RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 C3P01024 1663 aa27.33■■□□□ 1.97
UBE2Q1-207ENST00000497453 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZMYM3Q14202 1370 aa27.33■■□□□ 1.97
UBE2Q1-207ENST00000497453 ERBINQ96RT1 1412 aa27.33■■□□□ 1.96
UBE2Q1-207ENST00000497453 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.96
UBE2Q1-207ENST00000497453 MROH2AA6NES4 1674 aa27.31■■□□□ 1.96
UBE2Q1-207ENST00000497453 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
UBE2Q1-207ENST00000497453 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.28■■□□□ 1.96
UBE2Q1-207ENST00000497453 ITGAEP38570 1179 aa27.28■■□□□ 1.96
UBE2Q1-207ENST00000497453 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.27■■□□□ 1.96
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.27■■□□□ 1.96
UBE2Q1-207ENST00000497453 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.27■■□□□ 1.96
UBE2Q1-207ENST00000497453 ROCK1Q13464 1354 aa27.23■■□□□ 1.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.23■■□□□ 1.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 NPATQ14207 1427 aa27.22■■□□□ 1.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.19■■□□□ 1.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABCC3O15438 1527 aa27.19■■□□□ 1.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.18■■□□□ 1.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.18■■□□□ 1.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.943e-7■■■□□ 15.3
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UBE2Q1-207ENST00000497453 PZPP20742 1482 aa27.15■■□□□ 1.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 DEPDC5O75140 1603 aa27.15■■□□□ 1.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 KANK1Q14678 1352 aa27.12■■□□□ 1.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 CEP152O94986 1710 aa27.1■■□□□ 1.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.07■■□□□ 1.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 TNRQ92752 1358 aa27.07■■□□□ 1.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.06■■□□□ 1.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.05■■□□□ 1.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.04■■□□□ 1.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.04■■□□□ 1.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 ERVK-7P63135 1459 aa27.01■■□□□ 1.91
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UBE2Q1-207ENST00000497453 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27■■□□□ 1.91
UBE2Q1-207ENST00000497453 NAIPQ13075 1403 aa26.99■■□□□ 1.91
UBE2Q1-207ENST00000497453 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
UBE2Q1-207ENST00000497453 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.98■■□□□ 1.91
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
UBE2Q1-207ENST00000497453 HFM1A2PYH4 1435 aa26.95■■□□□ 1.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.95■■□□□ 1.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 NLRP1Q9C000 1473 aa26.94■■□□□ 1.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 NUP155O75694 1391 aa26.93■■□□□ 1.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.92■■□□□ 1.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 STRCQ7RTU9 1775 aa26.89■■□□□ 1.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 TET3O43151 1660 aa26.89■■□□□ 1.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.88■■□□□ 1.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
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UBE2Q1-207ENST00000497453 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.85■■□□□ 1.89
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UBE2Q1-207ENST00000497453 IDI1Q13907 227 aa26.79■■□□□ 1.88
UBE2Q1-207ENST00000497453 PTPRTO14522 1441 aa26.79■■□□□ 1.88
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRIM52Q96A61 297 aa26.78■■□□□ 1.88
UBE2Q1-207ENST00000497453 E9PCH4 1651 aa26.78■■□□□ 1.88
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.76■■□□□ 1.87
UBE2Q1-207ENST00000497453 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.74■■□□□ 1.87
UBE2Q1-207ENST00000497453 PIK3C2BO00750 1634 aa26.74■■□□□ 1.87
UBE2Q1-207ENST00000497453 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.73■■□□□ 1.87
UBE2Q1-207ENST00000497453 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2Q1-207ENST00000497453 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2Q1-207ENST00000497453 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADGRB3O60242 1522 aa26.66■■□□□ 1.86
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UBE2Q1-207ENST00000497453 SLIT1O75093 1534 aa26.65■■□□□ 1.86
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UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.64■■□□□ 1.86
UBE2Q1-207ENST00000497453 MED14O60244 1454 aa26.63■■□□□ 1.85
UBE2Q1-207ENST00000497453 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.62■■□□□ 1.85
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UBE2Q1-207ENST00000497453 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2Q1-207ENST00000497453 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
UBE2Q1-207ENST00000497453 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
UBE2Q1-207ENST00000497453 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.6■■□□□ 1.85
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UBE2Q1-207ENST00000497453 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.57■■□□□ 1.84
UBE2Q1-207ENST00000497453 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.57■■□□□ 1.84
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRPM2O94759 1503 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
UBE2Q1-207ENST00000497453 IQGAP1P46940 1657 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2Q1-207ENST00000497453 FOXD1Q16676 465 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2Q1-207ENST00000497453 CERKQ8TCT0 537 aa26.53■■□□□ 1.84
UBE2Q1-207ENST00000497453 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.53■■□□□ 1.84
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZFYVE9O95405 1425 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2Q1-207ENST00000497453 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2Q1-207ENST00000497453 CLTCL1P53675 1640 aa26.5■■□□□ 1.83
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