RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488161.1

C7orf49-212, humanhuman

TSL 3

Gene C7orf49, Length 124 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-212ENST00000488161 KDM5DQ9BY66 1539 aa10.26□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 ZMYM3Q14202 1370 aa10.26□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 KIF15Q9NS87 1388 aa10.26□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 MYO3AQ8NEV4 1616 aa10.25□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 DUOX2Q9NRD8 1548 aa10.25□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10.25□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa10.24□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 PTPRKQ15262 1439 aa10.24□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 ABCC3O15438 1527 aa10.23□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 STRCQ7RTU9 1775 aa10.23□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 NPATQ14207 1427 aa10.22□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 ADGRL2O95490 1459 aa10.22□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 DEPDC5O75140 1603 aa10.22□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa10.22□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
C7orf49-212ENST00000488161 NCOA1Q15788 1441 aa10.21□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 ERBINQ96RT1 1412 aa10.21□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 PZPP20742 1482 aa10.21□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 FAM135AQ9P2D6 1515 aa10.21□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa10.2□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa10.19□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 ITGAEP38570 1179 aa10.19□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.18□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa10.17□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 ERVK-7P63135 1459 aa10.17□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 TNRQ92752 1358 aa10.16□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 VWDEQ8N2E2 1590 aa10.16□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.16□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 A2ML1A8K2U0 1454 aa10.15□□□□□ -0.78
C7orf49-212ENST00000488161 UNC13BO14795 1591 aa10.14□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 EFCAB6Q5THR3 1501 aa10.12□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 LMTK2Q8IWU2 1503 aa10.12□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.12□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 SYNMO15061 1565 aa10.12□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.12□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 ROCK1Q13464 1354 aa10.12□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 PLA2R1Q13018 1463 aa10.11□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 UBR1Q8IWV7 1749 aa10.11□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 UGGT1Q9NYU2 1555 aa10.11□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 GCC2Q8IWJ2 1684 aa10.11□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 KANK1Q14678 1352 aa10.11□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 PIK3C2BO00750 1634 aa10.11□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 NLRP1Q9C000 1473 aa10.1□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa10.1□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 TET3O43151 1660 aa10.1□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.1□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 E9PCH4 1651 aa10.09□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 PTPRTO14522 1441 aa10.09□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
C7orf49-212ENST00000488161 MYO5BQ9ULV0 1848 aa10.07□□□□□ -0.8
C7orf49-212ENST00000488161 LTBP4Q8N2S1 1624 aa10.07□□□□□ -0.8
C7orf49-212ENST00000488161 NOS1P29475 1434 aa10.07□□□□□ -0.8
C7orf49-212ENST00000488161 NAIPQ13075 1403 aa10.07□□□□□ -0.8
C7orf49-212ENST00000488161 IQGAP1P46940 1657 aa10.05□□□□□ -0.8
C7orf49-212ENST00000488161 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
C7orf49-212ENST00000488161 NUP155O75694 1391 aa10.04□□□□□ -0.8
C7orf49-212ENST00000488161 ADGRB3O60242 1522 aa10.04□□□□□ -0.8
C7orf49-212ENST00000488161 PKD2Q13563 968 aa10.04□□□□□ -0.8
C7orf49-212ENST00000488161 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.04□□□□□ -0.8
C7orf49-212ENST00000488161 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
C7orf49-212ENST00000488161 CERKQ8TCT0 537 aa10.03□□□□□ -0.8
C7orf49-212ENST00000488161 ARHGAP23Q9P227 1491 aa10.03□□□□□ -0.8
C7orf49-212ENST00000488161 SLIT1O75093 1534 aa10.02□□□□□ -0.8
C7orf49-212ENST00000488161 HFM1A2PYH4 1435 aa10.02□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 IDI1Q13907 227 aa10.02□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa10.02□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 STRCP1A6NGW2 1772 aa10.01□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 LTKP29376 864 aa10.01□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 ANKLE2Q86XL3 938 aa10.01□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 MED14O60244 1454 aa10.01□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa10□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 FBXO41Q8TF61 875 aa9.99□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 STAG3Q9UJ98 1225 aa9.99□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 CLTCL1P53675 1640 aa9.99□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.99□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.97□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 TRIM52Q96A61 297 aa9.97□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 ZFYVE9O95405 1425 aa9.97□□□□□ -0.81
C7orf49-212ENST00000488161 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
C7orf49-212ENST00000488161 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
C7orf49-212ENST00000488161 SLC52A1Q9NWF4 448 aa9.95□□□□□ -0.82
C7orf49-212ENST00000488161 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.95□□□□□ -0.82
C7orf49-212ENST00000488161 TRPM2O94759 1503 aa9.95□□□□□ -0.82
C7orf49-212ENST00000488161 CPS1P31327 1500 aa9.94□□□□□ -0.82
C7orf49-212ENST00000488161 FOXD1Q16676 465 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms