RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529362.1

GATD1-210, Transcript of glutamine amidotransferase like class 1 domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene GATD1, Length 578 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1-210ENST00000529362 ITGAEP38570 1179 aa36.2■■■■□ 3.39
GATD1-210ENST00000529362 MROH2AA6NES4 1674 aa36.19■■■■□ 3.38
GATD1-210ENST00000529362 GGT6Q6P531 493 aa36.19■■■■□ 3.38
GATD1-210ENST00000529362 DEPDC5O75140 1603 aa36.17■■■■□ 3.38
GATD1-210ENST00000529362 ROCK1Q13464 1354 aa36.15■■■■□ 3.38
GATD1-210ENST00000529362 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
GATD1-210ENST00000529362 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.11■■■■□ 3.37
GATD1-210ENST00000529362 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.1■■■■□ 3.37
GATD1-210ENST00000529362 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
GATD1-210ENST00000529362 CEP152O94986 1710 aa36.1■■■■□ 3.37
GATD1-210ENST00000529362 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.08■■■■□ 3.37
GATD1-210ENST00000529362 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.07■■■■□ 3.36
GATD1-210ENST00000529362 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.07■■■■□ 3.36
GATD1-210ENST00000529362 ABCC3O15438 1527 aa36.06■■■■□ 3.36
GATD1-210ENST00000529362 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
GATD1-210ENST00000529362 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.03■■■■□ 3.36
GATD1-210ENST00000529362 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.02■■■■□ 3.36
GATD1-210ENST00000529362 ZMYM3Q14202 1370 aa36.01■■■■□ 3.35
GATD1-210ENST00000529362 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36■■■■□ 3.35
GATD1-210ENST00000529362 UNC13BO14795 1591 aa35.99■■■■□ 3.35
GATD1-210ENST00000529362 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.98■■■■□ 3.35
GATD1-210ENST00000529362 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
GATD1-210ENST00000529362 NAIPQ13075 1403 aa35.96■■■■□ 3.35
GATD1-210ENST00000529362 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.93■■■■□ 3.34
GATD1-210ENST00000529362 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.93■■■■□ 3.34
GATD1-210ENST00000529362 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.92■■■■□ 3.34
GATD1-210ENST00000529362 PZPP20742 1482 aa35.9■■■■□ 3.34
GATD1-210ENST00000529362 HFM1A2PYH4 1435 aa35.89■■■■□ 3.34
GATD1-210ENST00000529362 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.88■■■■□ 3.33
GATD1-210ENST00000529362 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.88■■■■□ 3.33
GATD1-210ENST00000529362 NPATQ14207 1427 aa35.86■■■■□ 3.33
GATD1-210ENST00000529362 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.83■■■■□ 3.33
GATD1-210ENST00000529362 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.83■■■■□ 3.33
GATD1-210ENST00000529362 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
GATD1-210ENST00000529362 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.81■■■■□ 3.32
GATD1-210ENST00000529362 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
GATD1-210ENST00000529362 TET3O43151 1660 aa35.78■■■■□ 3.32
GATD1-210ENST00000529362 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.78■■■■□ 3.32
GATD1-210ENST00000529362 KANK1Q14678 1352 aa35.77■■■■□ 3.32
GATD1-210ENST00000529362 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
GATD1-210ENST00000529362 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.76■■■■□ 3.32
GATD1-210ENST00000529362 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
GATD1-210ENST00000529362 ERVK-7P63135 1459 aa35.75■■■■□ 3.31
GATD1-210ENST00000529362 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.73■■■■□ 3.31
GATD1-210ENST00000529362 E9PCH4 1651 aa35.71■■■■□ 3.31
GATD1-210ENST00000529362 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
GATD1-210ENST00000529362 TNRQ92752 1358 aa35.68■■■■□ 3.3
GATD1-210ENST00000529362 NUP155O75694 1391 aa35.66■■■■□ 3.3
GATD1-210ENST00000529362 HSPA2P54652 639 aa35.66■■■■□ 3.3
GATD1-210ENST00000529362 SYNMO15061 1565 aa35.65■■■■□ 3.3
GATD1-210ENST00000529362 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.59■■■■□ 3.29
GATD1-210ENST00000529362 NOS1P29475 1434 aa35.58■■■■□ 3.29
GATD1-210ENST00000529362 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
GATD1-210ENST00000529362 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.57■■■■□ 3.28
GATD1-210ENST00000529362 STRCQ7RTU9 1775 aa35.56■■■■□ 3.28
GATD1-210ENST00000529362 NLRP1Q9C000 1473 aa35.54■■■■□ 3.28
GATD1-210ENST00000529362 PIK3C2BO00750 1634 aa35.52■■■■□ 3.28
GATD1-210ENST00000529362 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.51■■■■□ 3.27
GATD1-210ENST00000529362 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.51■■■■□ 3.27
GATD1-210ENST00000529362 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.49■■■■□ 3.27
GATD1-210ENST00000529362 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.47■■■■□ 3.27
GATD1-210ENST00000529362 TRIM52Q96A61 297 aa35.45■■■■□ 3.27
GATD1-210ENST00000529362 PLA2R1Q13018 1463 aa35.39■■■■□ 3.26
GATD1-210ENST00000529362 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.39■■■■□ 3.26
GATD1-210ENST00000529362 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
GATD1-210ENST00000529362 PTPRTO14522 1441 aa35.37■■■■□ 3.25
GATD1-210ENST00000529362 IDI1Q13907 227 aa35.36■■■■□ 3.25
GATD1-210ENST00000529362 ADGRB3O60242 1522 aa35.36■■■■□ 3.25
GATD1-210ENST00000529362 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
GATD1-210ENST00000529362 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.34■■■■□ 3.25
GATD1-210ENST00000529362 TRPM2O94759 1503 aa35.32■■■■□ 3.25
GATD1-210ENST00000529362 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.32■■■■□ 3.25
GATD1-210ENST00000529362 CLTCL1P53675 1640 aa35.32■■■■□ 3.25
GATD1-210ENST00000529362 PKD2Q13563 968 aa35.32■■■■□ 3.24
GATD1-210ENST00000529362 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
GATD1-210ENST00000529362 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.28■■■■□ 3.24
GATD1-210ENST00000529362 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.28■■■■□ 3.24
GATD1-210ENST00000529362 FOXD1Q16676 465 aa35.27■■■■□ 3.24
GATD1-210ENST00000529362 SLIT1O75093 1534 aa35.27■■■■□ 3.24
GATD1-210ENST00000529362 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.26■■■■□ 3.24
GATD1-210ENST00000529362 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.25■■■■□ 3.23
GATD1-210ENST00000529362 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
GATD1-210ENST00000529362 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
GATD1-210ENST00000529362 HRCP23327 699 aa35.18■■■■□ 3.22
GATD1-210ENST00000529362 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.16■■■■□ 3.22
GATD1-210ENST00000529362 MED14O60244 1454 aa35.13■■■■□ 3.21
GATD1-210ENST00000529362 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
GATD1-210ENST00000529362 IQGAP1P46940 1657 aa35.13■■■■□ 3.21
GATD1-210ENST00000529362 ZFYVE9O95405 1425 aa35.13■■■■□ 3.21
GATD1-210ENST00000529362 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
GATD1-210ENST00000529362 KIF1BO60333 1816 aa35.12■■■■□ 3.21
GATD1-210ENST00000529362 LTKP29376 864 aa35.12■■■■□ 3.21
GATD1-210ENST00000529362 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.11■■■■□ 3.21
GATD1-210ENST00000529362 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.08■■■■□ 3.21
GATD1-210ENST00000529362 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.21
GATD1-210ENST00000529362 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
GATD1-210ENST00000529362 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.05■■■■□ 3.2
GATD1-210ENST00000529362 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.02■■■■□ 3.2
GATD1-210ENST00000529362 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.02■■■■□ 3.2
GATD1-210ENST00000529362 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.01■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms