7	■■■□□ 2.83
ROBO4-209	ENST00000533337	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.69	■■■□□ 2.82
ROBO4-209	ENST00000533337	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.67	■■■□□ 2.82
ROBO4-209	ENST00000533337	HSPA2	P54652	639 aa		32.66	■■■□□ 2.82
ROBO4-209	ENST00000533337	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.66	■■■□□ 2.82
ROBO4-209	ENST00000533337	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.65	■■■□□ 2.82
ROBO4-209	ENST00000533337	NUP155	O75694	1391 aa		32.64	■■■□□ 2.82
ROBO4-209	ENST00000533337	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.63	■■■□□ 2.81
ROBO4-209	ENST00000533337	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ROBO4-209	ENST00000533337	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
ROBO4-209	ENST00000533337	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
ROBO4-209	ENST00000533337	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.61	■■■□□ 2.81
ROBO4-209	ENST00000533337	TET3	O43151	1660 aa		32.61	■■■□□ 2.81
ROBO4-209	ENST00000533337	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
ROBO4-209	ENST00000533337	NOS1	P29475	1434 aa		32.55	■■■□□ 2.8
ROBO4-209	ENST00000533337	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
ROBO4-209	ENST00000533337	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
ROBO4-209	ENST00000533337	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.49	■■■□□ 2.79
ROBO4-209	ENST00000533337	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
ROBO4-209	ENST00000533337	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ROBO4-209	ENST00000533337	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.46	■■■□□ 2.79
ROBO4-209	ENST00000533337	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.46	■■■□□ 2.79
ROBO4-209	ENST00000533337	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.45	■■■□□ 2.79
ROBO4-209	ENST00000533337		E9PCH4	1651 aa		32.45	■■■□□ 2.79
ROBO4-209	ENST00000533337	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ROBO4-209	ENST00000533337	SYNM	O15061	1565 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ROBO4-209	ENST00000533337	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ROBO4-209	ENST00000533337	IDI1	Q13907	227 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ROBO4-209	ENST00000533337	PKD2	Q13563	968 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ROBO4-209	ENST00000533337	PTPRT	O14522	1441 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ROBO4-209	ENST00000533337	HRC	P23327	699 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ROBO4-209	ENST00000533337	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
ROBO4-209	ENST00000533337	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
ROBO4-209	ENST00000533337	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ROBO4-209	ENST00000533337	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ROBO4-209	ENST00000533337	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ROBO4-209	ENST00000533337	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.32	■■■□□ 2.76
ROBO4-209	ENST00000533337	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.32	■■■□□ 2.76
ROBO4-209	ENST00000533337	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ROBO4-209	ENST00000533337	SLIT1	O75093	1534 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ROBO4-209	ENST00000533337	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ROBO4-209	ENST00000533337	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.27	■■■□□ 2.76
ROBO4-209	ENST00000533337	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.26	■■■□□ 2.76
ROBO4-209	ENST00000533337	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.25	■■■□□ 2.75
ROBO4-209	ENST00000533337	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.25	■■■□□ 2.75
ROBO4-209	ENST00000533337	MED14	O60244	1454 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ROBO4-209	ENST00000533337	TRPM2	O94759	1503 aa		32.22	■■■□□ 2.75
ROBO4-209	ENST00000533337	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
ROBO4-209	ENST00000533337	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.2	■■■□□ 2.75
ROBO4-209	ENST00000533337	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.19	■■■□□ 2.74
ROBO4-209	ENST00000533337	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.19	■■■□□ 2.74
ROBO4-209	ENST00000533337	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
ROBO4-209	ENST00000533337	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ROBO4-209	ENST00000533337	LTK	P29376	864 aa		32.16	■■■□□ 2.74
ROBO4-209	ENST00000533337	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
ROBO4-209	ENST00000533337	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
ROBO4-209	ENST00000533337	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
ROBO4-209	ENST00000533337	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
ROBO4-209	ENST00000533337	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ROBO4-209	ENST00000533337	FOXD1	Q16676	465 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ROBO4-209	ENST00000533337	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ROBO4-209	ENST00000533337	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.07	■■■□□ 2.72
ROBO4-209	ENST00000533337	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.07	■■■□□ 2.72
ROBO4-209	ENST00000533337	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.06	■■■□□ 2.72

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