RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
TSTA3-215ENST00000532308 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.3■■■□□ 2.44
TSTA3-215ENST00000532308 DEPDC5O75140 1603 aa30.3■■■□□ 2.44
TSTA3-215ENST00000532308 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
TSTA3-215ENST00000532308 GGT6Q6P531 493 aa30.27■■■□□ 2.44
TSTA3-215ENST00000532308 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.27■■■□□ 2.444e-6■■■■□ 19.8
TSTA3-215ENST00000532308 KANK1Q14678 1352 aa30.26■■■□□ 2.43
TSTA3-215ENST00000532308 NUP155O75694 1391 aa30.25■■■□□ 2.43
TSTA3-215ENST00000532308 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
TSTA3-215ENST00000532308 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.22■■■□□ 2.43
TSTA3-215ENST00000532308 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.22■■■□□ 2.43
TSTA3-215ENST00000532308 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.21■■■□□ 2.43
TSTA3-215ENST00000532308 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.19■■■□□ 2.42
TSTA3-215ENST00000532308 MLECQ14165 292 aa30.18■■■□□ 2.42
TSTA3-215ENST00000532308 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.17■■■□□ 2.42
TSTA3-215ENST00000532308 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.16■■■□□ 2.42
TSTA3-215ENST00000532308 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.14■■■□□ 2.42
TSTA3-215ENST00000532308 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
TSTA3-215ENST00000532308 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.14■■■□□ 2.42
TSTA3-215ENST00000532308 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.41
TSTA3-215ENST00000532308 PZPP20742 1482 aa30.13■■■□□ 2.41
TSTA3-215ENST00000532308 CEP152O94986 1710 aa30.12■■■□□ 2.41
TSTA3-215ENST00000532308 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
TSTA3-215ENST00000532308 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.1■■■□□ 2.41
TSTA3-215ENST00000532308 TET3O43151 1660 aa30.09■■■□□ 2.41
TSTA3-215ENST00000532308 ABCC3O15438 1527 aa30.08■■■□□ 2.41
TSTA3-215ENST00000532308 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
TSTA3-215ENST00000532308 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
TSTA3-215ENST00000532308 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.03■■■□□ 2.4
TSTA3-215ENST00000532308 PKD2Q13563 968 aa30.03■■■□□ 2.4
TSTA3-215ENST00000532308 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.03■■■□□ 2.4
TSTA3-215ENST00000532308 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.03■■■□□ 2.4
TSTA3-215ENST00000532308 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30■■■□□ 2.39
TSTA3-215ENST00000532308 E9PCH4 1651 aa29.99■■■□□ 2.39
TSTA3-215ENST00000532308 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.99■■■□□ 2.39
TSTA3-215ENST00000532308 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
TSTA3-215ENST00000532308 MROH2AA6NES4 1674 aa29.98■■■□□ 2.39
TSTA3-215ENST00000532308 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.96■■■□□ 2.39
TSTA3-215ENST00000532308 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
TSTA3-215ENST00000532308 MADDQ8WXG6 1647 aa29.93■■■□□ 2.38
TSTA3-215ENST00000532308 ZMYM3Q14202 1370 aa29.92■■■□□ 2.38
TSTA3-215ENST00000532308 FOXD1Q16676 465 aa29.92■■■□□ 2.38
TSTA3-215ENST00000532308 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
TSTA3-215ENST00000532308 NPATQ14207 1427 aa29.91■■■□□ 2.38
TSTA3-215ENST00000532308 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
TSTA3-215ENST00000532308 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.9■■■□□ 2.38
TSTA3-215ENST00000532308 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.87■■■□□ 2.37
TSTA3-215ENST00000532308 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.85■■■□□ 2.37
TSTA3-215ENST00000532308 C3P01024 1663 aa29.85■■■□□ 2.37
TSTA3-215ENST00000532308 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.84■■■□□ 2.37
TSTA3-215ENST00000532308 PTPRTO14522 1441 aa29.83■■■□□ 2.37
TSTA3-215ENST00000532308 NOS1P29475 1434 aa29.79■■■□□ 2.36
TSTA3-215ENST00000532308 TRPM2O94759 1503 aa29.79■■■□□ 2.36
TSTA3-215ENST00000532308 ERVK-7P63135 1459 aa29.79■■■□□ 2.36
TSTA3-215ENST00000532308 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
TSTA3-215ENST00000532308 PLA2R1Q13018 1463 aa29.78■■■□□ 2.36
TSTA3-215ENST00000532308 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.77■■■□□ 2.36
TSTA3-215ENST00000532308 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
TSTA3-215ENST00000532308 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.74■■■□□ 2.35
TSTA3-215ENST00000532308 PTPRMP28827 1452 aa29.73■■■□□ 2.35
TSTA3-215ENST00000532308 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.72■■■□□ 2.35
TSTA3-215ENST00000532308 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.72■■■□□ 2.35
TSTA3-215ENST00000532308 SYNMO15061 1565 aa29.72■■■□□ 2.35
TSTA3-215ENST00000532308 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.71■■■□□ 2.35
TSTA3-215ENST00000532308 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.7■■■□□ 2.35
TSTA3-215ENST00000532308 TNRQ92752 1358 aa29.69■■■□□ 2.34
TSTA3-215ENST00000532308 CLTCL1P53675 1640 aa29.68■■■□□ 2.34
TSTA3-215ENST00000532308 NEUROD1Q13562 356 aa29.68■■■□□ 2.34
TSTA3-215ENST00000532308 PIK3C2BO00750 1634 aa29.67■■■□□ 2.34
TSTA3-215ENST00000532308 KIF1BO60333 1816 aa29.66■■■□□ 2.34
TSTA3-215ENST00000532308 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
TSTA3-215ENST00000532308 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
TSTA3-215ENST00000532308 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.64■■■□□ 2.33
TSTA3-215ENST00000532308 IDI1Q13907 227 aa29.62■■■□□ 2.33
TSTA3-215ENST00000532308 NLRP1Q9C000 1473 aa29.6■■■□□ 2.33
TSTA3-215ENST00000532308 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
TSTA3-215ENST00000532308 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.56■■■□□ 2.32
TSTA3-215ENST00000532308 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.55■■■□□ 2.32
TSTA3-215ENST00000532308 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.55■■■□□ 2.32
TSTA3-215ENST00000532308 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.54■■■□□ 2.32
TSTA3-215ENST00000532308 TONSLQ96HA7 1378 aa29.53■■■□□ 2.32
TSTA3-215ENST00000532308 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
TSTA3-215ENST00000532308 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.52■■■□□ 2.32
TSTA3-215ENST00000532308 ADGRB3O60242 1522 aa29.51■■■□□ 2.32
TSTA3-215ENST00000532308 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.51■■■□□ 2.31
TSTA3-215ENST00000532308 RGL3Q3MIN7 710 aa29.5■■■□□ 2.31
TSTA3-215ENST00000532308 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.5■■■□□ 2.31
TSTA3-215ENST00000532308 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.48■■■□□ 2.31
TSTA3-215ENST00000532308 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
TSTA3-215ENST00000532308 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.47■■■□□ 2.31
TSTA3-215ENST00000532308 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.46■■■□□ 2.31
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
TSTA3-215ENST00000532308 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
TSTA3-215ENST00000532308 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.44■■■□□ 2.3
TSTA3-215ENST00000532308 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.44■■■□□ 2.3
TSTA3-215ENST00000532308 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
TSTA3-215ENST00000532308 STAC3Q96MF2 364 aa29.4■■■□□ 2.3
TSTA3-215ENST00000532308 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.39■■■□□ 2.3
TSTA3-215ENST00000532308 IFT172Q9UG01 1749 aa29.37■■■□□ 2.29
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