RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, humanhuman

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19-208ENST00000497842 FBXO41Q8TF61 875 aa42.27■■■■■ 4.36
TTC19-208ENST00000497842 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.26■■■■■ 4.36
TTC19-208ENST00000497842 UNC13BO14795 1591 aa42.24■■■■■ 4.35
TTC19-208ENST00000497842 TRIM52Q96A61 297 aa42.24■■■■■ 4.35
TTC19-208ENST00000497842 KIF3BO15066 747 aa42.21■■■■■ 4.35
TTC19-208ENST00000497842 DEPDC5O75140 1603 aa42.2■■■■■ 4.35
TTC19-208ENST00000497842 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
TTC19-208ENST00000497842 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
TTC19-208ENST00000497842 AGLP35573 1532 aa42.17■■■■■ 4.34
TTC19-208ENST00000497842 MADDQ8WXG6 1647 aa42.13■■■■■ 4.33
TTC19-208ENST00000497842 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.12■■■■■ 4.33
TTC19-208ENST00000497842 NUP155O75694 1391 aa42.11■■■■■ 4.33
TTC19-208ENST00000497842 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.09■■■■■ 4.335e-8■■□□□ 14.4
TTC19-208ENST00000497842 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.09■■■■■ 4.33
TTC19-208ENST00000497842 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
TTC19-208ENST00000497842 IQGAP3Q86VI3 1631 aa42.07■■■■■ 4.33
TTC19-208ENST00000497842 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.07■■■■■ 4.32
TTC19-208ENST00000497842 KANK1Q14678 1352 aa42.06■■■■■ 4.32
TTC19-208ENST00000497842 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
TTC19-208ENST00000497842 PZPP20742 1482 aa42.02■■■■■ 4.32
TTC19-208ENST00000497842 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.02■■■■■ 4.32
TTC19-208ENST00000497842 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.01■■■■■ 4.32
TTC19-208ENST00000497842 GGT6Q6P531 493 aa42.01■■■■■ 4.31
TTC19-208ENST00000497842 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
TTC19-208ENST00000497842 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.99■■■■■ 4.31
TTC19-208ENST00000497842 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.99■■■■■ 4.31
TTC19-208ENST00000497842 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
TTC19-208ENST00000497842 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
TTC19-208ENST00000497842 CEP152O94986 1710 aa41.91■■■■■ 4.3
TTC19-208ENST00000497842 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
TTC19-208ENST00000497842 TET3O43151 1660 aa41.9■■■■■ 4.3
TTC19-208ENST00000497842 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.88■■■■■ 4.3
TTC19-208ENST00000497842 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.86■■■■■ 4.29
TTC19-208ENST00000497842 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.85■■■■■ 4.29
TTC19-208ENST00000497842 ABCC3O15438 1527 aa41.84■■■■■ 4.29
TTC19-208ENST00000497842 PKD2Q13563 968 aa41.83■■■■■ 4.29
TTC19-208ENST00000497842 MLECQ14165 292 aa41.83■■■■■ 4.29
TTC19-208ENST00000497842 HSPA2P54652 639 aa41.8■■■■■ 4.28
TTC19-208ENST00000497842 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.8■■■■■ 4.28
TTC19-208ENST00000497842 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.79■■■■■ 4.28
TTC19-208ENST00000497842 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.78■■■■■ 4.28
TTC19-208ENST00000497842 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.77■■■■■ 4.28
TTC19-208ENST00000497842 E9PCH4 1651 aa41.76■■■■■ 4.28
TTC19-208ENST00000497842 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
TTC19-208ENST00000497842 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
TTC19-208ENST00000497842 FOXD1Q16676 465 aa41.71■■■■■ 4.27
TTC19-208ENST00000497842 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.67■■■■■ 4.26
TTC19-208ENST00000497842 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
TTC19-208ENST00000497842 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.66■■■■■ 4.26
TTC19-208ENST00000497842 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.63■■■■■ 4.26
TTC19-208ENST00000497842 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.62■■■■■ 4.25
TTC19-208ENST00000497842 MROH2AA6NES4 1674 aa41.62■■■■■ 4.25
TTC19-208ENST00000497842 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.61■■■■■ 4.25
TTC19-208ENST00000497842 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
TTC19-208ENST00000497842 NPATQ14207 1427 aa41.59■■■■■ 4.25
TTC19-208ENST00000497842 CERKQ8TCT0 537 aa41.52■■■■■ 4.24
TTC19-208ENST00000497842 PTPRTO14522 1441 aa41.51■■■■■ 4.24
TTC19-208ENST00000497842 ZMYM3Q14202 1370 aa41.5■■■■■ 4.23
TTC19-208ENST00000497842 TRPM2O94759 1503 aa41.49■■■■■ 4.23
TTC19-208ENST00000497842 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.49■■■■■ 4.23
TTC19-208ENST00000497842 PLA2R1Q13018 1463 aa41.49■■■■■ 4.23
TTC19-208ENST00000497842 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.46■■■■■ 4.23
TTC19-208ENST00000497842 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.43■■■■■ 4.22
TTC19-208ENST00000497842 C3P01024 1663 aa41.43■■■■■ 4.22
TTC19-208ENST00000497842 NEUROD1Q13562 356 aa41.42■■■■■ 4.22
TTC19-208ENST00000497842 NOS1P29475 1434 aa41.42■■■■■ 4.22
TTC19-208ENST00000497842 ERVK-7P63135 1459 aa41.4■■■■■ 4.22
TTC19-208ENST00000497842 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
TTC19-208ENST00000497842 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
TTC19-208ENST00000497842 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.36■■■■■ 4.21
TTC19-208ENST00000497842 CLTCL1P53675 1640 aa41.35■■■■■ 4.21
TTC19-208ENST00000497842 SYNMO15061 1565 aa41.35■■■■■ 4.21
TTC19-208ENST00000497842 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
TTC19-208ENST00000497842 KIF1BO60333 1816 aa41.29■■■■■ 4.2
TTC19-208ENST00000497842 PIK3C2BO00750 1634 aa41.29■■■■■ 4.2
TTC19-208ENST00000497842 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.27■■■■■ 4.2
TTC19-208ENST00000497842 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.25■■■■■ 4.19
TTC19-208ENST00000497842 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.25■■■■■ 4.19
TTC19-208ENST00000497842 TONSLQ96HA7 1378 aa41.24■■■■■ 4.19
TTC19-208ENST00000497842 TNRQ92752 1358 aa41.22■■■■■ 4.19
TTC19-208ENST00000497842 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.22■■■■■ 4.19
TTC19-208ENST00000497842 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.19■■■■■ 4.18
TTC19-208ENST00000497842 STRCQ7RTU9 1775 aa41.16■■■■■ 4.18
TTC19-208ENST00000497842 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.16■■■■■ 4.18
TTC19-208ENST00000497842 IDI1Q13907 227 aa41.14■■■■■ 4.18
TTC19-208ENST00000497842 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.13■■■■■ 4.17
TTC19-208ENST00000497842 ADGRB3O60242 1522 aa41.1■■■■■ 4.17
TTC19-208ENST00000497842 NLRP1Q9C000 1473 aa41.08■■■■■ 4.17
TTC19-208ENST00000497842 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
TTC19-208ENST00000497842 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
TTC19-208ENST00000497842 RGL3Q3MIN7 710 aa41.06■■■■■ 4.16
TTC19-208ENST00000497842 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.06■■■■■ 4.16
TTC19-208ENST00000497842 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.06■■■■■ 4.16
TTC19-208ENST00000497842 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.05■■■■■ 4.16
TTC19-208ENST00000497842 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
TTC19-208ENST00000497842 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.03■■■■■ 4.16
TTC19-208ENST00000497842 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.01■■■■■ 4.16
TTC19-208ENST00000497842 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.01■■■■■ 4.15
TTC19-208ENST00000497842 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
TTC19-208ENST00000497842 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.96■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms