RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-218	ENST00000525459	UNC13B	O14795	1591 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PTPRK-218	ENST00000525459	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PTPRK-218	ENST00000525459	KIF3B	O15066	747 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PTPRK-218	ENST00000525459	MADD	Q8WXG6	1647 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PTPRK-218	ENST00000525459	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
PTPRK-218	ENST00000525459	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.14	■■■□□ 2.09
PTPRK-218	ENST00000525459	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PTPRK-218	ENST00000525459	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PTPRK-218	ENST00000525459	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PTPRK-218	ENST00000525459	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
PTPRK-218	ENST00000525459	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
PTPRK-218	ENST00000525459	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PTPRK-218	ENST00000525459	MLEC	Q14165	292 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PTPRK-218	ENST00000525459	CEP152	O94986	1710 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PTPRK-218	ENST00000525459	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PTPRK-218	ENST00000525459	GGT6	Q6P531	493 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PTPRK-218	ENST00000525459	KANK1	Q14678	1352 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PTPRK-218	ENST00000525459	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PTPRK-218	ENST00000525459	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PTPRK-218	ENST00000525459	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PTPRK-218	ENST00000525459	ABCC3	O15438	1527 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PTPRK-218	ENST00000525459	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PTPRK-218	ENST00000525459	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PTPRK-218	ENST00000525459	TET3	O43151	1660 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PTPRK-218	ENST00000525459	C3	P01024	1663 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PTPRK-218	ENST00000525459	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PTPRK-218	ENST00000525459	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PTPRK-218	ENST00000525459	PTPRM	P28827	1452 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PTPRK-218	ENST00000525459	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PTPRK-218	ENST00000525459	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PTPRK-218	ENST00000525459	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	27.91	■■■□□ 2.06	1e-6	■■□□□ 13
PTPRK-218	ENST00000525459	HRC	P23327	699 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRK-218	ENST00000525459	NUP155	O75694	1391 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRK-218	ENST00000525459	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PTPRK-218	ENST00000525459	PZP	P20742	1482 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRK-218	ENST00000525459	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PTPRK-218	ENST00000525459	ZMYM3	Q14202	1370 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRK-218	ENST00000525459		E9PCH4	1651 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRK-218	ENST00000525459	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRK-218	ENST00000525459	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PTPRK-218	ENST00000525459	NPAT	Q14207	1427 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRK-218	ENST00000525459	TRIM52	Q96A61	297 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRK-218	ENST00000525459	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRK-218	ENST00000525459	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PTPRK-218	ENST00000525459	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PTPRK-218	ENST00000525459	ERVK-7	P63135	1459 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PTPRK-218	ENST00000525459	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PTPRK-218	ENST00000525459	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PTPRK-218	ENST00000525459	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PTPRK-218	ENST00000525459	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PTPRK-218	ENST00000525459	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
PTPRK-218	ENST00000525459	NOS1	P29475	1434 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PTPRK-218	ENST00000525459	TNR	Q92752	1358 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PTPRK-218	ENST00000525459	SYNM	O15061	1565 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PTPRK-218	ENST00000525459	NLRP1	Q9C000	1473 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PTPRK-218	ENST00000525459	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PTPRK-218	ENST00000525459	TRPM2	O94759	1503 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PTPRK-218	ENST00000525459	PIK3C2B	O00750	1634 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PTPRK-218	ENST00000525459	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
PTPRK-218	ENST00000525459	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		27.64	■■■□□ 2.01
PTPRK-218	ENST00000525459	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTPRK-218	ENST00000525459	PKD2	Q13563	968 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTPRK-218	ENST00000525459	PTPRT	O14522	1441 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PTPRK-218	ENST00000525459	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PTPRK-218	ENST00000525459	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PTPRK-218	ENST00000525459	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PTPRK-218	ENST00000525459	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		27.58	■■■□□ 2
PTPRK-218	ENST00000525459	KIF1B	O60333	1816 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRK-218	ENST00000525459	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRK-218	ENST00000525459	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRK-218	ENST00000525459	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRK-218	ENST00000525459	CLTCL1	P53675	1640 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRK-218	ENST00000525459	ADGRB3	O60242	1522 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRK-218	ENST00000525459	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRK-218	ENST00000525459	PLA2R1	Q13018	1463 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PTPRK-218	ENST00000525459	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PTPRK-218	ENST00000525459	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
PTPRK-218	ENST00000525459	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PTPRK-218	ENST00000525459	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PTPRK-218	ENST00000525459	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		27.45	■■□□□ 1.99
PTPRK-218	ENST00000525459	FOXD1	Q16676	465 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PTPRK-218	ENST00000525459	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PTPRK-218	ENST00000525459	IDI1	Q13907	227 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PTPRK-218	ENST00000525459	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	27.41	■■□□□ 1.98
PTPRK-218	ENST00000525459	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	27.38	■■□□□ 1.97
PTPRK-218	ENST00000525459	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PTPRK-218	ENST00000525459	SLIT1	O75093	1534 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PTPRK-218	ENST00000525459	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PTPRK-218	ENST00000525459	IFT172	Q9UG01	1749 aa		27.3	■■□□□ 1.96
PTPRK-218	ENST00000525459	PPL	O60437	1756 aa		27.3	■■□□□ 1.96
PTPRK-218	ENST00000525459	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		27.3	■■□□□ 1.96
PTPRK-218	ENST00000525459	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		27.29	■■□□□ 1.96
PTPRK-218	ENST00000525459	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		27.29	■■□□□ 1.96
PTPRK-218	ENST00000525459	STRC	Q7RTU9	1775 aa		27.29	■■□□□ 1.96
PTPRK-218	ENST00000525459	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	27.28	■■□□□ 1.96
PTPRK-218	ENST00000525459	ZFYVE9	O95405	1425 aa		27.26	■■□□□ 1.95
PTPRK-218	ENST00000525459	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		27.26	■■□□□ 1.95
PTPRK-218	ENST00000525459	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	27.25	■■□□□ 1.95
PTPRK-218	ENST00000525459	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	27.24	■■□□□ 1.95
PTPRK-218	ENST00000525459	HSPA2	P54652	639 aa		27.24	■■□□□ 1.95

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