RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.67■□□□□ 0.58
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.66■□□□□ 0.58
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KIF15Q9NS87 1388 aa18.66■□□□□ 0.58
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.65■□□□□ 0.58
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DUOX2Q9NRD8 1548 aa18.64■□□□□ 0.58
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.58
RAB30-AS1-201ENST00000501011 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.63■□□□□ 0.57
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KDM5DQ9BY66 1539 aa18.63■□□□□ 0.57
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NPATQ14207 1427 aa18.6■□□□□ 0.57
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 ITGAEP38570 1179 aa18.58■□□□□ 0.56
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MROH1Q8NDA8 1641 aa18.57■□□□□ 0.56
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.56
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 NCOA1Q15788 1441 aa18.57■□□□□ 0.56
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ERBINQ96RT1 1412 aa18.57■□□□□ 0.56
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.56■□□□□ 0.56
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.56■□□□□ 0.56
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ABCC3O15438 1527 aa18.55■□□□□ 0.56
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ADGRL2O95490 1459 aa18.54■□□□□ 0.56
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PZPP20742 1482 aa18.54■□□□□ 0.56
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 TNRQ92752 1358 aa18.52■□□□□ 0.55
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.51■□□□□ 0.55
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DEPDC5O75140 1603 aa18.49■□□□□ 0.55
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KANK1Q14678 1352 aa18.47■□□□□ 0.55
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.47■□□□□ 0.55
RAB30-AS1-201ENST00000501011 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.46■□□□□ 0.54
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.45■□□□□ 0.54
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ERVK-7P63135 1459 aa18.44■□□□□ 0.54
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ROCK1Q13464 1354 aa18.43■□□□□ 0.54
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.43■□□□□ 0.54
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.42■□□□□ 0.54
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VWDEQ8N2E2 1590 aa18.41■□□□□ 0.54
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NLRP1Q9C000 1473 aa18.39■□□□□ 0.54
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PTPRTO14522 1441 aa18.38■□□□□ 0.53
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.38■□□□□ 0.53
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLA2R1Q13018 1463 aa18.38■□□□□ 0.53
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LMTK2Q8IWU2 1503 aa18.38■□□□□ 0.53
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UGGT1Q9NYU2 1555 aa18.38■□□□□ 0.53
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UNC13BO14795 1591 aa18.36■□□□□ 0.53
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EFCAB6Q5THR3 1501 aa18.36■□□□□ 0.53
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PKD2Q13563 968 aa18.35■□□□□ 0.53
RAB30-AS1-201ENST00000501011 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
RAB30-AS1-201ENST00000501011 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TET3O43151 1660 aa18.32■□□□□ 0.52
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.32■□□□□ 0.52
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ANKLE2Q86XL3 938 aa18.31■□□□□ 0.52
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CERKQ8TCT0 537 aa18.31■□□□□ 0.52
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PIK3C2BO00750 1634 aa18.31■□□□□ 0.52
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NUP155O75694 1391 aa18.3■□□□□ 0.52
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SYNMO15061 1565 aa18.3■□□□□ 0.52
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.3■□□□□ 0.52
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NEURL4Q96JN8 1562 aa18.3■□□□□ 0.52
RAB30-AS1-201ENST00000501011 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.29■□□□□ 0.52
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IQGAP3Q86VI3 1631 aa18.29■□□□□ 0.52
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IDI1Q13907 227 aa18.28■□□□□ 0.52
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NOS1P29475 1434 aa18.27■□□□□ 0.52
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NAIPQ13075 1403 aa18.27■□□□□ 0.52
RAB30-AS1-201ENST00000501011 E9PCH4 1651 aa18.27■□□□□ 0.52
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FBXO41Q8TF61 875 aa18.26■□□□□ 0.51
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.24■□□□□ 0.51
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.22■□□□□ 0.51
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HFM1A2PYH4 1435 aa18.22■□□□□ 0.51
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IQGAP1P46940 1657 aa18.22■□□□□ 0.51
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LTKP29376 864 aa18.21■□□□□ 0.51
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRIM52Q96A61 297 aa18.21■□□□□ 0.51
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ADGRB3O60242 1522 aa18.2■□□□□ 0.5
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.2■□□□□ 0.5
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MED14O60244 1454 aa18.2■□□□□ 0.5
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.2■□□□□ 0.5
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLIT1O75093 1534 aa18.19■□□□□ 0.5
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.19■□□□□ 0.5
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EID1Q9Y6B2 187 aa18.19■□□□□ 0.5
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.18■□□□□ 0.5
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa18.15■□□□□ 0.5
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.14■□□□□ 0.49
RAB30-AS1-201ENST00000501011 BCANQ96GW7 911 aa18.12■□□□□ 0.49
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
RAB30-AS1-201ENST00000501011 STRCP1A6NGW2 1772 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RIMS2Q9UQ26 1411 aa18.1■□□□□ 0.49
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
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