RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530978.1

RBM25-208, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 2

Gene RBM25, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-208	ENST00000530978	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM25-208	ENST00000530978	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM25-208	ENST00000530978	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM25-208	ENST00000530978	NAIP	Q13075	1403 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM25-208	ENST00000530978	CEP152	O94986	1710 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM25-208	ENST00000530978	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM25-208	ENST00000530978	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RBM25-208	ENST00000530978	HFM1	A2PYH4	1435 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM25-208	ENST00000530978	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22	2e-9	■■■□□ 15.1
RBM25-208	ENST00000530978	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RBM25-208	ENST00000530978	UNC13B	O14795	1591 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM25-208	ENST00000530978	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RBM25-208	ENST00000530978	PTPRM	P28827	1452 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBM25-208	ENST00000530978	C3	P01024	1663 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM25-208	ENST00000530978	ABCC3	O15438	1527 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM25-208	ENST00000530978	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RBM25-208	ENST00000530978	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RBM25-208	ENST00000530978	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RBM25-208	ENST00000530978	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM25-208	ENST00000530978	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	KANK1	Q14678	1352 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	NUP155	O75694	1391 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	TRIM52	Q96A61	297 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	TET3	O43151	1660 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM25-208	ENST00000530978	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM25-208	ENST00000530978		E9PCH4	1651 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-208	ENST00000530978	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-208	ENST00000530978	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM25-208	ENST00000530978	PZP	P20742	1482 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM25-208	ENST00000530978	NPAT	Q14207	1427 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM25-208	ENST00000530978	ERVK-7	P63135	1459 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM25-208	ENST00000530978	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM25-208	ENST00000530978	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM25-208	ENST00000530978	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM25-208	ENST00000530978	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM25-208	ENST00000530978	SYNM	O15061	1565 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM25-208	ENST00000530978	TNR	Q92752	1358 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM25-208	ENST00000530978	FOXD1	Q16676	465 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM25-208	ENST00000530978	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBM25-208	ENST00000530978	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM25-208	ENST00000530978	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM25-208	ENST00000530978	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-208	ENST00000530978	PKD2	Q13563	968 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-208	ENST00000530978	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-208	ENST00000530978	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-208	ENST00000530978	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-208	ENST00000530978	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-208	ENST00000530978	NOS1	P29475	1434 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-208	ENST00000530978	PIK3C2B	O00750	1634 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RBM25-208	ENST00000530978	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM25-208	ENST00000530978	CLTCL1	P53675	1640 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM25-208	ENST00000530978	HRC	P23327	699 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM25-208	ENST00000530978	HSPA2	P54652	639 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM25-208	ENST00000530978	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM25-208	ENST00000530978	TRPM2	O94759	1503 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM25-208	ENST00000530978	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM25-208	ENST00000530978	NLRP1	Q9C000	1473 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM25-208	ENST00000530978	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM25-208	ENST00000530978	PTPRT	O14522	1441 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM25-208	ENST00000530978	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM25-208	ENST00000530978	IDI1	Q13907	227 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM25-208	ENST00000530978	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM25-208	ENST00000530978	ADGRB3	O60242	1522 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM25-208	ENST00000530978	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM25-208	ENST00000530978	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RBM25-208	ENST00000530978	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM25-208	ENST00000530978	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM25-208	ENST00000530978	KIF1B	O60333	1816 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM25-208	ENST00000530978	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM25-208	ENST00000530978	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RBM25-208	ENST00000530978	STRC	Q7RTU9	1775 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RBM25-208	ENST00000530978	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RBM25-208	ENST00000530978	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
RBM25-208	ENST00000530978	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RBM25-208	ENST00000530978	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
RBM25-208	ENST00000530978	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
RBM25-208	ENST00000530978	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RBM25-208	ENST00000530978	SLIT1	O75093	1534 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RBM25-208	ENST00000530978	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
RBM25-208	ENST00000530978	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RBM25-208	ENST00000530978	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
RBM25-208	ENST00000530978	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RBM25-208	ENST00000530978	ZFYVE9	O95405	1425 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RBM25-208	ENST00000530978	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RBM25-208	ENST00000530978	LTK	P29376	864 aa		13.28	□□□□□ -0.28

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