RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491037.1

GAPDHP22-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 22, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP22, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP22-201ENST00000491037 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
GAPDHP22-201ENST00000491037 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
GAPDHP22-201ENST00000491037 DEPDC5O75140 1603 aa13.13□□□□□ -0.31
GAPDHP22-201ENST00000491037 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.13□□□□□ -0.31
GAPDHP22-201ENST00000491037 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.13□□□□□ -0.31
GAPDHP22-201ENST00000491037 NCOA1Q15788 1441 aa13.12□□□□□ -0.31
GAPDHP22-201ENST00000491037 LMTK3Q96Q04 1460 aa13.11□□□□□ -0.31
GAPDHP22-201ENST00000491037 NPATQ14207 1427 aa13.11□□□□□ -0.31
GAPDHP22-201ENST00000491037 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
GAPDHP22-201ENST00000491037 ROCK1Q13464 1354 aa13.09□□□□□ -0.31
GAPDHP22-201ENST00000491037 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
GAPDHP22-201ENST00000491037 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
GAPDHP22-201ENST00000491037 ABCC3O15438 1527 aa13.08□□□□□ -0.31
GAPDHP22-201ENST00000491037 KIF3BO15066 747 aa13.08□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 PTPRKQ15262 1439 aa13.07□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 GGT6Q6P531 493 aa13.07□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 PZPP20742 1482 aa13.07□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 ZMYM3Q14202 1370 aa13.07□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.06□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.06□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa13.05□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.05□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa13.05□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 CEP152O94986 1710 aa13.05□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.05□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 UNC13BO14795 1591 aa13.04□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.03□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.02□□□□□ -0.32
GAPDHP22-201ENST00000491037 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.02□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa13.02□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.02□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.01□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 KANK1Q14678 1352 aa13□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 ERVK-7P63135 1459 aa12.98□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12.98□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 TET3O43151 1660 aa12.98□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 IQGAP3Q86VI3 1631 aa12.98□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 NLRP1Q9C000 1473 aa12.97□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 A2ML1A8K2U0 1454 aa12.97□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 HFM1A2PYH4 1435 aa12.96□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 TNRQ92752 1358 aa12.96□□□□□ -0.33
GAPDHP22-201ENST00000491037 PLA2R1Q13018 1463 aa12.96□□□□□ -0.34
GAPDHP22-201ENST00000491037 NAIPQ13075 1403 aa12.95□□□□□ -0.34
GAPDHP22-201ENST00000491037 STRCQ7RTU9 1775 aa12.93□□□□□ -0.34
GAPDHP22-201ENST00000491037 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
GAPDHP22-201ENST00000491037 ITGAEP38570 1179 aa12.92□□□□□ -0.34
GAPDHP22-201ENST00000491037 HSPA2P54652 639 aa12.91□□□□□ -0.34
GAPDHP22-201ENST00000491037 SYNMO15061 1565 aa12.9□□□□□ -0.34
GAPDHP22-201ENST00000491037 UGGT1Q9NYU2 1555 aa12.9□□□□□ -0.34
GAPDHP22-201ENST00000491037 NOS1P29475 1434 aa12.9□□□□□ -0.34
GAPDHP22-201ENST00000491037 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
GAPDHP22-201ENST00000491037 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
GAPDHP22-201ENST00000491037 E9PCH4 1651 aa12.89□□□□□ -0.35
GAPDHP22-201ENST00000491037 UBR1Q8IWV7 1749 aa12.89□□□□□ -0.35
GAPDHP22-201ENST00000491037 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
GAPDHP22-201ENST00000491037 PTPRTO14522 1441 aa12.88□□□□□ -0.35
GAPDHP22-201ENST00000491037 PIK3C2BO00750 1634 aa12.87□□□□□ -0.35
GAPDHP22-201ENST00000491037 NUP155O75694 1391 aa12.86□□□□□ -0.35
GAPDHP22-201ENST00000491037 ADGRB3O60242 1522 aa12.86□□□□□ -0.35
GAPDHP22-201ENST00000491037 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
GAPDHP22-201ENST00000491037 SLIT1O75093 1534 aa12.85□□□□□ -0.35
GAPDHP22-201ENST00000491037 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.85□□□□□ -0.35
GAPDHP22-201ENST00000491037 NEURL4Q96JN8 1562 aa12.85□□□□□ -0.35
GAPDHP22-201ENST00000491037 PKD2Q13563 968 aa12.84□□□□□ -0.35
GAPDHP22-201ENST00000491037 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa12.84□□□□□ -0.35
GAPDHP22-201ENST00000491037 ARHGAP23Q9P227 1491 aa12.84□□□□□ -0.35
GAPDHP22-201ENST00000491037 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
GAPDHP22-201ENST00000491037 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
GAPDHP22-201ENST00000491037 MED14O60244 1454 aa12.82□□□□□ -0.36
GAPDHP22-201ENST00000491037 SLC52A1Q9NWF4 448 aa12.81□□□□□ -0.36
GAPDHP22-201ENST00000491037 TRPM2O94759 1503 aa12.81□□□□□ -0.36
GAPDHP22-201ENST00000491037 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa12.8□□□□□ -0.36
GAPDHP22-201ENST00000491037 IQGAP1P46940 1657 aa12.8□□□□□ -0.36
GAPDHP22-201ENST00000491037 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
GAPDHP22-201ENST00000491037 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.78□□□□□ -0.36
GAPDHP22-201ENST00000491037 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.77□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 IDI1Q13907 227 aa12.76□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 ANKLE2Q86XL3 938 aa12.76□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 MYO5BQ9ULV0 1848 aa12.76□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 CLTCL1P53675 1640 aa12.75□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 LTBP4Q8N2S1 1624 aa12.75□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.75□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 ZFYVE9O95405 1425 aa12.74□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 IQSEC2Q5JU85 1478 aa12.73□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.73□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 TRIM52Q96A61 297 aa12.72□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.72□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 KIF1BO60333 1816 aa12.72□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 EID1Q9Y6B2 187 aa12.71□□□□□ -0.37
GAPDHP22-201ENST00000491037 CPS1P31327 1500 aa12.71□□□□□ -0.38
GAPDHP22-201ENST00000491037 HRCP23327 699 aa12.7□□□□□ -0.38
GAPDHP22-201ENST00000491037 RIMS2Q9UQ26 1411 aa12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms