RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529170.5

MKNK1-222, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1, human

TSL 4

Gene MKNK1, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKNK1-222	ENST00000529170	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MKNK1-222	ENST00000529170	TOM1	O60784	492 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MKNK1-222	ENST00000529170	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MKNK1-222	ENST00000529170	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MKNK1-222	ENST00000529170	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MKNK1-222	ENST00000529170	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MKNK1-222	ENST00000529170	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25
MKNK1-222	ENST00000529170	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MKNK1-222	ENST00000529170	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
MKNK1-222	ENST00000529170	CPS1	P31327	1500 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MKNK1-222	ENST00000529170	PZP	P20742	1482 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MKNK1-222	ENST00000529170	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.46	□□□□□ -0.26
MKNK1-222	ENST00000529170	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MKNK1-222	ENST00000529170	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MKNK1-222	ENST00000529170	ALK	Q9UM73	1620 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MKNK1-222	ENST00000529170	CEP162	Q5TB80	1403 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MKNK1-222	ENST00000529170	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MKNK1-222	ENST00000529170	MED14	O60244	1454 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MKNK1-222	ENST00000529170	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MKNK1-222	ENST00000529170	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MKNK1-222	ENST00000529170	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MKNK1-222	ENST00000529170	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MKNK1-222	ENST00000529170	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MKNK1-222	ENST00000529170	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MKNK1-222	ENST00000529170	NLRP1	Q9C000	1473 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MKNK1-222	ENST00000529170	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MKNK1-222	ENST00000529170	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MKNK1-222	ENST00000529170	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MKNK1-222	ENST00000529170	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MKNK1-222	ENST00000529170	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MKNK1-222	ENST00000529170	TSPY4	P0CV99	314 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MKNK1-222	ENST00000529170	TSPY10	P0CW01	314 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MKNK1-222	ENST00000529170	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
MKNK1-222	ENST00000529170	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MKNK1-222	ENST00000529170	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MKNK1-222	ENST00000529170	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MKNK1-222	ENST00000529170	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
MKNK1-222	ENST00000529170	LTK	P29376	864 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MKNK1-222	ENST00000529170	ABCC3	O15438	1527 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MKNK1-222	ENST00000529170	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MKNK1-222	ENST00000529170	IQGAP1	P46940	1657 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MKNK1-222	ENST00000529170	ERVK-7	P63135	1459 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MKNK1-222	ENST00000529170	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MKNK1-222	ENST00000529170	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
MKNK1-222	ENST00000529170	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
MKNK1-222	ENST00000529170	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MKNK1-222	ENST00000529170	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
MKNK1-222	ENST00000529170	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
MKNK1-222	ENST00000529170	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MKNK1-222	ENST00000529170	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MKNK1-222	ENST00000529170	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	SYNM	O15061	1565 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	SLIT1	O75093	1534 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	POTEA	Q6S8J7	498 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	CEP152	O94986	1710 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	EID1	Q9Y6B2	187 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	IDI1	Q13907	227 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	13.21	□□□□□ -0.29	2e-6	■■■■□ 20.7
MKNK1-222	ENST00000529170	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MKNK1-222	ENST00000529170	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		13.21	□□□□□ -0.3
MKNK1-222	ENST00000529170	TMEM94	Q12767	1356 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MKNK1-222	ENST00000529170	KCNA6	P17658	529 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MKNK1-222	ENST00000529170	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MKNK1-222	ENST00000529170	KIF15	Q9NS87	1388 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MKNK1-222	ENST00000529170	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MKNK1-222	ENST00000529170	ABCC5	O15440	1437 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MKNK1-222	ENST00000529170	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MKNK1-222	ENST00000529170	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
MKNK1-222	ENST00000529170	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MKNK1-222	ENST00000529170	PIK3C2B	O00750	1634 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MKNK1-222	ENST00000529170	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
MKNK1-222	ENST00000529170	TET3	O43151	1660 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MKNK1-222	ENST00000529170	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MKNK1-222	ENST00000529170	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MKNK1-222	ENST00000529170	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MKNK1-222	ENST00000529170	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MKNK1-222	ENST00000529170	NOS1	P29475	1434 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MKNK1-222	ENST00000529170	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MKNK1-222	ENST00000529170	KANK1	Q14678	1352 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MKNK1-222	ENST00000529170	SLAIN2	Q9P270	581 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MKNK1-222	ENST00000529170	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MKNK1-222	ENST00000529170	DAPK1	P53355	1430 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MKNK1-222	ENST00000529170	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MKNK1-222	ENST00000529170	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MKNK1-222	ENST00000529170	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
MKNK1-222	ENST00000529170	MSH6	P52701	1360 aa		13.08	□□□□□ -0.31
MKNK1-222	ENST00000529170	NWD1	Q149M9	1564 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MKNK1-222	ENST00000529170	BCAN	Q96GW7	911 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MKNK1-222	ENST00000529170	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
MKNK1-222	ENST00000529170	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MKNK1-222	ENST00000529170	JCAD	Q9P266	1359 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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