RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525939.1

ABCA7-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 7, human

TSL 3

Gene ABCA7, Length 374 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA7-208	ENST00000525939	KIF15	Q9NS87	1388 aa		34.22	■■■■□ 3.07
ABCA7-208	ENST00000525939	ZMYM3	Q14202	1370 aa		34.21	■■■■□ 3.07
ABCA7-208	ENST00000525939	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		34.2	■■■■□ 3.07
ABCA7-208	ENST00000525939	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		34.2	■■■■□ 3.06
ABCA7-208	ENST00000525939	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		34.19	■■■■□ 3.06
ABCA7-208	ENST00000525939	NCOA1	Q15788	1441 aa		34.19	■■■■□ 3.06
ABCA7-208	ENST00000525939	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	34.18	■■■■□ 3.06
ABCA7-208	ENST00000525939	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		34.18	■■■■□ 3.06
ABCA7-208	ENST00000525939	NPAT	Q14207	1427 aa		34.17	■■■■□ 3.06
ABCA7-208	ENST00000525939	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		34.14	■■■■□ 3.06
ABCA7-208	ENST00000525939	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	34.13	■■■■□ 3.05
ABCA7-208	ENST00000525939	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		34.13	■■■■□ 3.05
ABCA7-208	ENST00000525939	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		34.11	■■■■□ 3.05
ABCA7-208	ENST00000525939	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	34.11	■■■■□ 3.05
ABCA7-208	ENST00000525939	DEPDC5	O75140	1603 aa		34.09	■■■■□ 3.05
ABCA7-208	ENST00000525939	PTPRK	Q15262	1439 aa		34.08	■■■■□ 3.05
ABCA7-208	ENST00000525939	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		34.07	■■■■□ 3.04
ABCA7-208	ENST00000525939	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	34.07	■■■■□ 3.04
ABCA7-208	ENST00000525939	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		34.06	■■■■□ 3.04
ABCA7-208	ENST00000525939	ABCC3	O15438	1527 aa		34.04	■■■■□ 3.04
ABCA7-208	ENST00000525939	ROCK1	Q13464	1354 aa		34.04	■■■■□ 3.04
ABCA7-208	ENST00000525939	PZP	P20742	1482 aa		34.03	■■■■□ 3.04
ABCA7-208	ENST00000525939	CEP152	O94986	1710 aa		33.99	■■■■□ 3.03
ABCA7-208	ENST00000525939	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.97	■■■■□ 3.03
ABCA7-208	ENST00000525939	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.96	■■■■□ 3.03
ABCA7-208	ENST00000525939	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.96	■■■■□ 3.03
ABCA7-208	ENST00000525939	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.95	■■■■□ 3.03
ABCA7-208	ENST00000525939	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.94	■■■■□ 3.02
ABCA7-208	ENST00000525939	HSPA2	P54652	639 aa		33.94	■■■■□ 3.02
ABCA7-208	ENST00000525939	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.89	■■■■□ 3.02
ABCA7-208	ENST00000525939	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.89	■■■■□ 3.02
ABCA7-208	ENST00000525939	KANK1	Q14678	1352 aa		33.88	■■■■□ 3.01
ABCA7-208	ENST00000525939	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.87	■■■■□ 3.01
ABCA7-208	ENST00000525939	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.86	■■■■□ 3.01
ABCA7-208	ENST00000525939	TNR	Q92752	1358 aa		33.85	■■■■□ 3.01
ABCA7-208	ENST00000525939	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.85	■■■■□ 3.01
ABCA7-208	ENST00000525939	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.85	■■■■□ 3.01
ABCA7-208	ENST00000525939	UNC13B	O14795	1591 aa		33.83	■■■■□ 3.01
ABCA7-208	ENST00000525939	ITGAE	P38570	1179 aa		33.82	■■■■□ 3
ABCA7-208	ENST00000525939	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.82	■■■■□ 3
ABCA7-208	ENST00000525939	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.82	■■■■□ 3
ABCA7-208	ENST00000525939	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.81	■■■■□ 3
ABCA7-208	ENST00000525939	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.8	■■■■□ 3
ABCA7-208	ENST00000525939	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.79	■■■■□ 3
ABCA7-208	ENST00000525939	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.75	■■■□□ 2.99
ABCA7-208	ENST00000525939	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.75	■■■□□ 2.99
ABCA7-208	ENST00000525939	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.73	■■■□□ 2.99
ABCA7-208	ENST00000525939	TET3	O43151	1660 aa		33.72	■■■□□ 2.99
ABCA7-208	ENST00000525939	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.7	■■■□□ 2.99
ABCA7-208	ENST00000525939	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.69	■■■□□ 2.98
ABCA7-208	ENST00000525939	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.68	■■■□□ 2.98
ABCA7-208	ENST00000525939	NAIP	Q13075	1403 aa		33.67	■■■□□ 2.98
ABCA7-208	ENST00000525939	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.65	■■■□□ 2.98
ABCA7-208	ENST00000525939	PTPRT	O14522	1441 aa		33.65	■■■□□ 2.98
ABCA7-208	ENST00000525939	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.64	■■■□□ 2.98
ABCA7-208	ENST00000525939	NOS1	P29475	1434 aa		33.62	■■■□□ 2.97
ABCA7-208	ENST00000525939	PKD2	Q13563	968 aa		33.6	■■■□□ 2.97
ABCA7-208	ENST00000525939	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.59	■■■□□ 2.97
ABCA7-208	ENST00000525939	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
ABCA7-208	ENST00000525939	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
ABCA7-208	ENST00000525939	SYNM	O15061	1565 aa		33.58	■■■□□ 2.97
ABCA7-208	ENST00000525939	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
ABCA7-208	ENST00000525939		E9PCH4	1651 aa		33.57	■■■□□ 2.96
ABCA7-208	ENST00000525939	NUP155	O75694	1391 aa		33.57	■■■□□ 2.96
ABCA7-208	ENST00000525939	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33.53	■■■□□ 2.96
ABCA7-208	ENST00000525939	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.52	■■■□□ 2.96
ABCA7-208	ENST00000525939	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.48	■■■□□ 2.95
ABCA7-208	ENST00000525939	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		33.48	■■■□□ 2.95
ABCA7-208	ENST00000525939	SLIT1	O75093	1534 aa		33.45	■■■□□ 2.95
ABCA7-208	ENST00000525939	IDI1	Q13907	227 aa		33.45	■■■□□ 2.95
ABCA7-208	ENST00000525939	MED14	O60244	1454 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ABCA7-208	ENST00000525939	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ABCA7-208	ENST00000525939	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ABCA7-208	ENST00000525939	ADGRB3	O60242	1522 aa		33.4	■■■□□ 2.94
ABCA7-208	ENST00000525939	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.37	■■■□□ 2.93
ABCA7-208	ENST00000525939	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.35	■■■□□ 2.93
ABCA7-208	ENST00000525939	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.34	■■■□□ 2.93
ABCA7-208	ENST00000525939	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		33.34	■■■□□ 2.93
ABCA7-208	ENST00000525939	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ABCA7-208	ENST00000525939	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
ABCA7-208	ENST00000525939	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ABCA7-208	ENST00000525939	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
ABCA7-208	ENST00000525939	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		33.32	■■■□□ 2.92
ABCA7-208	ENST00000525939	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
ABCA7-208	ENST00000525939	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.27	■■■□□ 2.92
ABCA7-208	ENST00000525939	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.27	■■■□□ 2.92
ABCA7-208	ENST00000525939	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.27	■■■□□ 2.92
ABCA7-208	ENST00000525939	LTK	P29376	864 aa		33.26	■■■□□ 2.91
ABCA7-208	ENST00000525939	EID1	Q9Y6B2	187 aa		33.25	■■■□□ 2.91
ABCA7-208	ENST00000525939	TRPM2	O94759	1503 aa		33.24	■■■□□ 2.91
ABCA7-208	ENST00000525939	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		33.24	■■■□□ 2.91
ABCA7-208	ENST00000525939	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
ABCA7-208	ENST00000525939	ZFYVE9	O95405	1425 aa		33.2	■■■□□ 2.91
ABCA7-208	ENST00000525939	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.2	■■■□□ 2.91
ABCA7-208	ENST00000525939	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
ABCA7-208	ENST00000525939	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ABCA7-208	ENST00000525939	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ABCA7-208	ENST00000525939	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
ABCA7-208	ENST00000525939	KIF1B	O60333	1816 aa		33.13	■■■□□ 2.89
ABCA7-208	ENST00000525939	CPS1	P31327	1500 aa		33.12	■■■□□ 2.89

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