RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP10B	O94823	1461 aa		8.73	□□□□□ -1.01
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		8.73	□□□□□ -1.01
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCC2	Q92887	1545 aa		8.73	□□□□□ -1.01
C4BPB-208	ENST00000492730	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	8.72	□□□□□ -1.01
C4BPB-208	ENST00000492730	ERBB3	P21860	1342 aa		8.72	□□□□□ -1.01
C4BPB-208	ENST00000492730	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		8.72	□□□□□ -1.01
C4BPB-208	ENST00000492730	FMN1	Q68DA7	1419 aa		8.71	□□□□□ -1.01
C4BPB-208	ENST00000492730	ASXL2	Q76L83	1435 aa		8.71	□□□□□ -1.01
C4BPB-208	ENST00000492730	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		8.71	□□□□□ -1.01
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCA8	O94911	1581 aa		8.71	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	8.71	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	8.71	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		8.7	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	8.7	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	8.7	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		8.7	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		8.69	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		8.68	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	8.68	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		8.67	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	8.66	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		8.66	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		8.66	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		8.66	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	MAPKBP1	O60336	1514 aa		8.65	□□□□□ -1.02
C4BPB-208	ENST00000492730	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	8.64	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	8.64	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		8.64	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	PLEKHG5	O94827	1062 aa		8.63	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	ITGAE	P38570	1179 aa		8.63	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	8.62	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	CD109	Q6YHK3	1445 aa		8.62	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		8.61	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	PTPRK	Q15262	1439 aa		8.61	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	8.6	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		8.6	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	HECW1	Q76N89	1606 aa		8.59	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	PROM2	Q8N271	834 aa		8.59	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	8.59	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		8.59	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		8.59	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	DIP2B	Q9P265	1576 aa		8.59	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		8.59	□□□□□ -1.03
C4BPB-208	ENST00000492730	NCOA2	Q15596	1464 aa		8.58	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	8.58	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	NUBP1	P53384	320 aa		8.58	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	8.58	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		8.58	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	8.58	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	MIER1	Q8N108	512 aa		8.58	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		8.57	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	GLI2	P10070	1586 aa		8.57	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		8.57	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		8.57	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	TSPOAP1	O95153	1857 aa		8.57	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	8.57	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		8.56	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	RAPGEF3	O95398	923 aa		8.56	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	DOK7	Q18PE1	504 aa		8.56	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	8.56	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	8.56	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		8.54	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	8.54	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		8.54	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	PLCH2	O75038	1416 aa		8.54	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	8.53	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	8.53	□□□□□ -1.04
C4BPB-208	ENST00000492730	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	8.52	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		8.52	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	8.52	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		8.52	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	AFAP1	Q8N556	730 aa		8.52	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		8.52	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	HCST	Q9UBK5	93 aa		8.52	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	KDM6B	O15054	1643 aa		8.51	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		8.51	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	AKNA	Q7Z591	1439 aa		8.51	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	KIF14	Q15058	1648 aa		8.51	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		8.51	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	FKBP8	Q14318	412 aa		8.5	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	8.5	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	FANCA	O15360	1455 aa		8.5	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	8.49	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	NAIP	Q13075	1403 aa		8.49	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		8.49	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	8.49	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		8.48	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	HFM1	A2PYH4	1435 aa		8.48	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	RGS20	O76081	388 aa		8.48	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	8.48	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	8.48	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	8.48	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		8.48	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		8.47	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	NEO1	Q92859	1461 aa		8.47	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	RIMBP2	O15034	1052 aa		8.47	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM212A	Q96EL1	285 aa		8.47	□□□□□ -1.05
C4BPB-208	ENST00000492730	NEUROD1	Q13562	356 aa		8.46	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	8.46	□□□□□ -1.06
C4BPB-208	ENST00000492730	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		8.46	□□□□□ -1.06

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