RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
PACSIN3-204ENST00000528201 FBXO41Q8TF61 875 aa37.37■■■■□ 3.57
PACSIN3-204ENST00000528201 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.36■■■■□ 3.57
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.36■■■■□ 3.57
PACSIN3-204ENST00000528201 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.35■■■■□ 3.57
PACSIN3-204ENST00000528201 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37.35■■■■□ 3.57
PACSIN3-204ENST00000528201 DAPK1P53355 1430 aa37.35■■■■□ 3.57
PACSIN3-204ENST00000528201 PZPP20742 1482 aa37.33■■■■□ 3.57
PACSIN3-204ENST00000528201 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.32■■■■□ 3.57
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.56
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF15Q9NS87 1388 aa37.31■■■■□ 3.56
PACSIN3-204ENST00000528201 PTPRTO14522 1441 aa37.31■■■■□ 3.56
PACSIN3-204ENST00000528201 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
PACSIN3-204ENST00000528201 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.29■■■■□ 3.56
PACSIN3-204ENST00000528201 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.29■■■■□ 3.56
PACSIN3-204ENST00000528201 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.28■■■■□ 3.56
PACSIN3-204ENST00000528201 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
PACSIN3-204ENST00000528201 CERKQ8TCT0 537 aa37.27■■■■□ 3.56
PACSIN3-204ENST00000528201 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.27■■■■□ 3.56
PACSIN3-204ENST00000528201 TNRQ92752 1358 aa37.27■■■■□ 3.56
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCC3O15438 1527 aa37.26■■■■□ 3.56
PACSIN3-204ENST00000528201 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
PACSIN3-204ENST00000528201 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.25■■■■□ 3.55
PACSIN3-204ENST00000528201 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.23■■■■□ 3.55
PACSIN3-204ENST00000528201 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.22■■■■□ 3.55
PACSIN3-204ENST00000528201 PLA2R1Q13018 1463 aa37.2■■■■□ 3.54
PACSIN3-204ENST00000528201 ERBINQ96RT1 1412 aa37.19■■■■□ 3.54
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.13■■■■□ 3.53
PACSIN3-204ENST00000528201 PKD2Q13563 968 aa37.12■■■■□ 3.53
PACSIN3-204ENST00000528201 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
PACSIN3-204ENST00000528201 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
PACSIN3-204ENST00000528201 ERVK-7P63135 1459 aa37.07■■■■□ 3.53
PACSIN3-204ENST00000528201 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.07■■■■□ 3.53
PACSIN3-204ENST00000528201 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.07■■■■□ 3.52
PACSIN3-204ENST00000528201 ADGRL2O95490 1459 aa37.07■■■■□ 3.52
PACSIN3-204ENST00000528201 NLRP1Q9C000 1473 aa37.07■■■■□ 3.52
PACSIN3-204ENST00000528201 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.05■■■■□ 3.522e-6■□□□□ 10.8
PACSIN3-204ENST00000528201 CEP152O94986 1710 aa37.05■■■■□ 3.52
PACSIN3-204ENST00000528201 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
PACSIN3-204ENST00000528201 DEPDC5O75140 1603 aa37.01■■■■□ 3.52
PACSIN3-204ENST00000528201 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.01■■■■□ 3.51
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.98■■■■□ 3.51
PACSIN3-204ENST00000528201 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.97■■■■□ 3.51
PACSIN3-204ENST00000528201 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
PACSIN3-204ENST00000528201 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.95■■■■□ 3.51
PACSIN3-204ENST00000528201 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.93■■■■□ 3.5
PACSIN3-204ENST00000528201 KANK1Q14678 1352 aa36.91■■■■□ 3.5
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.9■■■■□ 3.5
PACSIN3-204ENST00000528201 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.9■■■■□ 3.5
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.89■■■■□ 3.5
PACSIN3-204ENST00000528201 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
PACSIN3-204ENST00000528201 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
PACSIN3-204ENST00000528201 MED14O60244 1454 aa36.8■■■■□ 3.48
PACSIN3-204ENST00000528201 ROCK1Q13464 1354 aa36.79■■■■□ 3.48
PACSIN3-204ENST00000528201 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
PACSIN3-204ENST00000528201 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.79■■■■□ 3.48
PACSIN3-204ENST00000528201 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.77■■■■□ 3.48
PACSIN3-204ENST00000528201 ITGAEP38570 1179 aa36.76■■■■□ 3.48
PACSIN3-204ENST00000528201 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.76■■■■□ 3.47
PACSIN3-204ENST00000528201 NOS1P29475 1434 aa36.73■■■■□ 3.47
PACSIN3-204ENST00000528201 SYNMO15061 1565 aa36.7■■■■□ 3.47
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.7■■■■□ 3.47
PACSIN3-204ENST00000528201 LTKP29376 864 aa36.7■■■■□ 3.47
PACSIN3-204ENST00000528201 IDI1Q13907 227 aa36.7■■■■□ 3.47
PACSIN3-204ENST00000528201 PIK3C2BO00750 1634 aa36.68■■■■□ 3.46
PACSIN3-204ENST00000528201 SLIT1O75093 1534 aa36.67■■■■□ 3.46
PACSIN3-204ENST00000528201 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
PACSIN3-204ENST00000528201 UNC13BO14795 1591 aa36.65■■■■□ 3.46
PACSIN3-204ENST00000528201 IQGAP1P46940 1657 aa36.64■■■■□ 3.46
PACSIN3-204ENST00000528201 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
PACSIN3-204ENST00000528201 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.63■■■■□ 3.45
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.62■■■■□ 3.45
PACSIN3-204ENST00000528201 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
PACSIN3-204ENST00000528201 CPS1P31327 1500 aa36.59■■■■□ 3.45
PACSIN3-204ENST00000528201 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.58■■■■□ 3.45
PACSIN3-204ENST00000528201 TET3O43151 1660 aa36.58■■■■□ 3.45
PACSIN3-204ENST00000528201 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.57■■■■□ 3.44
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.55■■■■□ 3.44
PACSIN3-204ENST00000528201 EID1Q9Y6B2 187 aa36.53■■■■□ 3.44
PACSIN3-204ENST00000528201 ADGRB3O60242 1522 aa36.52■■■■□ 3.44
PACSIN3-204ENST00000528201 NUP155O75694 1391 aa36.52■■■■□ 3.44
PACSIN3-204ENST00000528201 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
PACSIN3-204ENST00000528201 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.48■■■■□ 3.43
PACSIN3-204ENST00000528201 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.47■■■■□ 3.43
PACSIN3-204ENST00000528201 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.47■■■■□ 3.43
PACSIN3-204ENST00000528201 E9PCH4 1651 aa36.44■■■■□ 3.42
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.43■■■■□ 3.42
PACSIN3-204ENST00000528201 NAIPQ13075 1403 aa36.4■■■■□ 3.42
PACSIN3-204ENST00000528201 ZFYVE9O95405 1425 aa36.38■■■■□ 3.41
PACSIN3-204ENST00000528201 ALKQ9UM73 1620 aa36.35■■■■□ 3.41
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.35■■■■□ 3.41
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.34■■■■□ 3.41
PACSIN3-204ENST00000528201 TOM1O60784 492 aa36.33■■■■□ 3.41
PACSIN3-204ENST00000528201 PIP4K2BP78356 416 aa36.33■■■■□ 3.41
PACSIN3-204ENST00000528201 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.32■■■■□ 3.4
PACSIN3-204ENST00000528201 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
PACSIN3-204ENST00000528201 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms