RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512716.1

RASGEF1B-210, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 516 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-210ENST00000512716 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.98■■■■□ 3.51
RASGEF1B-210ENST00000512716 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.98■■■■□ 3.51
RASGEF1B-210ENST00000512716 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
RASGEF1B-210ENST00000512716 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.97■■■■□ 3.51
RASGEF1B-210ENST00000512716 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.97■■■■□ 3.51
RASGEF1B-210ENST00000512716 HSPA2P54652 639 aa36.96■■■■□ 3.51
RASGEF1B-210ENST00000512716 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.96■■■■□ 3.51
RASGEF1B-210ENST00000512716 NPATQ14207 1427 aa36.94■■■■□ 3.5
RASGEF1B-210ENST00000512716 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.93■■■■□ 3.5
RASGEF1B-210ENST00000512716 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.91■■■■□ 3.5
RASGEF1B-210ENST00000512716 ERBINQ96RT1 1412 aa36.9■■■■□ 3.5
RASGEF1B-210ENST00000512716 PTPRKQ15262 1439 aa36.87■■■■□ 3.49
RASGEF1B-210ENST00000512716 ADGRL2O95490 1459 aa36.87■■■■□ 3.49
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
RASGEF1B-210ENST00000512716 NCOA1Q15788 1441 aa36.86■■■■□ 3.49
RASGEF1B-210ENST00000512716 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.85■■■■□ 3.49
RASGEF1B-210ENST00000512716 ABCC3O15438 1527 aa36.8■■■■□ 3.48
RASGEF1B-210ENST00000512716 CEP152O94986 1710 aa36.8■■■■□ 3.48
RASGEF1B-210ENST00000512716 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.8■■■■□ 3.48
RASGEF1B-210ENST00000512716 PZPP20742 1482 aa36.8■■■■□ 3.48
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
RASGEF1B-210ENST00000512716 DEPDC5O75140 1603 aa36.76■■■■□ 3.48
RASGEF1B-210ENST00000512716 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.76■■■■□ 3.47
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
RASGEF1B-210ENST00000512716 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.72■■■■□ 3.47
RASGEF1B-210ENST00000512716 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
RASGEF1B-210ENST00000512716 ITGAEP38570 1179 aa36.7■■■■□ 3.47
RASGEF1B-210ENST00000512716 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.7■■■■□ 3.47
RASGEF1B-210ENST00000512716 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.46
RASGEF1B-210ENST00000512716 STRCQ7RTU9 1775 aa36.69■■■■□ 3.46
RASGEF1B-210ENST00000512716 TNRQ92752 1358 aa36.68■■■■□ 3.46
RASGEF1B-210ENST00000512716 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
RASGEF1B-210ENST00000512716 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.67■■■■□ 3.46
RASGEF1B-210ENST00000512716 KANK1Q14678 1352 aa36.66■■■■□ 3.46
RASGEF1B-210ENST00000512716 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
RASGEF1B-210ENST00000512716 ROCK1Q13464 1354 aa36.66■■■■□ 3.46
RASGEF1B-210ENST00000512716 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.61■■■■□ 3.45
RASGEF1B-210ENST00000512716 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.58■■■■□ 3.45
RASGEF1B-210ENST00000512716 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.57■■■■□ 3.45
RASGEF1B-210ENST00000512716 ERVK-7P63135 1459 aa36.57■■■■□ 3.45
RASGEF1B-210ENST00000512716 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.55■■■■□ 3.44
RASGEF1B-210ENST00000512716 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.54■■■■□ 3.44
RASGEF1B-210ENST00000512716 NLRP1Q9C000 1473 aa36.54■■■■□ 3.44
RASGEF1B-210ENST00000512716 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.54■■■■□ 3.44
RASGEF1B-210ENST00000512716 PLA2R1Q13018 1463 aa36.5■■■■□ 3.43
RASGEF1B-210ENST00000512716 UNC13BO14795 1591 aa36.49■■■■□ 3.43
RASGEF1B-210ENST00000512716 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
RASGEF1B-210ENST00000512716 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.45■■■■□ 3.43
RASGEF1B-210ENST00000512716 PTPRTO14522 1441 aa36.45■■■■□ 3.43
RASGEF1B-210ENST00000512716 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.44■■■■□ 3.42
RASGEF1B-210ENST00000512716 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.42■■■■□ 3.42
RASGEF1B-210ENST00000512716 TET3O43151 1660 aa36.41■■■■□ 3.42
RASGEF1B-210ENST00000512716 PKD2Q13563 968 aa36.4■■■■□ 3.42
RASGEF1B-210ENST00000512716 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
RASGEF1B-210ENST00000512716 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
RASGEF1B-210ENST00000512716 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.38■■■■□ 3.41
RASGEF1B-210ENST00000512716 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.35■■■■□ 3.41
RASGEF1B-210ENST00000512716 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.34■■■■□ 3.41
RASGEF1B-210ENST00000512716 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.41
RASGEF1B-210ENST00000512716 NUP155O75694 1391 aa36.29■■■■□ 3.4
RASGEF1B-210ENST00000512716 SYNMO15061 1565 aa36.29■■■■□ 3.4
RASGEF1B-210ENST00000512716 NAIPQ13075 1403 aa36.29■■■■□ 3.4
RASGEF1B-210ENST00000512716 PIK3C2BO00750 1634 aa36.29■■■■□ 3.4
RASGEF1B-210ENST00000512716 NOS1P29475 1434 aa36.28■■■■□ 3.4
RASGEF1B-210ENST00000512716 E9PCH4 1651 aa36.26■■■■□ 3.4
RASGEF1B-210ENST00000512716 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.26■■■■□ 3.4
RASGEF1B-210ENST00000512716 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.25■■■■□ 3.39
RASGEF1B-210ENST00000512716 HFM1A2PYH4 1435 aa36.22■■■■□ 3.39
RASGEF1B-210ENST00000512716 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
RASGEF1B-210ENST00000512716 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.2■■■■□ 3.39
RASGEF1B-210ENST00000512716 IDI1Q13907 227 aa36.19■■■■□ 3.38
RASGEF1B-210ENST00000512716 CERKQ8TCT0 537 aa36.19■■■■□ 3.38
RASGEF1B-210ENST00000512716 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.16■■■■□ 3.38
RASGEF1B-210ENST00000512716 SLIT1O75093 1534 aa36.13■■■■□ 3.38
RASGEF1B-210ENST00000512716 IQGAP1P46940 1657 aa36.13■■■■□ 3.37
RASGEF1B-210ENST00000512716 MED14O60244 1454 aa36.13■■■■□ 3.37
RASGEF1B-210ENST00000512716 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.13■■■■□ 3.37
RASGEF1B-210ENST00000512716 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
RASGEF1B-210ENST00000512716 ADGRB3O60242 1522 aa36.13■■■■□ 3.37
RASGEF1B-210ENST00000512716 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.11■■■■□ 3.37
RASGEF1B-210ENST00000512716 FBXO41Q8TF61 875 aa36.1■■■■□ 3.37
RASGEF1B-210ENST00000512716 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
RASGEF1B-210ENST00000512716 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.07■■■■□ 3.36
RASGEF1B-210ENST00000512716 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.07■■■■□ 3.36
RASGEF1B-210ENST00000512716 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.06■■■■□ 3.36
RASGEF1B-210ENST00000512716 EID1Q9Y6B2 187 aa36.06■■■■□ 3.36
RASGEF1B-210ENST00000512716 TRIM52Q96A61 297 aa36.05■■■■□ 3.36
RASGEF1B-210ENST00000512716 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.05■■■■□ 3.36
RASGEF1B-210ENST00000512716 LTKP29376 864 aa36.03■■■■□ 3.36
RASGEF1B-210ENST00000512716 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36■■■■□ 3.35
RASGEF1B-210ENST00000512716 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
RASGEF1B-210ENST00000512716 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.92■■■■□ 3.34
RASGEF1B-210ENST00000512716 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
RASGEF1B-210ENST00000512716 CPS1P31327 1500 aa35.89■■■■□ 3.34
RASGEF1B-210ENST00000512716 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.87■■■■□ 3.33
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZFYVE9O95405 1425 aa35.86■■■■□ 3.33
RASGEF1B-210ENST00000512716 TRPM2O94759 1503 aa35.86■■■■□ 3.33
RASGEF1B-210ENST00000512716 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.85■■■■□ 3.33
RASGEF1B-210ENST00000512716 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
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