RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514702.1

HOXC-AS3-203, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 368 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-203ENST00000514702 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CEP162Q5TB80 1403 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TNRQ92752 1358 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-203ENST00000514702 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-203ENST00000514702 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PIP4K2BP78356 416 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-203ENST00000514702 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PZPP20742 1482 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CPS1P31327 1500 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-203ENST00000514702 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TOM1O60784 492 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NCOA2Q15596 1464 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TSPY4P0CV99 314 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TSPY10P0CW01 314 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-203ENST00000514702 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-203ENST00000514702 HSPA1LP34931 641 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NLRP1Q9C000 1473 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-203ENST00000514702 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-203ENST00000514702 MIA2Q96PC5 1412 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DEPDC5O75140 1603 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-203ENST00000514702 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-203ENST00000514702 IQGAP1P46940 1657 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-203ENST00000514702 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-203ENST00000514702 MED14O60244 1454 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-203ENST00000514702 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ABCC3O15438 1527 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-203ENST00000514702 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-203ENST00000514702 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CEP152O94986 1710 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ERVK-7P63135 1459 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-203ENST00000514702 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SYNMO15061 1565 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-203ENST00000514702 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.27■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-203ENST00000514702 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ALKQ9UM73 1620 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-203ENST00000514702 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-203ENST00000514702 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-203ENST00000514702 EID1Q9Y6B2 187 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-203ENST00000514702 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-203ENST00000514702 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-203ENST00000514702 MAP3K1Q13233 1512 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-203ENST00000514702 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KIF15Q9NS87 1388 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LTKP29376 864 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KANK1Q14678 1352 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SLIT1O75093 1534 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PIK3C2BO00750 1634 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ERBINQ96RT1 1412 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-203ENST00000514702 APLP2Q06481 763 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-203ENST00000514702 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ABCC5O15440 1437 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXC-AS3-203ENST00000514702 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DAPK1P53355 1430 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-203ENST00000514702 BCANQ96GW7 911 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-203ENST00000514702 IDI1Q13907 227 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TMEM94Q12767 1356 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KCNA6P17658 529 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS3-203ENST00000514702 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-203ENST00000514702 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-203ENST00000514702 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-203ENST00000514702 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ADGRB3O60242 1522 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TET3O43151 1660 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-203ENST00000514702 MSH6P52701 1360 aa19.95■□□□□ 0.79
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SLC52A1Q9NWF4 448 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
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