RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512731.5

MMP23B-210, Transcript of matrix metallopeptidase 23B, humanhuman

TSL 2

Gene MMP23B, Length 1,531 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP23B-210ENST00000512731 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.76■■■■□ 3.8
MMP23B-210ENST00000512731 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.75■■■■□ 3.79
MMP23B-210ENST00000512731 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.74■■■■□ 3.79
MMP23B-210ENST00000512731 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.72■■■■□ 3.79
MMP23B-210ENST00000512731 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
MMP23B-210ENST00000512731 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.71■■■■□ 3.79
MMP23B-210ENST00000512731 MROH2AA6NES4 1674 aa38.71■■■■□ 3.79
MMP23B-210ENST00000512731 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
MMP23B-210ENST00000512731 DEPDC5O75140 1603 aa38.69■■■■□ 3.78
MMP23B-210ENST00000512731 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.69■■■■□ 3.78
MMP23B-210ENST00000512731 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
MMP23B-210ENST00000512731 C3P01024 1663 aa38.64■■■■□ 3.78
MMP23B-210ENST00000512731 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
MMP23B-210ENST00000512731 ABCC3O15438 1527 aa38.59■■■■□ 3.77
MMP23B-210ENST00000512731 ZMYM3Q14202 1370 aa38.58■■■■□ 3.77
MMP23B-210ENST00000512731 GCC2Q8IWJ2 1684 aa38.57■■■■□ 3.77
MMP23B-210ENST00000512731 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.57■■■■□ 3.76
MMP23B-210ENST00000512731 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
MMP23B-210ENST00000512731 HFM1A2PYH4 1435 aa38.55■■■■□ 3.76
MMP23B-210ENST00000512731 NAIPQ13075 1403 aa38.55■■■■□ 3.76
MMP23B-210ENST00000512731 PLPPR3Q6T4P5 718 aa38.53■■■■□ 3.76
MMP23B-210ENST00000512731 UNC13BO14795 1591 aa38.52■■■■□ 3.76
MMP23B-210ENST00000512731 VWDEQ8N2E2 1590 aa38.52■■■■□ 3.76
MMP23B-210ENST00000512731 CEP152O94986 1710 aa38.52■■■■□ 3.76
MMP23B-210ENST00000512731 KANK1Q14678 1352 aa38.49■■■■□ 3.75
MMP23B-210ENST00000512731 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.47■■■■□ 3.75
MMP23B-210ENST00000512731 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.46■■■■□ 3.75
MMP23B-210ENST00000512731 LMTK2Q8IWU2 1503 aa38.46■■■■□ 3.75
MMP23B-210ENST00000512731 NPATQ14207 1427 aa38.46■■■■□ 3.75
MMP23B-210ENST00000512731 PZPP20742 1482 aa38.45■■■■□ 3.75
MMP23B-210ENST00000512731 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.38■■■■□ 3.73
MMP23B-210ENST00000512731 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa38.37■■■■□ 3.73
MMP23B-210ENST00000512731 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
MMP23B-210ENST00000512731 IQGAP3Q86VI3 1631 aa38.35■■■■□ 3.73
MMP23B-210ENST00000512731 LMTK3Q96Q04 1460 aa38.35■■■■□ 3.73
MMP23B-210ENST00000512731 EFCAB6Q5THR3 1501 aa38.33■■■■□ 3.73
MMP23B-210ENST00000512731 TET3O43151 1660 aa38.31■■■■□ 3.72
MMP23B-210ENST00000512731 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa38.29■■■■□ 3.72
MMP23B-210ENST00000512731 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.29■■■■□ 3.72
MMP23B-210ENST00000512731 NUP155O75694 1391 aa38.29■■■■□ 3.72
MMP23B-210ENST00000512731 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
MMP23B-210ENST00000512731 ERVK-7P63135 1459 aa38.27■■■■□ 3.72
MMP23B-210ENST00000512731 MYO3AQ8NEV4 1616 aa38.27■■■■□ 3.72
MMP23B-210ENST00000512731 TNRQ92752 1358 aa38.24■■■■□ 3.71
MMP23B-210ENST00000512731 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP38.22■■■■□ 3.71
MMP23B-210ENST00000512731 SETD5Q9C0A6 1442 aa38.21■■■■□ 3.71
MMP23B-210ENST00000512731 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
MMP23B-210ENST00000512731 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
MMP23B-210ENST00000512731 E9PCH4 1651 aa38.15■■■■□ 3.7
MMP23B-210ENST00000512731 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
MMP23B-210ENST00000512731 NLRP1Q9C000 1473 aa38.13■■■■□ 3.69
MMP23B-210ENST00000512731 NOS1P29475 1434 aa38.12■■■■□ 3.69
MMP23B-210ENST00000512731 A2ML1A8K2U0 1454 aa38.11■■■■□ 3.69
MMP23B-210ENST00000512731 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa38.1■■■■□ 3.69
MMP23B-210ENST00000512731 TRIM52Q96A61 297 aa38.09■■■■□ 3.69
MMP23B-210ENST00000512731 SYNMO15061 1565 aa38.08■■■■□ 3.69
MMP23B-210ENST00000512731 HSPA2P54652 639 aa38.07■■■■□ 3.68
MMP23B-210ENST00000512731 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
MMP23B-210ENST00000512731 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.98■■■■□ 3.67
MMP23B-210ENST00000512731 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
MMP23B-210ENST00000512731 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
MMP23B-210ENST00000512731 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.94■■■■□ 3.66
MMP23B-210ENST00000512731 PIK3C2BO00750 1634 aa37.94■■■■□ 3.66
MMP23B-210ENST00000512731 HRCP23327 699 aa37.93■■■■□ 3.66
MMP23B-210ENST00000512731 PLA2R1Q13018 1463 aa37.93■■■■□ 3.66
MMP23B-210ENST00000512731 PTPRTO14522 1441 aa37.92■■■■□ 3.66
MMP23B-210ENST00000512731 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.92■■■■□ 3.66
MMP23B-210ENST00000512731 PKD2Q13563 968 aa37.91■■■■□ 3.66
MMP23B-210ENST00000512731 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.91■■■■□ 3.66
MMP23B-210ENST00000512731 IDI1Q13907 227 aa37.89■■■■□ 3.66
MMP23B-210ENST00000512731 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
MMP23B-210ENST00000512731 MPHOSPH9Q99550 1183 aa37.87■■■■□ 3.65
MMP23B-210ENST00000512731 STRCQ7RTU9 1775 aa37.86■■■■□ 3.65
MMP23B-210ENST00000512731 TRPM2O94759 1503 aa37.86■■■■□ 3.65
MMP23B-210ENST00000512731 ADGRB3O60242 1522 aa37.85■■■■□ 3.65
MMP23B-210ENST00000512731 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
MMP23B-210ENST00000512731 SLIT1O75093 1534 aa37.76■■■■□ 3.64
MMP23B-210ENST00000512731 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.76■■■■□ 3.64
MMP23B-210ENST00000512731 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.76■■■■□ 3.63
MMP23B-210ENST00000512731 FOXD1Q16676 465 aa37.75■■■■□ 3.63
MMP23B-210ENST00000512731 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.75■■■■□ 3.63
MMP23B-210ENST00000512731 CLTCL1P53675 1640 aa37.75■■■■□ 3.63
MMP23B-210ENST00000512731 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.74■■■■□ 3.63
MMP23B-210ENST00000512731 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.69■■■■□ 3.62
MMP23B-210ENST00000512731 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.69■■■■□ 3.62
MMP23B-210ENST00000512731 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.69■■■■□ 3.62
MMP23B-210ENST00000512731 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.69■■■■□ 3.62
MMP23B-210ENST00000512731 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.66■■■■□ 3.62
MMP23B-210ENST00000512731 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37.66■■■■□ 3.62
MMP23B-210ENST00000512731 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
MMP23B-210ENST00000512731 MED14O60244 1454 aa37.62■■■■□ 3.61
MMP23B-210ENST00000512731 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
MMP23B-210ENST00000512731 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.6■■■■□ 3.61
MMP23B-210ENST00000512731 KIF1BO60333 1816 aa37.6■■■■□ 3.61
MMP23B-210ENST00000512731 ZFYVE9O95405 1425 aa37.59■■■■□ 3.61
MMP23B-210ENST00000512731 LTKP29376 864 aa37.56■■■■□ 3.6
MMP23B-210ENST00000512731 EID1Q9Y6B2 187 aa37.56■■■■□ 3.6
MMP23B-210ENST00000512731 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
MMP23B-210ENST00000512731 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.55■■■■□ 3.6
MMP23B-210ENST00000512731 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.55■■■■□ 3.6
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