RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488199.5

HFE-214, Transcript of homeostatic iron regulator, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HFE, Length 781 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFE-214ENST00000488199 ZMYM3Q14202 1370 aa24.93■■□□□ 1.58
HFE-214ENST00000488199 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.92■■□□□ 1.58
HFE-214ENST00000488199 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
HFE-214ENST00000488199 PTPRKQ15262 1439 aa24.92■■□□□ 1.58
HFE-214ENST00000488199 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.89■■□□□ 1.57
HFE-214ENST00000488199 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.87■■□□□ 1.57
HFE-214ENST00000488199 ADGRL2O95490 1459 aa24.87■■□□□ 1.57
HFE-214ENST00000488199 NCOA1Q15788 1441 aa24.86■■□□□ 1.57
HFE-214ENST00000488199 CEP152O94986 1710 aa24.86■■□□□ 1.57
HFE-214ENST00000488199 ITGAEP38570 1179 aa24.85■■□□□ 1.57
HFE-214ENST00000488199 ERBINQ96RT1 1412 aa24.85■■□□□ 1.57
HFE-214ENST00000488199 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.84■■□□□ 1.57
HFE-214ENST00000488199 ABCC3O15438 1527 aa24.83■■□□□ 1.57
HFE-214ENST00000488199 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.82■■□□□ 1.56
HFE-214ENST00000488199 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.81■■□□□ 1.56
HFE-214ENST00000488199 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.8■■□□□ 1.56
HFE-214ENST00000488199 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.8■■□□□ 1.56
HFE-214ENST00000488199 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HFE-214ENST00000488199 NPATQ14207 1427 aa24.79■■□□□ 1.56
HFE-214ENST00000488199 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
HFE-214ENST00000488199 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
HFE-214ENST00000488199 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
HFE-214ENST00000488199 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
HFE-214ENST00000488199 DEPDC5O75140 1603 aa24.79■■□□□ 1.56
HFE-214ENST00000488199 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.77■■□□□ 1.56
HFE-214ENST00000488199 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
HFE-214ENST00000488199 PZPP20742 1482 aa24.77■■□□□ 1.56
HFE-214ENST00000488199 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
HFE-214ENST00000488199 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.73■■□□□ 1.55
HFE-214ENST00000488199 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
HFE-214ENST00000488199 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
HFE-214ENST00000488199 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
HFE-214ENST00000488199 STRCQ7RTU9 1775 aa24.7■■□□□ 1.55
HFE-214ENST00000488199 TNRQ92752 1358 aa24.69■■□□□ 1.54
HFE-214ENST00000488199 ROCK1Q13464 1354 aa24.68■■□□□ 1.54
HFE-214ENST00000488199 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.68■■□□□ 1.54
HFE-214ENST00000488199 ERVK-7P63135 1459 aa24.66■■□□□ 1.54
HFE-214ENST00000488199 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.65■■□□□ 1.54
HFE-214ENST00000488199 UNC13BO14795 1591 aa24.63■■□□□ 1.53
HFE-214ENST00000488199 KANK1Q14678 1352 aa24.63■■□□□ 1.53
HFE-214ENST00000488199 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.62■■□□□ 1.53
HFE-214ENST00000488199 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.61■■□□□ 1.53
HFE-214ENST00000488199 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.59■■□□□ 1.53
HFE-214ENST00000488199 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.58■■□□□ 1.53
HFE-214ENST00000488199 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.56■■□□□ 1.52
HFE-214ENST00000488199 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.56■■□□□ 1.52
HFE-214ENST00000488199 TET3O43151 1660 aa24.54■■□□□ 1.52
HFE-214ENST00000488199 NLRP1Q9C000 1473 aa24.54■■□□□ 1.52
HFE-214ENST00000488199 NAIPQ13075 1403 aa24.53■■□□□ 1.52
HFE-214ENST00000488199 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.53■■□□□ 1.52
HFE-214ENST00000488199 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.53■■□□□ 1.52
HFE-214ENST00000488199 SYNMO15061 1565 aa24.52■■□□□ 1.52
HFE-214ENST00000488199 PLA2R1Q13018 1463 aa24.51■■□□□ 1.51
HFE-214ENST00000488199 E9PCH4 1651 aa24.5■■□□□ 1.51
HFE-214ENST00000488199 PIK3C2BO00750 1634 aa24.49■■□□□ 1.51
HFE-214ENST00000488199 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.49■■□□□ 1.51
HFE-214ENST00000488199 NUP155O75694 1391 aa24.48■■□□□ 1.51
HFE-214ENST00000488199 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HFE-214ENST00000488199 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.46■■□□□ 1.51
HFE-214ENST00000488199 NOS1P29475 1434 aa24.46■■□□□ 1.51
HFE-214ENST00000488199 HFM1A2PYH4 1435 aa24.45■■□□□ 1.51
HFE-214ENST00000488199 PTPRTO14522 1441 aa24.45■■□□□ 1.51
HFE-214ENST00000488199 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
HFE-214ENST00000488199 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.4■■□□□ 1.5
HFE-214ENST00000488199 PKD2Q13563 968 aa24.39■■□□□ 1.49
HFE-214ENST00000488199 IDI1Q13907 227 aa24.39■■□□□ 1.49
HFE-214ENST00000488199 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
HFE-214ENST00000488199 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.36■■□□□ 1.49
HFE-214ENST00000488199 ADGRB3O60242 1522 aa24.35■■□□□ 1.49
HFE-214ENST00000488199 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.33■■□□□ 1.49
HFE-214ENST00000488199 TRIM52Q96A61 297 aa24.33■■□□□ 1.49
HFE-214ENST00000488199 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.32■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.32■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.32■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.32■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 SLIT1O75093 1534 aa24.31■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 IQGAP1P46940 1657 aa24.31■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 LTKP29376 864 aa24.3■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.28■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 MED14O60244 1454 aa24.28■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 CERKQ8TCT0 537 aa24.28■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.28■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.27■■□□□ 1.48
HFE-214ENST00000488199 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.26■■□□□ 1.47
HFE-214ENST00000488199 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
HFE-214ENST00000488199 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
HFE-214ENST00000488199 CLTCL1P53675 1640 aa24.23■■□□□ 1.47
HFE-214ENST00000488199 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.22■■□□□ 1.47
HFE-214ENST00000488199 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
HFE-214ENST00000488199 FOXD1Q16676 465 aa24.2■■□□□ 1.46
HFE-214ENST00000488199 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.19■■□□□ 1.46
HFE-214ENST00000488199 TRPM2O94759 1503 aa24.19■■□□□ 1.46
HFE-214ENST00000488199 ZFYVE9O95405 1425 aa24.18■■□□□ 1.46
HFE-214ENST00000488199 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.18■■□□□ 1.46
HFE-214ENST00000488199 EID1Q9Y6B2 187 aa24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms