RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517979.1

CCDC25-202, Transcript of coiled-coil domain containing 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC25, Length 877 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25-202ENST00000517979 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CCDC25-202ENST00000517979 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC25-202ENST00000517979 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCDC25-202ENST00000517979 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CCDC25-202ENST00000517979 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC25-202ENST00000517979 ZMYM3Q14202 1370 aa21.39■■□□□ 1.02
CCDC25-202ENST00000517979 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.38■■□□□ 1.01
CCDC25-202ENST00000517979 KIF3BO15066 747 aa21.38■■□□□ 1.01
CCDC25-202ENST00000517979 NPATQ14207 1427 aa21.37■■□□□ 1.01
CCDC25-202ENST00000517979 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC25-202ENST00000517979 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.35■■□□□ 1.01
CCDC25-202ENST00000517979 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.32■■□□□ 1
CCDC25-202ENST00000517979 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.31■■□□□ 1
CCDC25-202ENST00000517979 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CCDC25-202ENST00000517979 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.31■■□□□ 1
CCDC25-202ENST00000517979 ABCC5O15440 1437 aa21.3■■□□□ 1
CCDC25-202ENST00000517979 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.3■■□□□ 1
CCDC25-202ENST00000517979 PTPRKQ15262 1439 aa21.29■■□□□ 1
CCDC25-202ENST00000517979 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CCDC25-202ENST00000517979 DAPK1P53355 1430 aa21.29■■□□□ 1
CCDC25-202ENST00000517979 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.28■■□□□ 1
CCDC25-202ENST00000517979 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.27■■□□□ 1
CCDC25-202ENST00000517979 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CCDC25-202ENST00000517979 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CCDC25-202ENST00000517979 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.27■■□□□ 1
CCDC25-202ENST00000517979 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CCDC25-202ENST00000517979 STRCQ7RTU9 1775 aa21.25■□□□□ 0.99
CCDC25-202ENST00000517979 KIF15Q9NS87 1388 aa21.25■□□□□ 0.99
CCDC25-202ENST00000517979 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CCDC25-202ENST00000517979 PZPP20742 1482 aa21.22■□□□□ 0.99
CCDC25-202ENST00000517979 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCDC25-202ENST00000517979 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.22■□□□□ 0.99
CCDC25-202ENST00000517979 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
CCDC25-202ENST00000517979 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.21■□□□□ 0.99
CCDC25-202ENST00000517979 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CCDC25-202ENST00000517979 NCOA1Q15788 1441 aa21.21■□□□□ 0.99
CCDC25-202ENST00000517979 ERBINQ96RT1 1412 aa21.21■□□□□ 0.99
CCDC25-202ENST00000517979 ABCC3O15438 1527 aa21.2■□□□□ 0.98
CCDC25-202ENST00000517979 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.19■□□□□ 0.98
CCDC25-202ENST00000517979 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.19■□□□□ 0.98
CCDC25-202ENST00000517979 TNRQ92752 1358 aa21.19■□□□□ 0.98
CCDC25-202ENST00000517979 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.19■□□□□ 0.98
CCDC25-202ENST00000517979 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CCDC25-202ENST00000517979 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.16■□□□□ 0.98
CCDC25-202ENST00000517979 PTPRTO14522 1441 aa21.15■□□□□ 0.98
CCDC25-202ENST00000517979 CEP152O94986 1710 aa21.15■□□□□ 0.98
CCDC25-202ENST00000517979 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
CCDC25-202ENST00000517979 ADGRL2O95490 1459 aa21.13■□□□□ 0.97
CCDC25-202ENST00000517979 PLA2R1Q13018 1463 aa21.13■□□□□ 0.97
CCDC25-202ENST00000517979 FBXO41Q8TF61 875 aa21.12■□□□□ 0.97
CCDC25-202ENST00000517979 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CCDC25-202ENST00000517979 DEPDC5O75140 1603 aa21.11■□□□□ 0.97
CCDC25-202ENST00000517979 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.1■□□□□ 0.97
CCDC25-202ENST00000517979 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.97
CCDC25-202ENST00000517979 NLRP1Q9C000 1473 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC25-202ENST00000517979 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC25-202ENST00000517979 KANK1Q14678 1352 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC25-202ENST00000517979 ERVK-7P63135 1459 aa21.08■□□□□ 0.97
CCDC25-202ENST00000517979 PKD2Q13563 968 aa21.08■□□□□ 0.97
CCDC25-202ENST00000517979 CERKQ8TCT0 537 aa21.08■□□□□ 0.97
CCDC25-202ENST00000517979 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.04■□□□□ 0.96
CCDC25-202ENST00000517979 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.03■□□□□ 0.96
CCDC25-202ENST00000517979 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.03■□□□□ 0.96
CCDC25-202ENST00000517979 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CCDC25-202ENST00000517979 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CCDC25-202ENST00000517979 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.01■□□□□ 0.95
CCDC25-202ENST00000517979 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CCDC25-202ENST00000517979 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.95
CCDC25-202ENST00000517979 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21■□□□□ 0.95
CCDC25-202ENST00000517979 ITGAEP38570 1179 aa20.99■□□□□ 0.95
CCDC25-202ENST00000517979 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.98■□□□□ 0.95
CCDC25-202ENST00000517979 ROCK1Q13464 1354 aa20.97■□□□□ 0.95
CCDC25-202ENST00000517979 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.97■□□□□ 0.95
CCDC25-202ENST00000517979 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.96■□□□□ 0.95
CCDC25-202ENST00000517979 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.96■□□□□ 0.95
CCDC25-202ENST00000517979 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CCDC25-202ENST00000517979 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.93■□□□□ 0.94
CCDC25-202ENST00000517979 UNC13BO14795 1591 aa20.92■□□□□ 0.94
CCDC25-202ENST00000517979 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CCDC25-202ENST00000517979 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CCDC25-202ENST00000517979 SLC4A2P04920 1241 aa20.89■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 TET3O43151 1660 aa20.89■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 PIK3C2BO00750 1634 aa20.89■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 MED14O60244 1454 aa20.88■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.88■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 SYNMO15061 1565 aa20.88■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 IQGAP1P46940 1657 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 NOS1P29475 1434 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 ZBTB22O15209 634 aa20.85■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.85■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 SLIT1O75093 1534 aa20.84■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.83■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.83■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 IDI1Q13907 227 aa20.83■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.83■□□□□ 0.93
CCDC25-202ENST00000517979 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CCDC25-202ENST00000517979 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms