RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495220.5

ARRDC1-211, Transcript of arrestin domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARRDC1, Length 747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-211ENST00000495220 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
ARRDC1-211ENST00000495220 MLECQ14165 292 aa30.43■■■□□ 2.46
ARRDC1-211ENST00000495220 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.43■■■□□ 2.46
ARRDC1-211ENST00000495220 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.4■■■□□ 2.46
ARRDC1-211ENST00000495220 GGT6Q6P531 493 aa30.39■■■□□ 2.46
ARRDC1-211ENST00000495220 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.38■■■□□ 2.45
ARRDC1-211ENST00000495220 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
ARRDC1-211ENST00000495220 DEPDC5O75140 1603 aa30.33■■■□□ 2.45
ARRDC1-211ENST00000495220 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.32■■■□□ 2.44
ARRDC1-211ENST00000495220 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.32■■■□□ 2.44
ARRDC1-211ENST00000495220 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.31■■■□□ 2.44
ARRDC1-211ENST00000495220 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
ARRDC1-211ENST00000495220 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.29■■■□□ 2.44
ARRDC1-211ENST00000495220 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.29■■■□□ 2.44
ARRDC1-211ENST00000495220 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
ARRDC1-211ENST00000495220 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
ARRDC1-211ENST00000495220 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.29■■■□□ 2.44
ARRDC1-211ENST00000495220 KANK1Q14678 1352 aa30.28■■■□□ 2.44
ARRDC1-211ENST00000495220 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.26■■■□□ 2.43
ARRDC1-211ENST00000495220 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.25■■■□□ 2.43
ARRDC1-211ENST00000495220 UNC13BO14795 1591 aa30.25■■■□□ 2.43
ARRDC1-211ENST00000495220 HRCP23327 699 aa30.24■■■□□ 2.43
ARRDC1-211ENST00000495220 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.24■■■□□ 2.439e-8■■■■□ 24.5
ARRDC1-211ENST00000495220 HSPA2P54652 639 aa30.23■■■□□ 2.43
ARRDC1-211ENST00000495220 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.23■■■□□ 2.43
ARRDC1-211ENST00000495220 FBXO41Q8TF61 875 aa30.21■■■□□ 2.43
ARRDC1-211ENST00000495220 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
ARRDC1-211ENST00000495220 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.19■■■□□ 2.42
ARRDC1-211ENST00000495220 NUP155O75694 1391 aa30.18■■■□□ 2.42
ARRDC1-211ENST00000495220 ABCC3O15438 1527 aa30.18■■■□□ 2.42
ARRDC1-211ENST00000495220 MROH2AA6NES4 1674 aa30.18■■■□□ 2.42
ARRDC1-211ENST00000495220 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
ARRDC1-211ENST00000495220 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.17■■■□□ 2.42
ARRDC1-211ENST00000495220 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
ARRDC1-211ENST00000495220 ZMYM3Q14202 1370 aa30.15■■■□□ 2.42
ARRDC1-211ENST00000495220 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
ARRDC1-211ENST00000495220 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.14■■■□□ 2.41
ARRDC1-211ENST00000495220 TRIM52Q96A61 297 aa30.13■■■□□ 2.41
ARRDC1-211ENST00000495220 CEP152O94986 1710 aa30.11■■■□□ 2.41
ARRDC1-211ENST00000495220 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.1■■■□□ 2.41
ARRDC1-211ENST00000495220 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.07■■■□□ 2.4
ARRDC1-211ENST00000495220 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.07■■■□□ 2.4
ARRDC1-211ENST00000495220 TET3O43151 1660 aa30.07■■■□□ 2.4
ARRDC1-211ENST00000495220 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.07■■■□□ 2.4
ARRDC1-211ENST00000495220 C3P01024 1663 aa30.06■■■□□ 2.4
ARRDC1-211ENST00000495220 PZPP20742 1482 aa30.06■■■□□ 2.4
ARRDC1-211ENST00000495220 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.04■■■□□ 2.4
ARRDC1-211ENST00000495220 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.04■■■□□ 2.4
ARRDC1-211ENST00000495220 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.02■■■□□ 2.4
ARRDC1-211ENST00000495220 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
ARRDC1-211ENST00000495220 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
ARRDC1-211ENST00000495220 NPATQ14207 1427 aa30.01■■■□□ 2.39
ARRDC1-211ENST00000495220 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.98■■■□□ 2.39
ARRDC1-211ENST00000495220 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
ARRDC1-211ENST00000495220 E9PCH4 1651 aa29.94■■■□□ 2.38
ARRDC1-211ENST00000495220 PKD2Q13563 968 aa29.93■■■□□ 2.38
ARRDC1-211ENST00000495220 CERKQ8TCT0 537 aa29.93■■■□□ 2.38
ARRDC1-211ENST00000495220 ERVK-7P63135 1459 aa29.93■■■□□ 2.38
ARRDC1-211ENST00000495220 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.92■■■□□ 2.38
ARRDC1-211ENST00000495220 NOS1P29475 1434 aa29.9■■■□□ 2.38
ARRDC1-211ENST00000495220 TNRQ92752 1358 aa29.89■■■□□ 2.37
ARRDC1-211ENST00000495220 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
ARRDC1-211ENST00000495220 PTPRTO14522 1441 aa29.85■■■□□ 2.37
ARRDC1-211ENST00000495220 STRCQ7RTU9 1775 aa29.85■■■□□ 2.37
ARRDC1-211ENST00000495220 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.81■■■□□ 2.36
ARRDC1-211ENST00000495220 NLRP1Q9C000 1473 aa29.8■■■□□ 2.36
ARRDC1-211ENST00000495220 SYNMO15061 1565 aa29.78■■■□□ 2.36
ARRDC1-211ENST00000495220 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.78■■■□□ 2.36
ARRDC1-211ENST00000495220 FOXD1Q16676 465 aa29.77■■■□□ 2.36
ARRDC1-211ENST00000495220 PLA2R1Q13018 1463 aa29.75■■■□□ 2.35
ARRDC1-211ENST00000495220 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.75■■■□□ 2.35
ARRDC1-211ENST00000495220 TRPM2O94759 1503 aa29.75■■■□□ 2.35
ARRDC1-211ENST00000495220 IDI1Q13907 227 aa29.74■■■□□ 2.35
ARRDC1-211ENST00000495220 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.73■■■□□ 2.35
ARRDC1-211ENST00000495220 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
ARRDC1-211ENST00000495220 PIK3C2BO00750 1634 aa29.71■■■□□ 2.35
ARRDC1-211ENST00000495220 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
ARRDC1-211ENST00000495220 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
ARRDC1-211ENST00000495220 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.69■■■□□ 2.34
ARRDC1-211ENST00000495220 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
ARRDC1-211ENST00000495220 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.64■■■□□ 2.34
ARRDC1-211ENST00000495220 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.64■■■□□ 2.34
ARRDC1-211ENST00000495220 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
ARRDC1-211ENST00000495220 CLTCL1P53675 1640 aa29.63■■■□□ 2.33
ARRDC1-211ENST00000495220 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.62■■■□□ 2.33
ARRDC1-211ENST00000495220 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.59■■■□□ 2.33
ARRDC1-211ENST00000495220 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.59■■■□□ 2.33
ARRDC1-211ENST00000495220 ADGRB3O60242 1522 aa29.59■■■□□ 2.33
ARRDC1-211ENST00000495220 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.57■■■□□ 2.32
ARRDC1-211ENST00000495220 KIF1BO60333 1816 aa29.55■■■□□ 2.32
ARRDC1-211ENST00000495220 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
ARRDC1-211ENST00000495220 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.54■■■□□ 2.32
ARRDC1-211ENST00000495220 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.52■■■□□ 2.32
ARRDC1-211ENST00000495220 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.51■■■□□ 2.31
ARRDC1-211ENST00000495220 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.5■■■□□ 2.31
ARRDC1-211ENST00000495220 SLIT1O75093 1534 aa29.5■■■□□ 2.31
ARRDC1-211ENST00000495220 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.49■■■□□ 2.31
ARRDC1-211ENST00000495220 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.48■■■□□ 2.31
ARRDC1-211ENST00000495220 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.48■■■□□ 2.31
ARRDC1-211ENST00000495220 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
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